Numbers

Bibliography of the person, including all types of documents, not only theses.

PhD theses (3)

1. Miha Moškon: Modeli in metrike dinamike preklopa v enostavnih bioloških sistemih za potrebe računalniških struktur prihodnosti
2. Mattia Petroni: Računalniško podprta metodologija za analizo občutljivosti večnivojskih stohastičnih modelov bioloških preklopnih gradnikov
3. Žiga Pušnik: Kontekstno specifična inferenca Boolovih opisov gensko regulatornih omrežij

MSc theses (14)

1. Beno Šircelj: Modeling of Production Processes with Mathematical Logic
2. Simon Arbajter: Analiza toka in načina hrambe podatkov o obravnavah pacientov v Urgentnem kirurškem bloku UKC Ljubljana
3. Silvo Gazvoda: Pregled orodij za agentno modeliranje bioloških sistemov in njihova uporaba na modelu večceličnega biološkega oscilatorja
4. Žiga Pušnik: Analiza prostora dopustnih rešitev v visoko-dimenzionalnih dinamičnih modelih bioloških sistemov
5. Roman Komac: Računalniško načrtovanje večceličnih sinhronskih procesnih struktur
6. Nina Velikajne: Pregled in uporaba metod za populacijsko analizo ritmičnosti
7. Jurij Nastran: Integration and analysis of scRNAseq data using genome-scale metabolic models
8. Živa Škof: Pristopi za avtomatizirano analizo metabolnih modelov na nivoju genoma
9. Jaka Bernard: Pregled, implementacija in ovrednotenje metod za predprocesiranje ritmičnih podatkov
10. Urban Kocmut: Avtomatizirano določanje optimalnega števila komponent pri analizi ritmičnih podatkov z modelom cosinor
11. Milenko Obradović: Analysis and design of gene regulatory networks as sequential biological circuits
12. Aljaž Grdadolnik: Evaluating Resilience and Performance of Aggregate Programming in Robot Swarms
13. Ana Jerina: Techno-economic analysis of lactic acid production from methanol
14. Andrej Jočić: Računanje z izpodrivanjem verig DNA

BSc theses (36)

1. OŽBOLT MENEGATTI: Vzorčni primeri rešitev za RasberryPi
2. Silvo Gazvoda: Analiza delovanja računalniških omrežij s programskim orodjem CACTI
3. MATJAŽ GULJA: Analiza računalniškega omrežja na primeru Dijaškega doma Tabor
4. JURE JANŠA: Merjenje zmogljivosti in optimizacija navideznih naprav DataPower
5. NIK MIŠKOVIČ: Analiza storitve FlipIT z vidika časa dostopa
6. NEJC POLJANŠEK: Vzpostavitev spletnega vmesnika za prikaz tenziomiografskih meritev
7. Jakob Dorn: Napadi DMA na operacijske sisteme Windows
8. Ožbolt Menegatti: Vzorčni primeri programskih rešitev za Raspberry Pi
9. Maks Popović: Uporabniški vmesnik za upravljanje z datotekami in izvajanje analiz na visoko zmogljivih sistemih
10. TIMOTEJ OSOLIN: Zasnova translacije bioloških modelov v SBML zapis
11. Matej Stipič: Razvoj modula za upravljanje delovnih obremenitev v sistemu AtlasWMS
12. ALEKSANDER MERHAR: Razvoj spletne aplikacije za analizo PCR podatkov
13. NATAŠA VODOPIVEC: Prenos meritev pametne zapestnice v enovito podatkovno bazo
14. Urban Leben: Programska rešitev avtomatizacije procesa sestave turističnega itinerarja
15. Lidija Magdevska: Uporaba mehke logike za modeliranje bioloških sistemov na primeru signalne poti MAPK
16. MARKO BOLČIČ TAVČAR: Detekcija in preprečevanje napadov DDOS v okolju manjšega ponudnika internetnih storitev
17. NEJC NADIŽAR: Vzpostavitev informacijskega okolja za vodenje evidence bioloških vzorcev
18. NERMIN JUKAN: Razvoj spletne platforme za vizualizacijo in deljenje medicinskih algoritmov
19. JAŠA PLOHL: Spremljanje porabe preko spletnih orodij za vizualizacijo meritev
20. SERGEJ MUNDA: Spletna aplikacija za samodejno izdelavo sedežnih redov
21. LUKA ŽNIDARŠIČ: Mobilna aplikacija za določanje lokacij z optimalnim vremenom
22. Hana Skitek: Analiza ritmičnosti prometnih nesreč
23. David Miškić: Pregled in primerjava računskih pristopov za analizo ritmičnega izražanja genov
24. Jurij Nastran: Analiza uporabe hiperelipsoidov pri ocenjevanju robustnosti biološkega procesorja
25. MATEJ AJSTER: Spletna aplikacija za analizo in vizualizacijo cirkadianih podatkov s knjižnico CosinorPy
26. MATEJ VRANKAR: Razvoj aplikacije za izmenjavo sporočil na platformi Android
27. Nina Velikajne: Pregled in uporaba računskih metod za analizo ritmične pojavnosti dogodkov
28. Aljaž Grdadolnik: Pregled in primerjava metahevrističnih pristopov pri določanju dopustnih vrednosti parametrov dinamičnega sistema
29. MIMI KLINEC: Agentno modeliranje dinamike tropov volkov v okolju NetLogo
30. Nika Marolt: Analiza prometnih omrežij z uporabo računskih pristopov za analizo presnovnih omrežij
31. LUKA RATEJ: Primerjava prometnih trendov na podlagi računskih analiz štetja prometa
32. JERNEJ KNIFIC: Ocenjevanje kakovosti bivanja na izbrani lokaciji glede na uporabnikove preference
33. MAJ FERLAN KOVIČ: Odkrivanje vzorcev na podlagi tekstovnih in finančnih podatkov letnih poročil podjetij
34. Bojan Dogandžić: Daljinsko upravljanje avtomobila s prepoznavanjem gibov roke
35. Blaž Mikec: Simulacija evolucije z uporabo genetskih algoritmov
36. TJAŠA HOČEVAR: Razvoj mobilne aplikacije za predvajanje glasbe z zaznavanjem gibanja na platformi Android

Other documents (23)

1. Tadeja Režen, Alexandre Martins, Miha Mraz, Nikolaj Zimic, Damjana Rozman, Miha Moškon: Integration of omics data to generate and analyse COVID-19 specific genome-scale metabolic models
2. Kaja Blagotinšek Cokan, Žiga Urlep, Miha Moškon, Miha Mraz, Xiang Yi Kong, Winnie Eskild, Damjana Rozman, Peter Juvan, Tadeja Režen: Common transcriptional program of liver fibrosis in mouse genetic models and humans
3. Miha Janež, Špela Verovšek, Tadeja Zupančič, Miha Moškon: Citizen science for traffic monitoring
4. Lidija Stanovnik, Miha Mraz, Nikolaj Zimic, Miha Moškon: Initial state perturbations as a validation method for data-driven fuzzy models of cellular networks
5. Tanja Cvitanović Tomaš, Žiga Urlep, Miha Moškon, Miha Mraz, Damjana Rozman: LiverSex computational model
6. Špela Verovšek, Matevž Juvančič, Simon Petrovčič, Tadeja Zupančič, Matija Svetina, Miha Janež, Žiga Pušnik, Nina Velikajne, Miha Moškon: An integrative approach to neighbourhood sustainability assessments using publicly available traffic data
7. Šimen Ravnik, Ines Žabkar, Uršula Prosenc Zmrzljak, Ivana Jovchevska, Neja Šamec, Miha Moškon, Alja Videtič Paska: OligoPrime
8. Špela Verovšek, Miha Moškon: Context-specific urban optimisations through data-driven classification
9. Andrew Walakira, Damjana Rozman, Tadeja Režen, Miha Mraz, Miha Moškon: Guided extraction of genome-scale metabolic models for the integration and analysis of omics data
10. Urša Kovač, Zala Žužek, Lucija Raspor Dall'Olio, Katka Pohar, Alojz Ihan, Miha Moškon, Damjana Rozman, Marjanca Starčič Erjavec: Escherichia coli affects expression of circadian clock genes in human hepatoma cells
11. Nina Velikajne, Miha Moškon: RhythmCount
12. Žiga Pušnik, Miha Mraz, Nikolaj Zimic, Miha Moškon: Review and assessment of Boolean approaches for inference of gene regulatory networks
13. Miha Moškon, Žiga Pušnik, Lidija Stanovnik, Nikolaj Zimic, Miha Mraz: A computational design of a programmable biological processor
14. Andrew Walakira, Cene Skubic, Nejc Nadižar, Damjana Rozman, Tadeja Režen, Miha Mraz, Miha Moškon: Integrative computational modeling to unravel novel potential biomarkers in hepatocellular carcinoma
15. Miha Moškon, Tadeja Režen, Matevž Juvančič, Špela Verovšek: Integrative analysis of rhythmicity
16. Ana Halužan Vasle, Miha Moškon: Synthetic biological neural networks
17. Žiga Pušnik, Miha Mraz, Nikolaj Zimic, Miha Moškon: SAILoR
18. Eva Kočar, Žiga Pušnik, Cene Skubic, Tadeja Režen, Miha Mraz, Miha Moškon, Damjana Rozman: Integrative protocol for quantifying cholesterol-related sterols in human serum samples and building decision support systems
19. Eva Kočar, Žiga Pušnik, Cene Skubic, Tadeja Režen, Miha Mraz, Miha Moškon, Damjana Rozman: COVID-19 and cholesterol biosynthesis
20. Miha Moškon, Tadeja Režen: Integration and analysis of Omics data using genome-scale metabolic models
21. Miha Moškon, Tadeja Režen: Context-specific genome-scale metabolic modelling and its application to the analysis of COVID-19 metabolic signatures
22. Lidija Stanovnik, Miha Moškon, Miha Mraz: On maximal almost balanced non-overlapping codes and non-overlapping codes with restricted run-lengths
23. Eva Kočar, Robert Šket, Ana Halužan Vasle, Gorazd Avguštin, Evgen Benedik, Barbara Koroušić-Seljak, Pavle Simić, Antonio Martinko, Shawnda A. Morrison, Maroje Sorić, Mihaela Skrt, Tomaž Polak, Tine Tesovnik, Barbara Jenko Bizjan, Jernej Kovač, Tadej Battelino, Damjana Rozman, Nataša Poklar Ulrih, Bojana Bogovič Matijašić, Gregor Jurak, Miha Moškon, Tadeja Režen: Measuring biological age