Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (2)

1. Jure Borišek: Načrtovanje zaviralcev katepsina K in avtolizina s pomočjo pristopov kemometrije in strukturno podprtega načrtovanja
2. Rok Martinčič: Napovedovanje antioksidativne aktivnosti in transmembranskega transporta derivatov pulvinske kisline in kumarina

Magistrska dela (7)

1. Katja Mikolič: Priprava in vrednotenje kristalov klaritromicina
2. Živa Frangež: Študij odvisnosti mitohondrijske lokalizacije ATG12 od izražanja Bcl-2
3. Timeja Planinšek Parfant: Vrednotenje stabilnosti resveratrola v bukalnih filmih
4. Natalija Potarić: Izolacija bakterijskega encima D-aspartat ligaze in biološko vrednotenje njegovih potencialnih zaviralcev
5. Mitja Bukovec: Razvoj potrditvene metode za določanje ostankov sedativov v živilih živalskega izvora s tekočinsko kromatografijo visoke ločljivosti, sklopljeno z masno spektrometrijo
6. Maja Ana Strnad: Evaluation of photo-physical properties of selected live-cell-marker, silyl-xanthene derivative
7. Janja Leskovar: Določanje in vitro aktivnosti potencialnih zaviralcev bakterijskega encima D-aspartat ligaza

Diplomska dela (1)

1. Gregor Novak: Ugotavljanje prisotnosti anaboličnih steroidov v prehranskih dopolnilih namenjenih športnikom s tekočinsko kromatografijo visoke ločljivosti

Druga dela (14)

1. Martina Durcik, Andrej Emanuel Cotman, Žan Toplak, Štefan Možina, Žiga Skok, Maria Vittoria Piras, Nace Zidar, Janez Ilaš, Anamarija Zega, Jurij Trontelj, Danijel Kikelj, Tihomir Tomašič, Lucija Peterlin-Mašič: New dual inhibitors of bacterial topoisomerases with broad-spectrum antibacterial activity and in vivo efficacy against vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus
2. Špela Gubič, Louise Antonia Hendrickx, Žan Toplak, Maša Sterle, Steve Peigneur, Tihomir Tomašič, Luis A. Pardo, Jan Tytgat, Anamarija Zega, Lucija Peterlin-Mašič: Discovery of K$_V$1.3 ion channel inhibitors
3. Martina Durcik, Žiga Skok, Janez Ilaš, Nace Zidar, Anamarija Zega, Petra Szili, Gábor Draskovits, T. Revesz, Danijel Kikelj, Ákos Nyerges, Csaba Pál, Lucija Peterlin-Mašič, Tihomir Tomašič: Hybrid inhibitors of DNA gyrase A and B
4. Žiga Skok, Martina Durcik, Živa Zajec, Darja Gramec, Krištof Bozovičar, Anja Pišlar, Tihomir Tomašič, Anamarija Zega, Lucija Peterlin-Mašič, Danijel Kikelj, Nace Zidar, Janez Ilaš: ATP-competitive inhibitors of human DNA topoisomerase IIα with improved antiproliferative activity based on N-phenylpyrrolamide scaffold
5. Nace Zidar, Alessia Onali, Peter Peršolja, Davide Benedetto Tiz, Jaka Dernovšek, Žiga Skok, Martina Durcik, Andrej Emanuel Cotman, Martina Hrast, Anamarija Zega, Lucija Peterlin-Mašič, Janez Ilaš, Tihomir Tomašič, Danijel Kikelj: Improved N-phenylpyrrolamide inhibitors of DNA gyrase as antibacterial agents for high-priority bacterial strains
6. Žiga Skok, Michaela Barančokova, Ondřej Benek, Cristina Durante Cruz, Päivi Tammela, Tihomir Tomašič, Nace Zidar, Lucija Peterlin-Mašič, Anamarija Zega, Danijel Kikelj, Janez Ilaš: Exploring the chemical space of benzothiazole-based DNA gyrase B inhibitors
7. Martina Durcik, Žan Toplak, Nace Zidar, Janez Ilaš, Anamarija Zega, Danijel Kikelj, Lucija Peterlin-Mašič, Tihomir Tomašič: Efficient synthesis of hydroxy-substituted 2-aminobenzo[d]thiazole-6-carboxylic acid derivatives as new building blocks in drug discovery
8. Ákos Nyerges, Tihomir Tomašič, Martina Durcik, T. Revesz, Petra Szili, Žiga Skok, Nace Zidar, Janez Ilaš, Anamarija Zega, Danijel Kikelj, Lucija Peterlin-Mašič: Rational design of balanced dual-targeting antibiotics with limited resistance
9. Andrej Emanuel Cotman, Pavel A. Dub, Maša Sterle, Matic Lozinšek, Jaka Dernovšek, Živa Zajec, Anamarija Zega, Tihomir Tomašič, Dominique Cahard: Catalytic stereoconvergent synthesis of homochiral β‑CF$_3$, β‑SCF$_3$, and β‑OCF$_3$ benzylic alcohols
10. Andrej Emanuel Cotman, Martina Durcik, Davide Benedetto Tiz, Federica Fulgheri, Daniela Secci, Maša Sterle, Štefan Možina, Žiga Skok, Nace Zidar, Anamarija Zega, Janez Ilaš, Lucija Peterlin-Mašič, Tihomir Tomašič, Danijel Kikelj: Discovery and hit-to-lead optimization of benzothiazole scaffold-based DNA gyrase inhibitors with potent activity against Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa
11. Maša Sterle, Matej Huš, Matic Lozinšek, Anamarija Zega, Andrej Emanuel Cotman: Hydrogen-bonding ability of Noyori–Ikariya catalysts enables stereoselective access to CF$_3$-substituted syn-1,2-diols via dynamic kinetic resolution
12. Maša Sterle, Martina Durcik, Danijel Kikelj, Nace Zidar, Lucija Peterlin-Mašič, Janez Ilaš, Tihomir Tomašič, Andrej Emanuel Cotman, Anamarija Zega: Exploring the 5-substituted 2-aminobenzothiazole-based DNA gyrase B inhibitors active against ESKAPE pathogens
13. Nace Zidar, Andrej Emanuel Cotman, Wessel Sinnige, Ondřej Benek, Michaela Barančokova, Anamarija Zega, Lucija Peterlin-Mašič, Tihomir Tomašič, Janez Ilaš, Ricardo D. Enriz, Danijel Kikelj: Exploring the interaction of N-(benzothiazol-2-yl)pyrrolamide DNA gyrase inhibitors with the GyrB ATP-binding site lipophilic floor
14. Andrej Emanuel Cotman, Federica Fulgheri, Martina Piga, Peter Peršolja, Davide Benedetto Tiz, Žiga Skok, Martina Durcik, Maša Sterle, Jaka Dernovšek, Anamarija Zega, Lucija Peterlin-Mašič, Janez Ilaš, Tihomir Tomašič, Danijel Kikelj, Nace Zidar: New N-phenylpyrrolamide inhibitors of DNA gyrase with improved antibacterial activity