Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (4)

1. Mateja Tršan: Proučevanje bioluminescenčne metode za ocenjevanje mikrobiološke kakovosti prostorov v sterilni proizvodnji v bolnišnici
2. Nataša Švent-Kučina: Odpornost proti meticilinu, virulentni dejavniki in genetska raznolikost izolatov Staphylococcus aureus, osamljenih pri bolnikih z okužbo mehkih tkiv in kože
3. Urška Bidovec: Molekularna tipizacija bakterij iz sklopa Mycobacterium tuberculosis
4. Igor Križnar: Vpliv priprave dostopne preparacije in sredstev za izpiranje na tesnjenje začasnih plombirnih materialov

Magistrska dela (9)

1. Maruša Ravnik: Primerjava metod za dokazovanje karbapenemaz, ki jih izločajo enterobakterije
2. Nataša Bukovec: Določanje sinergističnega učinka kombinacije antibiotikov proti večkratno odpornim sevom bakterije Acinetobacter baumannii
3. Maja Kavalič: Tipizacija izolatov Listeria monocytogenes s klasično serološko metodo in PCR ter subtizacija s PFGE
4. Ana Kvas: Ugotavljanje prisotnosti genskih zapisov značilnih za zunajčrevesne patogene pri komenzalnih govejih sevih bakterije Escherichia coli
5. Katarina Žnidar: Protimikrobna aktivnost izbranih rastlinskih izvlečkov, eteričnih olj in odpadnih materialov po destilaciji olj
6. Mateja Dolenc: Analiza bakterijske odpornosti najpogostejših povzročiteljev okužb dihal pri otrocih s cistično fibrozo v Sloveniji
7. Urša Gubenšek: Virulentni potencial sevov Escherichia coli, izoliranih iz domačih kuncev in njihove krme
8. Sara Lisjak: Dinamika okužb z ne-visokorizičnimi genotipi človeških papilomavirusov v Sloveniji
9. Maja Gorše: Molekularnobiološka analiza bakterij izoliranih iz pomivalnih strojev

Diplomska dela (35)

1. Eva Sodja: Primerjava klasične bakteriološke diagnostike in molekularne metode za dokazovanje parodontopatogenih bakterij v vzorcih iz parodontalnih žepov
2. Darja Klep: Vpliv različnih gostot bakterijskih suspenzij in različnih časov inkubacije na rezultate testitranja občutljivosti za antibiotike pri bakterijah Streptococcus pneumoniae in Staphylococcus aureus
3. Petra Gabrijel: Občutljivost bakterijskih izolatov za novi glicilciklinski antibiotik tigeciklin
4. Anja Zagožen: Prevalenca okužbe z virusom hepatitisa D pri bolnikih s kroničnim hepatitisom B v Sloveniji
5. Savina Goličnik: Primerjava minimalnih inhibitornih koncentracij antibiotikov pri bakterijah, izoliranih iz kužnin bolnikov iz intenzivnih enot in z oddelkov
6. Petra Baranašič: Primerjava protimikrobnega učinka laserja, klorheksidina in kalcijevega hidroksida na bakterijo Enterococcus faecalis in glivo Candida albicans
7. Petra Vučko: Primerjava ročne in avtomatske izolacije DNA v postopku dokazovanja okužb s humanimi virusi papiloma
8. Jana Ferdin: Primerjava dveh metod verižne reakcije s polimerazo za dokaz borelij lymske borelioze
9. Lea Hošnjak: Dokazovanje okužb s človeškimi papilomavirusi v arhivskih tkivnih vzorcih ploščatoceličnega karcinoma ustne votline in ustnega dela žrela
10. Simona Drev: Primerjava dveh seroloških metod pri dokazovanju lymske borelioze
11. Valerija Zidarič: Osamitev, karakterizacija in pogostnost bakterije Clostridium difficile pri živalih
12. Simona Plazar: Preverjanje trajnosti izbranih bakterioloških gojišč
13. Vesna Marčič: Vpliv hemogenizacije kužnin iz spodnjih dihal z ditiotreitolom na rezultate bakteriološke preiskave na patogene bakterije
14. Gregor Zupan: Razporeditev genotipov virusa hepatitisa C v Sloveniji v letih 2003-2006
15. Sanja Podržaj: Protibakterijska učinkovitost različnih vrst medu na parodontopatogene bakterije in ustne streptokoke
16. Tadej Furlan: Kandidemije v dveh največjih bolnišnicah v Ljubljani v obdobju od 01.01.2000 do 31.03.2008
17. Tanja Kavčič: Primerjava vrstne raznolikosti in koncentracij plesni v zunanjem in bolnišničnem okolju ter genotipizacija plesni Aspergillus fumigatus
18. Ksenja Maršič: Primerjava dveh selektivnih gojišč za dokazovanje izolatov Staphylococcus aureus odpornih proti meticilinu v nadzornih kužninah
19. Meta Kodre: Serotipska in genotipska opredelitev leptospir
20. Rok Tomazin: Molekularna karakterizacija izolatov bakterije Pseudomonas aeruginosa bolnikov s cistično fibrozo
21. Željka Bogovac: Opredelitev podtipskih različic nekodirajočega področja genoma humanega virusa papiloma HPV-6
22. Petra Čuk: Razreševanje mejnih rezultatov testa Hybrid Capture 2 HPV DNA za dokazovanje visokorizičnih humanih virusov papiloma
23. Anja Kovanda: Molekularna opredelitev podtipskih različic humanega virusa papiloma HPV-53 iz Belgije
24. Sara Beigot: Primerjava potrditve onihomikoze, povzročene z dermatofiti, z dermatofitnim testnim agarjem in standardno mikološko preiskavo
25. Nežka Bobnar: Testiranje delovanja cefiksima in cefuroksima na nekatere enterobakterije, izolirane iz vzorcev urina oskrbovancev domov starejših občanov
26. Maja Bertoncelj: Občutljivost povzročiteljev okužb dihal osamljenih v medicinskem mikrobiološkem laboratoriju v obdobju 2004-2006
27. Mojca Šoštarič: Dokazovanje proti meticilinu odpornega Staphyloccocus aureus z uporabo molekularne metode neposredno iz kužnine
28. Maja Fojkar: Odpornost bakterije Pseudomonas aeruginosa proti izbranim antibiotikom
29. Mitja Rot: Občutljivost izolatov gliv kvasovk za antimikotike osamljenih iz nadzornih kužnin v obdobju 1992-2005
30. Gregor Ključevšek: Primerjava ročne in avtomatske izolacije DNA v postopku dokazovanja okužb s človeškim virusom citomegalije
31. Urša Dolinar: Molekularna identifikacija medicinsko pomembnih bakterij iz rodu Burkholderia in kompleksa Burkholderia cepacia
32. Martin Fettich: Primerjava dveh metod za dokazovanje sočasnih okužb z večimi genotipi humanih virusov papiloma
33. Saša Haberl Meglič: Molekularna opredelitev podtipskih različic gena E7 slovenskih izolatov humanega papiloma virusa genotipa 31
34. Katarina Kaja Ećimović: Okužba s humanimi virusi papiloma pri bolnikih z invertnimi papilomi
35. Laura Krese: Vrednotenje mikroskopskih preparatov in osamitev plesni iz kužnin spodnjih dihal pri bolnikih s kroničnimi boleznimi pljuč

Druga dela (11)

1. Rok Kogoj, Petra Kmetič, Anja Oštrbenk Valenčak, Kristina Fujs Komloš, Katja Seme, Martin Sagadin, Miša Korva, Mario Poljak: Real-life head-to-head comparison of performance of two high-throughput automated assays for the detection of SARS-CoV-2 RNA in nasopharyngeal swabs
2. Mario Poljak, Anja Oštrbenk Valenčak, Erik Štrumbelj, Polona Maver Vodičar, Vasja Vehovar, Katarina Resman Rus, Miša Korva, Nataša Knap, Katja Seme, Miroslav Petrovec, Blaž Zupan, Janez Demšar, Slavko Kurdija, Tatjana Avšič-Županc: Seroprevalence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 in Slovenia
3. Aljaž Baumkircher, Katja Seme, Marko Munih, Matjaž Mihelj: Collaborative robot precision task in medical microbiology laboratory
4. Maja Grundner, Haris Munjaković, Tilen Tori, Kristina Sepčić, Rok Gašperšič, Čedomir Oblak, Katja Seme, Graziano Guella, Francesco Trenti, Matej Skočaj: Ceramide phosphoethanolamine as a possible marker of periodontal disease
5. Mario Poljak, Anja Oštrbenk Valenčak, Tina Štamol, Katja Seme: Head-to-head comparison of two rapid high-throughput automated electrochemiluminescence immunoassays targeting total antibodies to the SARS-CoV-2 nucleoprotein and spike protein receptor binding domain
6. Taja Železnik Ramuta, Larisa Tratnjek, Aleksandar Janev, Katja Seme, Marjanca Starčič Erjavec, Mateja Erdani-Kreft: The antibacterial activity of human amniotic membrane against multidrug-resistant bacteria associated with urinary tract infections
7. Katja Seme, Mario Poljak, Branka Čelan-Lucu, Gorazd Lešničar, Vladimir Brinovec, Mojca Matičič, Jelka Meglič-Volkar, Saša Žužek-Rešek, Srečko Štepec, Zvonko Baklan, Dušan Andoljšek, Majda Benedik-Dolničar, Peter Dovč, Srečko Koren: Genomska tipizacija izolatov virusa hepatitisa C v Sloveniji
8. Ana Drnovšek, Marina Praprotnik, Uroš Krivec, Malena Aldeco, Dušanka Lepej, Saša Šetina Šmid, Aleksandra Zver, Majda Oštir, Katja Seme, Jernej Brecelj, Anija Orel, Darja Šmigoc Schweiger, Jasna Rodman: Pregled in ocena kazalcev bolezni otrok in mladostnikov s cistično fibrozo v Sloveniji
9. Jana Avberšek, Bojan Papić, Darja Kušar, Vladimira Erjavec, Katja Seme, Majda Golob, Irena Zdovc: Feline otitis externa caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus with mixed hemolytic phenotype and overview of possible genetic backgrounds
10. Iva Marković, Lea Hošnjak, Katja Seme, Mario Poljak: Molecular characterization of human papillomavirus type 159 (HPV159)
11. Katja Hrovat, Jerneja Čremožnik Zupančič, Katja Seme, Jerneja Ambrožič: QAC resistance genes in ESBL-producing E. coli isolated from patients with lower respiratory tract infections in the Central Slovenia region—a 21-year survey