Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (3)

1. Janez Orehek: Strukturni opis biorazgradnje gostil na celulozni osnovi
2. Maja Borić: Vpliv viskoznosti medija na ekofiziologijo bakterije Vibrio ruber
3. Tjaša Danevčič: Vpliv slanosti na energetski metabolizem pri bakteriji Vibrio sp.

Magistrska dela (8)

1. Barbara Kozjek: Mikrobiološka razgradnja arheološkega mokrega lesa
2. Monika Robnik: Vpliv faze rasti bakterijske kulture na pritrjevanje ter vpliv laminarnega toka tekočine na odstranjevanje pritrjenih bakterij
3. Ana Cerar: Optimizacija gojenja mikroalg v iztoku iz bioplinske naprave za proizvodnjo bioplina
4. Simon Sretenović: Vloga levana pri strukturiranju bakterijskih biofilmov
5. Urška Zadel: Struktura mikrobne združbe in mineralizacija modelne organske snovi po remediaciji s kovinami onesnaženih tal
6. Špela Koželj: Validacija metode za določevanje koliformnih bakterij in vpliv površine na njihovo adhezijo
7. Tanja Tesovnik: Preučevanje difuzijskih lastnosti biofilmov pri bakteriji Bacillus subtilis
8. Klemen Petek: Biorazgradljivost celuloznih derivatov

Diplomska dela (33)

1. Martin Štimpfel: Molekularno biološka analiza pritrjenih in planktonskih bakterijskih združb v lokalnem vodovodnem sistemu
2. Nataša Fajfar: Vpliv vrste in koncentracije koloidov na aktivnost bakterij
3. Mateja Jurada: Morfologija, kultivabilnost in preživelost celic ter izražanje genov flaA in groEL bakterij Campylobacter jejuni v razmerah toplotnega stresa
4. Mateja Rebernik: Študij vezave polifenolov na goveji serumski albumin z diferenčno dinamično kalorimetrijo
5. Julija Benko: Vpliv divjega tipa Vibrio sp. na konkurenčno sposobnost nepigmentiranih sevov Vibrio sp.
6. Marko Krajnc: Vpliv okoljskih dejavnikov na produkcijo zunajceličnih signalnih molekul pri naravnem izolatu Vibrio sp.
7. Meta Habjan Dovč: Vsebnost vitamina C in nitrata v radiču
8. Alja Štern: Opis lastnosti rdečega pigmenta iz naravnega izolata bakterije Vibrio sp.
9. Nejc Petrovič: Vloga prolina pri pigmentaciji bakterije Vibrio ruber DSM 14379
10. Gorazd Stojkovič: Vpliv hitrega periodičnega spreminjanja temperature na rast bakterije Escherichia coli
11. Tjaša Marinšek: Frakcionacija morskih makroagregatov med mikrobno razgradnjo
12. Nejc Starič: Vpliv okoljskih faktorjev na produkcijo barvila naravnega izolata Vibrio sp.
13. Maja Borić: Razvoj nove metode za merjenje mikroviskoznosti v mikrobiologiji
14. Barbara Škufca: Vpliv okolja na stabilnost pigmenta bakterije Vibrio sp. DSM 14379
15. Maja Gorišek: Vpliv nonilfenola na strukturo mikrobne združbe v reaktorju s pritrjeno biomaso
16. Doroteja Repič: Aktivnost in številčnost mikrobne združbe v različnih globinah barjanskih tal
17. Tjaša Drčar: Določanje signalnih molekul in vpliv slanosti na njihovo produkcijo pri bakteriji Vibrio sp.
18. Anja Simčič: Biorazgradnja derivatov celuloze z bakterijo Cellulomonas uda
19. Urška Tomc: Izolacija mikroorganizmov iz obrata proizvodnje vodnih barv in analiza učinkovitosti biocidov
20. Tina Strmljan: Opis razgradnje karboksimetil celuloze z bakterijami Cellulomonas uda in Bacillus subtilis
21. Janko Rakuša: Vpliv okoljskih dejavnikov na proizvodnjo N2O pri bakteriji Vibrio sp. DSM14379
22. Simona Kamenšek: Izražanje od proteina LexA odvisnih genov bakterije Escherichia coli na ravni posameznih celic
23. Olja Bregar: Vpliv spreminjanja temperature med rastjo celic na presnovno aktivnost bakterij Escherichia coli
24. Mirjana Bistan: Vpliv strupenih dejavnikov na profil celičnih maščobnih kislin bakterije Pseudomonas putida
25. Barbara Kovče: Mikrobna raznolikost prevlek, ki tvorijo 'jamsko srebro' v Pajsarjevi jami
26. Boštjan Bidovec: Fiziološki odziv bakterije Escherichia coli v različno viskoznih gojiščih
27. Katarina Vrabec: Fizikalno-kemijski opis zunajceličnih polimernih substanc (EPS) pri bakteriji Bacillus subtilis
28. Janja Lamovšek: Osmotske volumske spremembe humanega eritrocita zaradi vpliva Hg2+, Pb2+ in Cd2+ na delovanje membranskih kanalčkov
29. Aleš Goznik: Sprememba parametrov kvalitete lizata Vibrio sp. DSM14379 v odvisnosti od koncentracije NaCl
30. Nataša Kračun: Struktura in aktivnost mikrobne združbe vzdolž slanostnega gradienta v Sečoveljskih solinah
31. Rok Lenarčič: Bioremediacijski potencial šotnih tal
32. Urška Kladnik: Ugotavljanje citotoksičnosti rdečega barvila bakterije Vibrio sp. za primarne mišje limfocite B
33. Miha Mihelič: Pomen pršenja slapov pri razširjanju bakterij

Druga dela (21)

1. Mojca Krajnc, Polonca Štefanič, Rok Kostanjšek, Ines Mandić-Mulec, Iztok Dogša, David Stopar: Systems view of Bacillus subtilis pellicle development
2. Mojca Korošec, David Stopar, Lidija Baša, Goran Tenze: Med znanostjo in mediji
3. Polona Megušar, David Stopar, Nataša Poklar Ulrih, Iztok Dogša, Iztok Prislan: Thermal and rheological properties of gluten-free, starch-based model systems modified by hydrocolloids
4. Živa Lengar, Katja Klun, Iztok Dogša, Ana Rotter, David Stopar: Sequestration of polystyrene microplastics by jellyfish mucus
5. Janja Trček, Iztok Dogša, Tomaž Accetto, David Stopar: Acetan and acetan-like polysaccharides
6. Žiga Pandur, Matevž Dular, Rok Kostanjšek, David Stopar: Bacterial cell wall material properties determine E. coli resistance to sonolysis
7. Katja Molan, Ramin Rahmani, Daniel Krklec, Miha Brojan, David Stopar: Phi 6 bacteriophage inactivation by metal salts, metal powders, and metal surfaces
8. Mitja Drab, David Stopar, Veronika Kralj-Iglič, Aleš Iglič: Inception mechanisms of tunneling nanotubes
9. Urh Simunič, Peter Pipp, Matevž Dular, David Stopar: The limitations of hydrodynamic removal of biofilms from the dead-ends in a model drinking water distribution system
10. Matija Jezeršek, Katja Molan, Saša Terlep, Špela Levičnik-Höfferle, Boris Gašpirc, Matjaž Lukač, David Stopar: The evolution of cavitation in narrow soft-solid wedge geometry mimicking periodontal and peri-implant pockets
11. Andrej Šarc, Janez Kosel, David Stopar, Martina Oder, Matevž Dular: Removal of bacteria Legionella pneumophila, Escherichia coli, and Bacillus subtilis by (super)cavitation
12. David Stopar, Blaž Stres, Ivan Mahne: Praktikum iz mikrobne ekologije za študente mikrobiologije
13. Tina Ivančič, Polona Jamnik, David Stopar: Cold shock CspA and CspB protein production during periodic temperature cycling in Escherichia coli
14. Maja Borić, Tjaša Danevčič, David Stopar: Viscosity dictates metabolic activity of Vibrio ruber
15. Maruša Horvat, Archana Pannuri, Tony Romeo, Iztok Dogša, David Stopar: Viscoelastic response of Escherichia coli biofilms to genetically altered expression of extracellular matrix components
16. Mojca Zupanc, Žiga Pandur, Tadej Stepišnik Perdih, David Stopar, Martin Petkovšek, Matevž Dular: Effects of cavitation on different microorganisms
17. Žiga Pandur, Iztok Dogša, Matevž Dular, David Stopar: Liposome destruction by hydrodynamic cavitation in comparison to chemical, physical and mechanical treatments
18. Michaela Hympanova, Saša Terlep, Aneta Markova, Lukáš Prchal, Iztok Dogša, Lenka Pulkrabkova, Marketa Benkova, Jan Marek, David Stopar: The antibacterial effects of new N-alkylpyridinium salts on planktonic and biofilm bacteria
19. Žiga Pandur, Jure Zevnik, Darjan Podbevšek, Biljana Stojković, David Stopar, Matevž Dular: Water treatment by cavitation
20. Iztok Dogša, Rok Kostanjšek, David Stopar: eDNA provides a scaffold for autoaggregation of B. subtilis in bacterioplankton suspension
21. Žiga Pandur, Samo Penič, Aleš Iglič, Veronika Kralj-Iglič, David Stopar, Mitja Drab: Surfactin molecules with a cone-like structure promote the formation of membrane domains with negative spontaneous curvature and induce membrane invaginations