Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (4)

1. Luka Fajs: Antagonistično delovanje virusa krimsko-kongoške hemoragične mrzlice na odziv interferonov tipa I
2. Miša Korva: Vpliv genetske variabilnosti v HLA lokusu in hantavirusnega tipa na patogenezo hemoragične mrzlice z renalnim sindromom
3. Sara Mankoč Ramuš: Molekularno-epidemiološke in biološke značilnosti virusov kužnega arteritisa kopitarjev
4. Urška Ravnik Verbič: Patogeneza in imunski odziv pri naravni okužbi psov z bakterijo Anaplasma phagocytophilum

Magistrska dela (4)

1. Sergeja Mar: Molekularna epidemiologija človeških rinovirusov v Sloveniji
2. Monika Kozlevčar: Spremljanje dinamike virusnega bremena in imunskega odziva pri bolnikih s HMRS
3. Nina Jakopin: Ugotavljanje virusnega bremena in genetske raznolikosti virusa klopnega meningoencefalitisa v kliničnih vzorcih bolnikov
4. Ines Kmet: Molekularna opredelitev izolatov človeškega papilomavirusa HPV-16 iz predela glave in vratu ter anogenitalnega predela

Diplomska dela (29)

1. Marjanca Blas: Genska raznolikost virusa pahljačavosti listov vinske trte in opis bolezenskih znamenj na okuženih rastlinah
2. Mojca Serdt: Navadni gozdni klop Ixodes ricinus kot prenašalec bakterije Anaplasma phagocytophilum v Sloveniji
3. Marko Kolenc: Primerjava dveh metod za ugotavljanje protiteles IgG avidnosti proti Toxoplasma gondii
4. Tanja Zidarič: Ugotavljanje novih vrst hantavirusov v rovkah v Sloveniji
5. Dejan Kocon: Filogenetska analiza izolatov virusa klopnega meningoencefalitisa iz kliničnih vzorcev bolnikov
6. Tanja Bizimoska: Dokaz virusa limfocitnega horiomeningitisa pri malih sesalcih v Sloveniji
7. Miša Korva: Dokaz dveh genetskih linij hantavirusa Puumala izoliranega iz gostiteljev v Sloveniji
8. Eva Bandelj: Pomen izražanja nekaterih mikroRNA v jetrih glede na genotip pri bolnikih okuženih z virusom hepatitisa C
9. Vesna Dolinšek: Pogostost okužbe z virusom klopnega meningoencefalitisa pri malih sesalcih v Sloveniji
10. Sonja Vesel: Primerjava različnih diagnostičnih metod pri določanju kalicivirusov iz iztrebkov bolnikov obolelih za gastroenteritisom
11. Katja Kobal: Človeški sapovirusi v iztrebkih bolnikov, obolelih za virusnim gastroenteritisom v Sloveniji
12. Barbara Hrast: Dokazovanje virusa influence tipa A z metodo verižne rakcije s polimerazo v realnem času
13. Tamara Zrim: Dokazovanje parehovirusov z metodo verižne reakcije s polimerazo
14. Dane Lužnik: Primerjava učinkovitosti dveh metod za ugotavljanje protiteles IgG in IgM proti praživali Toxoplasma gondii
15. Maja M. Lunar: Preskus metode Western-blot za ugotavljanje ehinokokoze
16. Janja Škrlec: Dokazovanje adenovirusov v fecesu z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času
17. Špela Furar: Molekularno določanje človeških sapovirusov v iztrebkih bolnikov, obolelih za virusnim gastroenteritisom
18. Klementina Žnuderl: Rotavirusni genotipi pri hospitaliziranih otrocih v ljubljanski regiji v letu 2008
19. Martin Sagadin: Razvoj in uporaba molekularne metode za določanje norovirusnega bremena
20. Ida Kralj: Določanje rotavirusnih genotipov pri hospitaliziranih otrocih z gastroenteritisom
21. Ajda Mihorič: Molekularno določanje človeških kalicivirusov v školjkah
22. Mateja Hafner: Molekularna določitev malih okroglih virusov v iztrebkih bolnikov z gastroenteritisom
23. Katarina Engelman: Ugotavljanje flebovirusov pri bolnikih z meningitisom ali meningoencefalitisom v Sloveniji
24. Tina Mikuletič: Virus hepatitisa E pri domačih prašičih in v površinskih vodah v Sloveniji
25. Duša Hodžić: Molekularno določanje kalicivirusov v iztrebkih prašičev
26. Nežka Kavčič: Določanje specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr pri bolnikih s sumom na akutno okužbo s citomegalovirusom
27. Tanja Bračko: Dokazovanje astrovirusnih okužb z RT-PCR v realnem času
28. Mateja Jelen: Primerjava ročne in avtomatske izolacije RNA virusa klopnega meningoencefalitisa v kliničnih in živalskih vzorcih
29. Emina Durmiši: Navadni gozdni klop Ixodes ricinus kot prenašalec virusa klopnega meningoencefalitisa v Sloveniji

Druga dela (25)

1. Miša Korva, Nataša Knap, Katarina Resman Rus, Luka Fajs, Gašper Grubelnik, Matejka Bremec, Tea Knapič, Tomi Trilar, Tatjana Avšič-Županc: Phylogeographic diversity of pathogenic and non-pathogenic hantaviruses in Slovenia
2. Samo Zakotnik, Nataša Knap, Petra Bogovič, Tomaž Mark Zorec, Mario Poljak, Franc Strle, Tatjana Avšič-Županc, Miša Korva: Complete genome sequencing of tick-borne encephalitis virus directly from clinical samples
3. Monika Jevšnik Virant, Tina Uršič, Rok Kogoj, Miša Korva, Miroslav Petrovec, Tatjana Avšič-Županc: Evaluation of two broadly used commercial methods for detection of respiratory viruses with a recently added new target for detection of SARS-CoV-2
4. Cesare E. M. Gruber, Barbara Bartolini, Concetta Castilletti, Ali Mirazimi, Roger Hewson, Iva Christova, Tatjana Avšič-Županc, Roland Grunow, Anna Papa, María P. Sánchez-Seco, Marion Koopmans, Giuseppe Ippolito, Maria Rosaria Capobianchi, Chantal B. E. M. Reusken, Antonino Di Caro: Geographical variability affects CCHFV detection by RT-PCR
5. Petra Bogovič, Stanka Lotrič-Furlan, Tatjana Avšič-Županc, Miša Korva, Lara Lusa, Klemen Strle, Franc Strle: Low virus-specific IgG antibodies in adverse clinical course and outcome of tick-borne encephalitis
6. Petra Bogovič, Lara Lusa, Miša Korva, Miša Marušić, Katarina Resman Rus, Stanka Lotrič-Furlan, Tatjana Avšič-Županc, Klemen Strle, Franc Strle: Inflammatory immune responses in the pathogenesis of tick-borne encephalitis
7. Pavel Kvapil, Marjan Kastelic, Nuša Jež, Kamil Sedlák, Nikola Kašpárková, Mateja Jelovšek, Tatjana Avšič-Županc, Eva Bártová, Joško Račnik: Detection of antibodies against tick-borne encephalitis virus in zoo animals using non-invasive blood sampling with medicinal leeches (Hirudo medicinalis)
8. Pavel Kvapil, Joško Račnik, Marjan Kastelic, Eva Bártová, Miša Korva, Mateja Jelovšek, Tatjana Avšič-Županc: A sentinel serological study in selected zoo animals to assess early detection of West Nile and Usutu virus circulation in Slovenia
9. Petra Bogovič, Stanka Lotrič-Furlan, Tatjana Avšič-Županc, Miša Korva, Andrej Kastrin, Lara Lusa, Klemen Strle, Franc Strle: Comparison of clinical, laboratory and immune characteristics of the monophasic and biphasic course of tick-borne encephalitis
10. Jernej Jorgačevski, Miša Korva, Maja Potokar, Marjeta Lisjak, Tatjana Avšič-Županc, Robert Zorec: ZIKV strains differentially affect survival of human fetal astrocytes versus neurons and traffic of ZIKV-laden endocytotic compartments
11. Pavel Kvapil, Joško Račnik, Marjan Kastelic, Pavlina Pittermannová, Tatjana Avšič-Županc, Eva Bártová, Kamil Sedlák: Detection of antibodies against tick-borne encephalitis virus and other flaviviruses in a zoological collection in Slovenia
12. Joško Račnik, Ana Kočevar, Brigita Slavec, Miša Korva, Katarina Resman Rus, Samo Zakotnik, Tomaž Mark Zorec, Mario Poljak, Milan Matko, Olga Zorman-Rojs, Tatjana Avšič-Županc: Transmission of SARS-CoV-2 from human to domestic ferret
13. Mario Poljak, Anja Oštrbenk Valenčak, Erik Štrumbelj, Polona Maver Vodičar, Vasja Vehovar, Katarina Resman Rus, Miša Korva, Nataša Knap, Katja Seme, Miroslav Petrovec, Blaž Zupan, Janez Demšar, Slavko Kurdija, Tatjana Avšič-Županc: Seroprevalence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 in Slovenia
14. Emil Pal, Miša Korva, Katarina Resman Rus, Nataša Kejžar, Petra Bogovič, Franc Strle, Tatjana Avšič-Županc: Relationship between circulating vascular endothelial growth factor and its soluble receptor in patients with hemorrhagic fever with renal syndrome
15. Tatjana Vilibić-Čavlek, Tena Oreški, Miša Korva, Branko Kolarič, Vladimir Stevanovic, Snježana Židovec-Lepej, Irena Tabain, Pavle Jelicic, Bozana Miklausic-Pavic, Vladimir Savić, Ljubo Barbić, Tatjana Avšič-Županc: Prevalence and risk factors for lymphocytic choriomeningitis virus infection in continental Croatian regions
16. Katarina Resman Rus, Miša Korva, Nataša Knap, Tatjana Avšič-Županc, Mario Poljak: Performance of the rapid high-throughput automated electrochemiluminescence immunoassay targeting total antibodies to the SARS-CoV-2 spike protein receptor binding domain in comparison to the neutralization assay
17. Maša Velušček, Rok Blagus, Tjaša Cerar Kišek, Eva Ružić-Sabljić, Tatjana Avšič-Županc, Fajko Bajrović, Daša Stupica: Antibiotic use and long-term outcome in patients with tick-borne encephalitis and co-infection with Borrelia burgdorferi sensu lato in Central Europe
18. Petra Bogovič, Lara Lusa, Miša Korva, Stanka Lotrič-Furlan, Katarina Resman Rus, Miša Marušić, Tatjana Avšič-Županc, Klemen Strle, Franc Strle: Inflammatory immune responses in patients with tick-borne encephalitis
19. Miša Korva, Katarina Resman Rus, Miša Marušić, Ana Saksida, Nataša Knap, Mateja Jelovšek, Katja Strašek, Xhevat Jakupi, Isme Humolli, Jusuf Dedushaj, Miroslav Petrovec, Tatjana Avšič-Županc: Characterization of biomarker levels in Crimean-Congo hemorrhagic fever and hantavirus fever with renal syndrome
20. Nataša Knap, Miša Korva, Vladimir Ivović, Katja Kalan, Mateja Jelovšek, Martin Sagadin, Samo Zakotnik, Katja Strašek, Jan Slunečko, Tatjana Avšič-Županc: West Nile virus in Slovenia
21. Maja Frelih, Andreja Erman, Karmen Wechtersbach, Jerica Pleško, Tatjana Avšič-Županc, Nika Kojc: SARS-CoV-2 virions or ubiquitous cell structures?
22. Petra Tavčar Verdev, Maja Potokar, Marko Kolenc, Miša Korva, Tatjana Avšič-Županc, Robert Zorec, Jernej Jorgačevski: Neurotropic viruses, astrocytes, and COVID-19
23. Miša Marušić, Miša Korva, Nataša Knap, Petra Bogovič, Lara Lusa, Klemen Strle, Mirijam Nahtigal Klevišar, Tomaž Vovko, Janez Tomažič, Stanka Lotrič-Furlan, Franc Strle, Tatjana Avšič-Županc: Upregulated intrathecal expression of VEGF-A and long lasting global upregulation of proinflammatory immune mediators in vaccine breakthrough tick-borne encephalitis
24. Nadja Kosič, Boštjan Luzar, Polona Pečlin, Mirjam Druškovič, Katarina Resman Rus, Tatjana Avšič-Županc, Tanja Premru-Sršen: Fetal death from SARS-CoV-2 mediated acute placental failure
25. Miša Marušić, Andreja Nataša Kopitar, Miša Korva, Nataša Knap, Petra Bogovič, Franc Strle, Alojz Ihan, Tatjana Avšič-Županc: Dendritic cell activation and cytokine response in vaccine breakthrough TBE patients after in vitro stimulation with TBEV