izpis_h1_title_alt

BEsTRF : a tool for optimal resolution of terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis based on user defined primer-enzyme-sequence databases
Stres, Blaž (Avtor), Tiedje, James M. (Avtor), Murovec, Boštjan (Avtor)

URLURL - Predstavitvena datoteka, za dostop obiščite http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btp254?ijkey=qw9y7y9LEcKhXd7&keytype=ref Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
BEsTRF (Best Estimated T-RF) provides a stand-alone environment for analyzing primers-enzymes-gene section combinations used in T-RFLP for its optimal resolution. User defined sequence databases of several hundred thousand DNA sequences can be explored and the resolution of user specified sets of primers and restriction endonucleases can be analyzed on either forward or reverse terminal fragments. Sequence quality, primer mismatches, insertions and delitions can be controlled and each primer-pair specific sequence collections can be exported for downstream analyses. The configuration for a novel T-RFLP population profiling using rpoB gene (DNA-directed RNA polymerase, beta subunit) on forward fluorescently labelled primer are presented.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:mikrobiologija, molekularna genetika, BEsTRF
Vrsta gradiva:Delo ni kategorizirano (r6)
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2009
Št. strani:str. 1556-1558
Številčenje:Vol. 25, Issue 12
UDK:579:575
ISSN pri članku:1367-4803
DOI:10.1093/bioinformatics/btp254 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:2450312 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:638
Število prenosov:327
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj