Podrobno

Successful purification of DNA from PFGE agarose plugs for whole genome sequencing
ID Strašek Smrdel, Katja (Avtor), ID Celar Šturm, Andraž (Avtor), ID Triglav, Tina (Avtor), ID Pirš, Mateja (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (56,21 KB)
MD5: DC23471409C33E7FD30D280A3C12B505
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://journals.uni-lj.si/abs/article/view/21898 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Whole-genome sequencing (WGS) has replaced Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE)-based bacterial genotyping as the reference genotyping method. We investigated the suitability of purified genomic DNA extracted from PFGE agarose plugs stored in a laboratory collection for WGS in cases where bacterial isolates are no longer available. Our study has shown that bacterial WGS can be successfully performed on DNA extracted from PFGE agarose plugs.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:DNA purification, PFGE plugs, genotyping, bacterial isolates, WGS
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.03 - Drugi znanstveni članki
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
MF - Medicinska fakulteta
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2025
Št. strani:Str. 1-5
Številčenje:Vol. 68, no. 3
PID:20.500.12556/RUL-179378 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:577
ISSN pri članku:1854-3073
DOI:10.14720/abs.68.3.21898 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:239702787 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:12.02.2026
Število ogledov:221
Število prenosov:92
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Acta biologica slovenica
Založnik:Društvo biologov Slovenije, Društvo biologov Slovenije, Založba Univerze v Ljubljani, Društvo biologov Slovenije
ISSN:1854-3073
COBISS.SI-ID:221921024 Povezava se odpre v novem oknu

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Naslov:Uspešno čiščenje DNK iz agaroznih čepkov PFGE za sekvenciranje celotnega genoma
Izvleček:
Sekvenciranje celotnega genoma (WGS) je nadomestilo tipizacijo bakterij na osnovi gelske pulzne elektroforeze (PFGE) kot referenčne metode genotipizacije. Raziskali smo primernost genomske DNA, očiščene iz agaroznih čepkov PFGE, shranjenih v laboratorijski zbirki, za WGS v primerih, ko bakterijski izolati niso več na voljo. Naša študija je pokazala, da je bakterijski WGS mogoče uspešno izvesti na DNA, očiščeni iz agaroznih čepkov PFGE.

Ključne besede:čiščenje DNA, čepki PFGE, genotipizacija, bakterijski izolati, WGS

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj