Podrobno

Proceduralno generiranje oblik mitohondrijev in Golgijevih aparatov z uporabo statističnih modelov
ID Šmaljcelj, Aljaž (Avtor), ID Bohak, Ciril (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (5,32 MB)
MD5: 02E486A1AF8CCC607D694DA20ED41792

Izvleček
Razumevanje morfologije celičnih organelov je eden izmed pogojev razumevanja njihovega delovanja. Oblika lahko odgovori na vprašanje, zakaj določeni procesi potekajo na določen način. V delu predstavimo statistično modeliranje oblike mitohondrija in Golgijevega aparata. Za vsakega od organelov izmerimo razdalje do karakterističnih točk na njihovih površjih in jih statistično analiziramo. Grobo obliko mitohondrija izpeljemo z ekstrakcijo skeleta in merjenja razdalje iz točk skeleta do površja. Pri Golgijevem aparatu iz celotne oblike identificiramo cisterne in za vsako izmerimo razdalje iz njenega centra do roba v karakteričnih smereh. Dobljene rezultate uporabimo za izpeljavo novih oblik, kjer nove razdalje vzorčimo iz statistične porazdelitve merjenih razdalj. Obliko dodatno prilagodimo s spreminjanjem vhodnih parametrov. Nove oblike preverimo s primerjavo opisanih razdalj s primerki testne množice. Dodatno poskusimo s kombinacijo različnih vhodnih parametrov izpeljati vizualno čim bolj podobno obliko primerka, ki ni bil vključen v statistično analizo. Oblike mitohondrijev predstavljajo dober približek realni obliki, medtem ko oblike Golgijevega aparata nekoliko manj, za kar bi lahko bile krive številne predpostavke in poenostavitve oblike tekom statistične analize.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:mitohondrij, Golgijev aparat, statistični model oblike, generiranje novih oblik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-170519 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:243053571 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:08.07.2025
Število ogledov:485
Število prenosov:147
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Procedural generation of mitochondria and Golgi apparatus shapes with the use of statistical models
Izvleček:
Understanding the morphology of cellular organelles is one of the prerequisites to understanding their function. Shape can help explain why do certain biological processes work in a specific manner. In this work, we present statistical shape modelling of mitochondria and Golgi apparatus. For each organelle we measured the distances to the characteristic points on their surface and performed statistical analysis. We obtained approximated mitochondria shape by extracting skeleton and measuring distances from skeleton points to the surface. For Golgi apparatus, we extracted each cisternae and measured distances from their centers to the edges in each characteristic direction. Obtained results are used to generate new shapes, new distances are sampled from the statistical distribution of the measured distances which can be further refined by adjusting input parameters. New shapes are validated by comparing the distances from objects in test set. Additionally, we attempt to generate a visually similar shape of a sample not included in the statistical analysis. Derived mitochondria shapes present closely approximate real shapes, while derived Golgi apparatus shapes a little less so, possibly due to multiple assumptions and simplifications made during statistical analysis.

Ključne besede:mitochondrion, Golgi apparatus, statistical shape model, new shape generation

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj