20.500.12556/RUL-170519 Proceduralno generiranje oblik mitohondrijev in Golgijevih aparatov z uporabo statističnih modelov Procedural generation of mitochondria and Golgi apparatus shapes with the use of statistical models Razumevanje morfologije celičnih organelov je eden izmed pogojev razumevanja njihovega delovanja. Oblika lahko odgovori na vprašanje, zakaj določeni procesi potekajo na določen način. V delu predstavimo statistično modeliranje oblike mitohondrija in Golgijevega aparata. Za vsakega od organelov izmerimo razdalje do karakterističnih točk na njihovih površjih in jih statistično analiziramo. Grobo obliko mitohondrija izpeljemo z ekstrakcijo skeleta in merjenja razdalje iz točk skeleta do površja. Pri Golgijevem aparatu iz celotne oblike identificiramo cisterne in za vsako izmerimo razdalje iz njenega centra do roba v karakteričnih smereh. Dobljene rezultate uporabimo za izpeljavo novih oblik, kjer nove razdalje vzorčimo iz statistične porazdelitve merjenih razdalj. Obliko dodatno prilagodimo s spreminjanjem vhodnih parametrov. Nove oblike preverimo s primerjavo opisanih razdalj s primerki testne množice. Dodatno poskusimo s kombinacijo različnih vhodnih parametrov izpeljati vizualno čim bolj podobno obliko primerka, ki ni bil vključen v statistično analizo. Oblike mitohondrijev predstavljajo dober približek realni obliki, medtem ko oblike Golgijevega aparata nekoliko manj, za kar bi lahko bile krive številne predpostavke in poenostavitve oblike tekom statistične analize. Understanding the morphology of cellular organelles is one of the prerequisites to understanding their function. Shape can help explain why do certain biological processes work in a specific manner. In this work, we present statistical shape modelling of mitochondria and Golgi apparatus. For each organelle we measured the distances to the characteristic points on their surface and performed statistical analysis. We obtained approximated mitochondria shape by extracting skeleton and measuring distances from skeleton points to the surface. For Golgi apparatus, we extracted each cisternae and measured distances from their centers to the edges in each characteristic direction. Obtained results are used to generate new shapes, new distances are sampled from the statistical distribution of the measured distances which can be further refined by adjusting input parameters. New shapes are validated by comparing the distances from objects in test set. Additionally, we attempt to generate a visually similar shape of a sample not included in the statistical analysis. Derived mitochondria shapes present closely approximate real shapes, while derived Golgi apparatus shapes a little less so, possibly due to multiple assumptions and simplifications made during statistical analysis. mitohondrij Golgijev aparat statistični model oblike generiranje novih oblik mitochondrion Golgi apparatus statistical shape model new shape generation true false false Slovenski jezik Angleški jezik Magistrsko delo/naloga 2025-07-08 10:40:02 2025-07-08 10:40:11 2025-07-18 12:16:32 0000-00-00 00:00:00 2025 0 0 0000-00-00 NiDoloceno NiDoloceno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 37779 243053571 Smaljcelj_Aljaz_-_Proceduralno_generiranje_oblik_mitohondrijev_in_Golgijevih_aparatov_z_uporabo_.pdf Smaljcelj_Aljaz_-_Proceduralno_generiranje_oblik_mitohondrijev_in_Golgijevih_aparatov_z_uporabo_.pdf 1 02E486A1AF8CCC607D694DA20ED41792 0834478f0284f73109d59866bc4b864dd84ad610d5b2f4603bca673fa9f9fcd4 4018a413-5bd5-11f0-b232-0050569b8976 https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?lang=slv&id=212542 Fakulteta za računalništvo in informatiko 0 0 0