izpis_h1_title_alt

Thermodynamic origin of the linear pressure dependence of DNA thermal stability
ID Lah, Jurij (Avtor), ID Hadži, San (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,48 MB)
MD5: 29BC61FEE2B5FF2CDE55DC2A736C2ABA
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.4c01563 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
High pressure affects the structure and function of DNA and is a key parameter for studying the origin and physical limits of life. Different types of DNA structures systematically show a linear pressure dependence of thermal stability (up to ∼200 MPa), which is maintained even when the solution composition is changed. The reasons behind the linear pressure dependence are not understood. We have performed a thermodynamic analysis of the pressure-, temperature- and composition-dependent (un)folding of various polynucleotide duplexes and G-quadruplexes. We demonstrate that the reason for the observed linearity is the link between compressibility and expansibility, both of which largely depend on DNA hydration. We predicted the temperature and pressure dependence of compressibility and expansibility of (un)folding and explain how they affect the corresponding volume change and thermodynamic stability parameters. These predictions indicate the existence of a convergence temperature at which compressibility and volume of (un)folding simultaneously become equal to zero.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:biomolecules, DNA, G-quadruplex, stability, pressure, volume, compressibility, expansibility, biopolymers, genetics, hydration
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2024
Št. strani:Str. 9064-9069
Številčenje:Vol. 15, iss. 35
PID:20.500.12556/RUL-161265-99fd15cd-a9db-9717-942c-1979723a1e93 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:577.323
ISSN pri članku:1948-7185
DOI:10.1021/acs.jpclett.4c01563 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:205693699 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:09.09.2024
Število ogledov:159
Število prenosov:57
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:The journal of physical chemistry letters
Skrajšan naslov:J. phys. chem. lett.
Založnik:American Chemical Society
ISSN:1948-7185
COBISS.SI-ID:516049689 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biomolekule, DNA, G-kvadrupleks, stabilnost, tlak, volumen, stisljivost, razteznost

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0201
Naslov:Fizikalna kemija

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-50026
Naslov:Vloga novega sekvenčnega motiva, bogatega z alanini, pri kondenzaciji RNA-vezavnih proteinov

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj