izpis_h1_title_alt

Detection of herpes simplex and varicella-zoster virus from skin lesions : comparison of RT-PCR and isothermal amplification for rapid identification
ID Jevšnik Virant, Monika (Avtor), ID Lusa, Lara (Avtor), ID Uršič, Tina (Avtor), ID Glinšek Biškup, Urška (Avtor), ID Petrovec, Miroslav (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (520,34 KB)
MD5: F11B4D1308F4C4C92CB4D5029B8E4B38
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0732889319311071 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
We compared 2 molecular tests for detection of herpes simplex viruses 1 and 2 (HSV-1, HSV-2) and varicella-zoster virus (VZV): real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) (Argene, BioMerieux, France) performed on an LC480 platform (Roche Applied Science, Mannheim, Germany) and isothermal amplification using a Solana HSV1 + 2/VZV assay (Quidel Corporation Worldwide Headquarters, San Diego, CA) with helicase-dependent amplification performed by a Solana® instrument. With both methods, HSV-1 was detected in 68/291 (23.4%), HSV-2 in 23/291 (7.9%), and VZV in 48/291 (16.5%) skin lesions. Both methods agreed completely only in detection of HSV-2 (kappa = 1). Concordance between Solana HSV1 + 2/VZV and RT-PCR was 98.3% (kappa = 0.95) for HSV-1 and 99.3% (kappa = 0.98) for VZV. Rapid detection of HSV-1, HSV-2, and VZV using the Solana platform is a useful method for routine diagnostics and for urgent swab samples requiring a short turnaround time.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:herpes simplex virus, varicella-zoster virus, skin lesion, isothermal amplification, herpes simplex virus 1, herpes simplex virus 2
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2020
Št. strani:4 str.
Številčenje:Vol. 97, iss. 2, art. 115015
PID:20.500.12556/RUL-137783 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:616.5
ISSN pri članku:1879-0070
DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2020.115015 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:34704857 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:30.06.2022
Število ogledov:543
Število prenosov:103
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Diagnostic microbiology and infectious disease
Založnik:Elsevier
ISSN:1879-0070
COBISS.SI-ID:23142149 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:herpesvirus, virus varicella zoster, lezija kože, virus herpes simpleks tip 1, virus herpes simpleks tip 2

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P3-0083
Naslov:Odnosi parazitskega obstajanja

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj