Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
Towards the well-tempered chloroplast DNA sequences
ID
Turudić, Ante
(
Avtor
),
ID
Liber, Zlatko
(
Avtor
),
ID
Grdiša, Martina
(
Avtor
),
ID
Jakše, Jernej
(
Avtor
),
ID
Varga, Filip
(
Avtor
),
ID
Šatović, Zlatko
(
Avtor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(1,45 MB)
MD5: B7D0458E485C74F09C71EA779FEC6513
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://www.mdpi.com/2223-7747/10/7/1360
Galerija slik
Izvleček
With the development of next-generation sequencing technology and bioinformatics tools, the process of assembling DNA sequences has become cheaper and easier, especially in the case of much shorter organelle genomes. The number of available DNA sequences of complete chloroplast genomes in public genetic databases is constantly increasing and the data are widely used in plant phylogenetic and biotechnological research. In this work, we investigated possible inconsistencies in the stored form of publicly available chloroplast genome sequence data. The impact of these inconsistencies on the results of the phylogenetic analysis was investigated and the bioinformatic solution to identify and correct inconsistencies was implemented. The whole procedure was demonstrated using five plant families (Apiaceae, Asteraceae, Campanulaceae, Lamiaceae and Rosaceae) as examples.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
chloroplast genome
,
genome assembly
,
standardization
,
cyclic shift
,
inversion
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
BF - Biotehniška fakulteta
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2021
Št. strani:
14 str.
Številčenje:
Vol. 10, iss. 7, art. 1360
PID:
20.500.12556/RUL-135742
UDK:
602
ISSN pri članku:
2223-7747
DOI:
10.3390/plants10071360
COBISS.SI-ID:
69203459
Datum objave v RUL:
30.03.2022
Število ogledov:
1472
Število prenosov:
107
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
Plants
Skrajšan naslov:
Plants
Založnik:
MDPI
ISSN:
2223-7747
COBISS.SI-ID:
523345433
Licence
Licenca:
CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:
To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:
02.07.2021
Sekundarni jezik
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
bioinformatika
,
kloroplasti
,
genom
,
sekvenciranje genoma
,
filogenetske analize
,
filogenetske metode
Projekti
Financer:
Drugi - Drug financer ali več financerjev
Številka projekta:
KK.01.1.1.01.0005
Naslov:
Biodiversity and Molecular Plant Breeding
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj