izpis_h1_title_alt

Optimizacija priprave rekombinantnega monomernega proteina lizenina in njegovih por
ID Štromajer, Eva (Avtor), ID Podobnik, Marjetka (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,35 MB)
MD5: 78415DC5BC5524BDA3DF9D8EB7A8BF79

Izvleček
Lizenin je proteinski toksin iz deževnika Eisenia foetida, ki tvori pore v lipidnih membranah. V celici nastaja v monomeri obliki in ob prepoznavanju tarčnih membranskih lipidov, predvsem sfingomielina, tvori najprej predporo iz 9 monomernih enot. Kasneje pride ob večjih konformacijskih spremembah do vsidranja tega oligomera v lipidni dvosloj in nastanka transmembranske pore. Lizeninska pora je zaradi svojih edinstvenih strukturnih, biokemijskih in biofizikalnih lastnosti zanimiva za uporabo v biotehnoloških aplikacijah. Za ta namen je ključno čim bolj učinkovito izražanje in čiščenje rekombinantnega monomernega proteina iz bakterijske celične suspenzije. V nalogi smo izvedli optimizacijo priprave monomerega proteina, vse od priprave ustreznega plazmidnega konstrukta, do postopkov čiščenja monomerega proteina in biološko aktivne pore. Za izboljšanje postopkov čiščenja smo izdelali plazmidni konstrukt za izražanje proteina v bakterijskih celicah, ki ima na C-koncu polihistidinski repek, kar omogoča čiščenje proteina z afinitetno kromatografijo. Položaj afinitetnega repka na C-koncu se je tekom poskusa izkazal za izboljšavo v primerjavi s položajem repka na N-koncu lizenina, saj smo na ta način iz suspenzije pridobili dvakrat večjo količino čistega proteina. Po izolaciji in čiščenju monomera smo porotvorno aktivnost lizenina preverili s testom hemolize, pravilnost zvitja pa smo preverili z merjenjem spektra cirkularnega dikroizma. Iz monomerov lizenina smo tudi pripravili pore na umetnih sistemih lipidnih membran, jih tudi izolirali in očistili.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biotehnologija, lizenin, monomeri rekombinantni protein, porotvorni protein, kromatografija, čiščenje proteina, Ni-NTA kromatografija, polihistidinski repek, tvorba pore, lipidni dvosloj
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Založnik:[E. Štromajer]
Leto izida:2019
PID:20.500.12556/RUL-112666 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:577
COBISS.SI-ID:6732826 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:31.10.2019
Število ogledov:1482
Število prenosov:251
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Optimization of preparation of monomeric protein lysenin and its pore
Izvleček:
Lysenin is a protein toxin from the earthworm Eisenia fetida which forms pores in lipid membranes. It is produced as a water-soluble monomer in cells, which binds to sphingomyelin containing lipid membranes. Upon binding, it forms nonameric pre-pores on the surface on membranes, which undergo large conformational changes in order to insert into membranes and form functional pores. Lysenin pore has unique structural, biochemical and biophysical properties and that is why lysenin pore is very interesting for use in different biotechnological applications. For these purposes, it is crucial to have efficient expression and purification system to produce sufficient amounts of pure monomeric recombinant protein. In this master thesis, we performed optimization of monomeric protein lysenin preparation, from plasmid construction to purification method as well as pore assembly. For purification method improvement, we designed a recombinant plasmid vector for bacterial expression of a protein with C-terminal polyhistidine tag, which enables affinity chromatography purification of lysenin. Change of polyhistidine tag position on lysenin from N- to C-terminus turned out as an improvement. Namely, in the case of polyhistidne tag at the C-terminus the yield was two times higher in comparison with N-terminally tagged protein. After efficient isolation and purification of monomeric lysenin we tested its pore forming activity and checked the correct folding via circular dichroism. Moreover, we assembled lysenin pores on model lipid membranes and isolated and purified them.

Ključne besede:biotechnology, lysenin, monomer recombinant protein, pore-forming protein, chromatography purification, Ni-NTA chromatography, pore assembly, polyhistidine tag

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj