Podrobno

Uporaba sistemske biologije za odkrivanje kandidatnih genov za nalaganje maščobe pri človeku
ID Lorenčič, Gabrijela (Avtor), ID Kunej, Tanja (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,38 MB)
MD5: 4D84BBADE5338292005CA9E0ED9AE5A0

Izvleček
Debelost je kompleksna bolezen, ki nastane zaradi presežka energije in jo spremljajo številne komorbidnosti. Njen razvoj je močno povezan z genetskimi in epigenetskimi dejavniki, ki vplivajo na nalaganje maščobnega tkiva. Namen magistrske naloge je bil posodobiti zbirko genov, povezanih z nalaganjem maščobe pri človeku, ter z uporabo pristopov sistemske biologije določiti zanesljivejše kandidatne lokuse in biološke poti, ki sodelujejo pri uravnavanju tega procesa. V prvem delu smo zbirko genov za debelost posodobili z novimi podatki iz literature, objavljene po letu 2017, ter uskladili identifikatorje genov s trenutno veljavno nomenklaturo HGNC. Z obogatitveno analizo kandidatnih genov smo določili več bioloških poti, med katerimi so pot inzulinske signalizacije, celični odziv na inzulinski dražljaj, inzulinska rezistenca in pot PI3K-AKT-mTOR, kar je skladno s predhodno objavljeno literaturo. Z analizo genomske razporeditve genov povezanih z debelostjo, smo ugotovili regije z večjo gostoto, ki sicer same po sebi ne omogočajo sklepanja o obstoju funkcionalnih modulov, lahko pa nakazujejo potencialno relevantno genomsko organizacijo za regulacijo nalaganja maščobe. Čeprav prostorska bližina genov sama po sebi ne omogoča sklepanja o obstoju funkcionalnih modulov, lahko ta rezultat nakazuje genomsko organizacijo, ki je potencialno relevantna za regulacijo nalaganja maščobe. Identificirane regije zato predstavljajo izhodišče za nadaljnje raziskave, ki bi z vključitvijo ekspresijskih ali funkcijskih podatkov omogočile interpretacijo njihovega pomena. Rezultati dopolnjujejo obstoječe zbirke in poglabljajo razumevanje genetskega ozadja nalaganja maščobe pri človeku. Zbirka predstavlja pomemben vmesni korak k vzpostavitvi odprtega raziskovalnega orodja v prihodnosti. Njena zasnova omogoča sprotno posodabljanje podatkov in integracijo v nadaljnje bioinformacijske analize, kar bo v prihodnje olajšalo preučevanje bioloških poti ter prispevalo k prepoznavanju novih kandidatnih genov, povezanih z debelostjo in sopojavnimi boleznimi.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biotehnologija, debelost, nalaganje maščobe, sesalci, podatkovna zbirka, biološka pot
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2026
PID:20.500.12556/RUL-180715 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:15.03.2026
Število ogledov:22
Število prenosov:2
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Identification of genes involved in human fat deposition using systems biology
Izvleček:
Obesity is a complex disease caused by chronic energy imbalance and is associated with numerous comorbidities. Its development is strongly influenced by genetic and epigenetic factors involved in adipose tissue accumulation. The aim of this master’s thesis was to update a collection of genes associated with fat deposition in humans and, through a systems biology approach, to identify more robust candidate loci and biological pathways involved in the regulation of this process. In the first phase, the gene collection was updated using data from the literature published after 2017, and gene identifiers were harmonised according to the current HGNC nomenclature. Enrichment analysis of the candidate genes identified several biological pathways, including insulin signalling, cellular response to insulin stimulus, insulin resistance, and the PI3K–AKT–mTOR pathway, in agreement with previously published studies. Analysis of the genomic distribution of obesity-associated genes revealed regions of increased gene density. Although spatial clustering alone does not permit direct conclusions regarding the presence of functional modules, it may indicate a genomic organisation potentially relevant to the regulation of fat accumulation. These regions therefore provide a basis for further studies incorporating expression or functional data to enable a more comprehensive interpretation of their biological significance. The findings complement existing resources and contribute to a deeper understanding of the genetic basis of fat deposition in humans. The resulting dataset represents an important intermediate step towards the development of an open research resource that will enable continuous updating and integration into future bioinformatic analyses.

Ključne besede:biotechnology, obesity, fat deposition, database, gene map, biological pathway

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj