izpis_h1_title_alt

Comparison of methods for relative quantification of gene expression using real-time PCR
Bolha, Luka (Avtor), Dušanić, Daliborka (Avtor), Narat, Mojca (Avtor), Oven, Irena (Avtor)

URLURL - Predstavitvena datoteka, za dostop obiščite http://aas.bf.uni-lj.si/zootehnika/100-2012/PDF/100-2012-2-97-106.pdf Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Quantitative real-time PCR (qPCR) has become a widely used tool for quantifying gene expression. Several methods for relative quantification have been developed, enabling rapid and reliable detection and quantification of specific nucleic acids. These methods, based on qPCR include: the standard curve method, the efficiency calibrated method and the 2[-deltadelta]Cq method. Here we analyzed if these three methods generate comparable results. To evaluate their performance, we analyzed the expression of the nuclease gene MS53_0284 from Mycoplasma synoviae type strain WVU 1853 during in vitro infection of CEC-32 cells, using qPCR. As determined, all three methods generated comparable and reliable results when all necessary conditions were fulfiled. Also, the efficiency calibrated and the standard curve methods were more suitable for quantifying small differences in relative gene expression than the 2[-deltadelta]Cq method.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:molecular genetics, genes, gene expression, quantitative real-time PCR, methods
Vrsta gradiva:Delo ni kategorizirano (r6)
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2012
Št. strani:str. 97-106
Številčenje:Letn. 100, št. 2
UDK:575
ISSN pri članku:1581-9175
COBISS.SI-ID:3162504 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:947
Število prenosov:267
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Gradivo je del revije

Naslov:Acta agriculturae Slovenica
Skrajšan naslov:Acta agric. Slov.
Založnik:Biotehniška fakulteta
ISSN:1581-9175
COBISS.SI-ID:213840640 Povezava se odpre v novem oknu

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Izvleček:
Metoda kvantitativne verižne reakcije s polimerazo v realnem času (qPCR) je postala najpogosteje uporabljen način analize izražanja genov. Razvitih je bilo več metod za relativno kvantifikacijo genske ekspresije, ki omogočajo hitro in zanesljivo detekcijo ter kvantifikacijo specifičnih nukleinskih kislin. Mednje spadajo: metoda z umeritveno krivuljo, metoda z upoštevanjem učinkovitosti pomnoževanja in metoda po enačbi 2[-deltadelta]Cq. V tej študiji smo z analizirajem izražanja gena MS53_0284, ki kodira nukleazo pri bakteriji Mycoplasma synoviae WVU 1853, po okužbi celic CEC-32 in vitro s qPCR preverili primerljivost rezultatov, dobljenih z uporabo omenjenih metod. Pokazali smo, da z upoštevanjem potrebnih pogojev z omenjenimi metodami pridobimo primerljive rezultate ter da sta metoda z umeritveno krivuljo in metoda z upoštevanjem učinkovitosti pomnoževanja primernejši za ugotavljanje majhnih razlik v izražanju genov kot metoda po enačbi 2[-deltadelta]Cq.

Ključne besede:molekularna genetika, geni, gensko izražanje, kvantitativni PCR v realnem času, metode

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj