Podrobno

Multi-modal medical image segmentation using deep learning
ID Podobnik, Gašper (Avtor), ID Vrtovec, Tomaž (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Ibragimov, Bulat (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (35,15 MB)
MD5: 13A425E6E31B2417805C407177B1A906

Izvleček
Cancer remains one of the major socioeconomic challenges of modern times. It is among the three leading causes of death globally, accounting for an estimated 9.7 million deaths annually. Over the years, various treatment modalities have been developed, with surgery, chemotherapy, and RT being the most widely adopted. While each treatment modality has its limitations, RT offers several advantages: unlike surgery, which is invasive and applicable to only a subset of tumor types, and chemotherapy, which often causes systemic side effects, RT is a localized or regional treatment that can better preserve anatomical structures. The objective of RT is to deliver a high dose of ionizing radiation to the target volumes (tumor and associated lymph nodes) while sparing nearby healthy structures critical to bodily function, known as organs-at-risk (OARs). A standard RT workflow begins with acquiring a planning CT scan, followed by manual delineation of OARs and target volumes. These delineations are then used in a treatment planning process that optimizes beam configurations within the linear accelerator (LINAC), ensuring that the prescribed dose is delivered to target volumes while satisfying the dosimetric constraints for the surrounding OARs. Manual contouring is laborious, time-consuming, and subject to both intra- and inter-observer variability. Automating the OAR delineation step has the potential to significantly streamline the RT planning process, reduce variability, and enable a broader adoption of adaptive RT, an approach often hindered by current time and resource constraints. However, given the high clinical stakes, auto-segmentation methods need to achieve a high level of accuracy. This is particularly challenging in anatomically complex regions such as the head and neck, where CT images often lack sufficient soft-tissue contrast. To address this issue, clinicians routinely supplement CT with MR imaging to support manual delineation. Similarly, leveraging complementary information from both modalities in the design and development of automatic methods may enhance segmentation quality, especially for structures that are poorly defined on CT alone. Motivated by the aforementioned issues and challenges, the primary focus of this thesis is to investigate the hypothesis that multi-modal image segmentation can improve the quality of OAR segmentation for RT planning. We approach this problem comprehensively: first, by constructing a paired CT-MR dataset with expert annotations; second, by developing a novel multi-modal segmentation method and organizing an international computational challenge to benchmark competing approaches; and third, by conducting an in-depth performance evaluation of auto-segmentation methods.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:segmentation, deep learning, radiation therapy, computed tomography, magnetic resonance, head and neck cancer, organs-at-risk
Vrsta gradiva:Doktorsko delo/naloga
Tipologija:2.08 - Doktorska disertacija
Organizacija:FE - Fakulteta za elektrotehniko
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-173577 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:253332739 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:18.09.2025
Število ogledov:280
Število prenosov:68
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Naslov:Segmentacija večmodalnih medicinskih slik z uporabo globokega učenja
Izvleček:
Rak je eden najpomembnejših socialno-ekonomskih izzivov sodobnega časa. Spada med tri vodilne vzroke smrti na svetu in po statističnih podatkih povzroči kar 9,7 milijonov smrti letno. Med najbolj uveljavljene pristope zdravljenja spadajo kirurška odstranitev tumorja, kemoterapija in RT. V primerjavi s kirurškim pristopom, ki je običajno precej invaziven in se uporablja samo za omejen nabor tumorjev, in v primerjavi s kemoterapijo, ki pogosto povzroči sistemske stranske učinke, je zdravljenje z RT bolj lokalno in posledično bolje ohrani okoliške anatomske strukture. Cilj RT je zagotoviti visok odmerek ionizirajočega sevanja v tarčne strukture (v tumor in povezane bezgavke), hkrati pa čim manj obsevati okoliške zdrave organe, za katere se pogosto uporablja izraz kritični organi (ang organs-at-risk, OARs), ki so ključnega pomena za normalno delovanje telesa. Običajni potek načrtovanja RT se začne z zajemom CT slike za načrtovanje, nato pa sledi ročno orisovanje kritičnih organov in tarčnih struktur. Ročne segmentacije se nato skupaj z načrtovalno CT sliko uporabijo v procesu načrtovanja RT, v katerem se s pomočjo programske opreme optimizira konfiguracija žarkov znotraj linearnega pospeševalnika (ang linear accelerator, LINAC) tako, da tarčne strukture dobijo predpisani odmerek sevanja, hkrati pa se v čim večji meri izpolni dozimetrične omejitve za okoliške kritične organe. Ročno orisovanje kritičnih organov je zamudno, naporno in podvrženo variabilnosti tako med različnimi orisovalci kot tudi med ponovljenimi orisi istega orisovalca. Avtomatizacija postopka segmentacije kritičnih organov lahko zato znatno skrajša postopek načrtovanja RT, zmanjša variabilnosti orisovanja ter odpira možnosti za uporabo adaptivne RT, kjer prav časovna potratnost ročnega orisovanja kritičnih organov predstavlja enega ključnih izzivov. Zaradi morebitnih tveganj, povezanih z napakami pri orisovanju kritičnih organov, se od metod samodejne segmentacije zahteva visoko stopnjo natančnosti in zanesljivosti. To je še posebej zahtevno v anatomsko kompleksnih predelih, kot je področje glave in vratu (ang head and neck), kjer CT slike pogosto ne omogočajo zadostnega kontrasta mehkih tkiv. Zato zdravniki v klinični praksi rutinsko zajamejo pomožne MR slike, ki olajšajo ročno orisovanje le-teh. Enak pristop združevanja slikovnih informacij iz dveh komplementarnih modalitet pa se lahko uporabi tudi za izboljšanje učinkovitosti samodejne segmentacije, zlasti za strukture, ki so na CT slikah slabše vidne. V doktorski nalogi preučimo hipotezo ali lahko večmodalna segmentacija na podlagi CT in MR slik izboljša kakovost segmentacije kritičnih organov za načrtovanje RT. Problem obravnavamo celovito: najprej predstavimo podatkovno zbirko parov CT in MR slik z referenčnimi orisi kritičnih organov, nato predstavimo razvito metodo za samodejno večmodalno segmentacijo ter primerjalno analizo rezultatov mednarodnega računskega izziva, ter zaključimo s poglobljeno analizo klinične uporabnosti metod samodejne segmentacije kritičnih organov.

Ključne besede:segmentacija, globoko učenje, radioterapija, računalniška tomografija, magnetna resonanca, rak glave in vratu, kritični organi

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj