Podrobno

Vpliv bakrovih ionov na vezavo N-acetil-D-laktozamina na lizocim
ID Bregar, Jana (Avtor), ID Hribar Lee, Barbara (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (851,88 KB)
MD5: 867B26E269D90712BC61BCA4778162A5

Izvleček
Porušena homeostaza kovinskih ionov lahko vodi do oksidativnega stresa, ki spodbuja nepravilno zvijanje in agregacijo proteinov, kar je povezano z različnimi patološkimi stanji. V sklopu diplomskega dela smo raziskali vpliv bakrovih (Cu$^{2+}$) ionov na vezavo N-acetil-D-laktozamina (LacNAc) na lizocim iz kokošjega jajčnega beljaka (HEWL). Vezavo LacNAc na HEWL in vpliv Cu$^{2+}$ ionov smo spremljali z UV-Vis in fluorescentno spektroskopijo. Vpliv Cu$^{2+}$ ionov na sekundarno strukturo in termostabilnost HEWL smo spremljali z CD-spektroskopijo in diferenčno dinamično kalorimetrijo (DSC). Mesto vezave LacNAc na HEWL smo napovedali z molekulskim sidranjem. Z analizo fluorescentnih emisijskih spektrov smo potrdili vezavo LacNAc na HEWL in da Cu$^{2+}$ ioni spremenijo interakcijo med LacNAc in HEWL. Z molekulskim sidranjem smo napovedali, da se LacNAc veže v vrzel aktivnega mesta. Iz elektrostatskega potenciala na HEWL je razvidno, da je v vrzeli aktivnega mesta področje z negativnim potencialom, ki lahko predstavlja potencialno vezavno mesto za Cu$^{2+}$ ione. Cu$^{2+}$ ioni pod preiskovanimi pogoji niso povzročili opaznih sprememb v sekundarni strukturi in niso povzročili signifikantne destabilizacije HEWL. Iz teh rezultatov smo sklepali, da Cu$^{2+}$ ioni vplivajo na vezavo LacNAc na HEWL tako, da tekmujejo za isto vezavno mesto.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:vezava, lizocim, N-acetil-D-laktozamin, bakrovi ioni
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-171840 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:252460291 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:03.09.2025
Število ogledov:184
Število prenosov:36
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:The influence of copper ions on the binding of N-acetyl-D-lactosamine to lysozyme
Izvleček:
Disruption of metal ion homeostasis can lead to oxidative stress, which promotes protein misfolding and aggregation linked to several pathological conditions. The aim of our research was to investigate the influence of copper (Cu$^{2+}$) ions on the binding of N-acetyl-D-lactosamine (LacNAc) to hen egg white lysozyme (HEWL). UV-Vis and fluorescence spectroscopy were used to monitor the interaction between LacNAc, Cu$^{2+}$ ions and HEWL. The effect of copper ions on the secondary structure and the thermostability of HEWL were assessed using circular dichroism (CD) spectroscopy and differential scanning calorimetry (DSC), respectively. Molecular docking was used to predict the location of the binding site of LacNAc on HEWL. Fluorescence emission spectra analysis confirmed the binding of LacNAc to HEWL and indicated that Cu$^{2+}$ ions modulate the interaction between LacNAc and HEWL. Molecular docking predicted that LacNAc binds in the active site cleft of HEWL. The electrostatic potential map for HEWL showed an area with negative potential within the active site cleft, which could be a possible binding site for Cu$^{2+}$ ions. Cu$^{2+}$ ions do not cause substantial changes in the protein’s secondary structure under the conditions studied and they do not significantly destabilize HEWL. From these results, we suggest that Cu$^{2+}$ ions modulate the binding of LacNAc by competing for a common binding site.

Ključne besede:binding, lysozyme, N-acetyl-D-lactosamine, copper ions

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj