Podrobno

Molekulska dinamika solvatacije nepolarnega topljenca v dvodimenzionalnem modelu vode
ID Andolšek, Katja (Avtor), ID Urbič, Tomaž (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,86 MB)
MD5: 8EAAA0F6A290BCC62D69923FB1391C86

Izvleček
Z računalniškimi simulacijami molekulske dinamike smo preučevali lastnosti solvatacije Lennard-Jonesovega (LJ) diska v 2D modelu vode Mercedes-Benz (MB). Simulacije so potekale v NPT ansamblu. Z metodo termodinamične integracije s sklopitvenim parametrom smo računali Gibbsovo prosto energijo solvatacije nepolarnega topljenca v vodi. Preučevali smo tudi odvisnost le-te od temperature, tlaka in velikosti LJ delca. Za modeliranje interakcije med LJ in MB delci smo uporabili tri različne potenciale, od tega dva mehko-jedrna. Analizirali smo ponovljivost rezultatov in učinkovitost simulacij ter predlagali možne izboljšave.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:molekulska dinamika, model Mercedes-Benz, NPT ansambel, termodinamična integracija, mehko-jedrni potencial
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-171763 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:251692547 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:02.09.2025
Število ogledov:453
Število prenosov:143
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Molecular Dynamics of Solvation of a Nonpolar Solute in a Two-Dimensional Water Model
Izvleček:
Using molecular dynamics computer simulations, we studied the solvation properties of a Lennard–Jones (LJ) disk in a 2D Mercedes–Benz (MB) water model. The simulations were carried out in the NPT ensemble. Employing the thermodynamic integration method with a coupling parameter, we calculated the Gibbs free energy of solvation of a nonpolar solute in water. We also investigated its dependence on temperature, pressure, and the size of the LJ particle. To model the interaction between LJ and MB particles, we used three different potentials, two of which were soft-core. We analysed the reproducibility of the results and the efficiency of the simulations, and proposed possible improvements.

Ključne besede:molecular dynamics, Mercedes-Benz model, NPT ensemble, thermodynamic integration, soft-core potential

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj