Podrobno

Priprava skrajšanih oblik zunajcelične domene ADAM17 in analiza cepitve proteina EpCAM z njimi
ID Bratina, Aljaž (Avtor), ID Gaber, Aljaž (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (17,03 MB)
MD5: 988088618D4C9F8B1AE95FF441A01CA3

Izvleček
ADAM17 je ena izmed najpomembnejših metaloproteaz v človeškem telesu. Je transmembranska šedaza, ki v zunajceličnem prostoru omogoča odcep ektodomene več kot 90 substratom, med katere spada tudi protein EpCAM. EpCAM obstaja kot monomer ali v obliki cis-homodimera. ADAM17 lahko cepi monomerno obliko EpCAM, dimerne pa ne, saj je v takem kompleksu cepitveno mesto na EpCAM nedostopno. ADAM17 ima tudi adhezijske lastnosti. Zrela oblika ADAM17, ki nastane po odcepu prodomene, vsebuje šest domen. Zunajcelični del ADAM17 (ADAM17-EX) predstavljajo katalitična, disintegrinska in obmembranska domena ter regija CANDIS. Regulacija delovanja ADAM17 je kompleksen proces, ki zajema interakcije tega proteina z raznimi vezavnimi partnerji in celično membrano, ter tudi spreminjanje konformacije njegovih domen in interakcije med njimi. Da bi na strukturnem nivoju bolje razumeli pomen posameznih domen ADAM17 za njegovo aktivnost, smo obravnavali zunajcelični del ADAM17 in tri njegove skrajšane oblike: CAT (vsebuje katalitično domeno), CAT-DIS (vsebuje katalitično in disintegrinsko domeno) in CAT-DIS-MPD (vsebuje katalitično, disintegrinsko in obmembransko domeno). Izrazili in očistili smo konstrukta CAT in CAT-DIS. Da bi izboljšali selektivnost čiščenja konstruktov, ki vsebujejo katalitično domeno ADAM17, smo poskusili vzpostaviti metodo specifične afinitetne kromatografije, pri kateri smo kot stacionarno fazo uporabili prodomeno ADAM17. Kromatografsko kolono smo preizkusili s konstruktom ADAM17-EX, vendar uspešne elucije nismo dosegli. Nazadnje smo z očiščenim konstruktom CAT izvedli poskus cepitve zunajcelične domene proteina EpCAM, in sicer tako monomerne kot dimerne oblike. Cepitev nobene oblike ni bila uspešna.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:ADAM17, skrajšane oblike, afinitetna kromatografija, EpCAM, cepitev
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-171385 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:247611395 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:25.08.2025
Število ogledov:204
Število prenosov:51
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Preparation of truncated variants of the extracellular domain of ADAM17 and analysis of EpCAM cleavage with them
Izvleček:
ADAM17 is one of the key metalloproteinases in the human body. It is a transmembrane sheddase that facilitates the cleavage of the ectodomain of more than 90 substrates in the extracellular space, including the protein EpCAM. EpCAM can exist as a monomer or as a cis-homodimer. ADAM17 can cleave the monomeric form of EpCAM but not the dimeric form, as the cleavage site on EpCAM is inaccessible in such a complex. ADAM17 also exhibits adhesive properties. The mature form of ADAM17, generated upon prodomain removal, comprises six domains. Its extracellular region (ADAM17-EX) consists of the catalytic domain, the disintegrin domain, the membrane-proximal domain, and the CANDIS region. The regulation of ADAM17 activity is a complex process that involves interactions of this protein with various binding partners and the cell membrane, as well as conformational changes in its domains and interactions between them. To gain structural insights into the contribution of individual ADAM17 domains to its activity, we examined the extracellular region of ADAM17 and three truncated variants: CAT (containing the catalytic domain), CAT-DIS (containing the catalytic and disintegrin domains), and CAT-DIS-MPD (containing the catalytic, disintegrin, and membrane-proximal domains). We expressed and purified the CAT and CAT-DIS constructs. To improve the selectivity of purification for constructs containing the catalytic domain of ADAM17, we attempted to establish a method of specific affinity chromatography, using the ADAM17 prodomain as the stationary phase. We tested the chromatography column with the ADAM17-EX construct, but successful elution was not achieved. Finally, using the purified CAT construct, we analysed the cleavage of the EpCAM extracellular domain, both its monomeric and dimeric forms. Cleavage of neither form was successful.

Ključne besede:ADAM17, truncated variants, affinity chromatography, EpCAM, cleavage

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj