Podrobno

Membransko aktivni proteini praprotnic
ID Verhnjak, Tina (Avtor), ID Skočaj, Matej (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Strgulc Krajšek, Simona (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,65 MB)
MD5: 766262D490E74634EB148188921277CB

Izvleček
Večina biokemijskih analiz praprotnic je osredotočenih na raziskovanje njihovih sekundarnih metabolitov, manj pa je raziskav, ki analizirajo njihove proteine. Med biotehnološko zanimive proteine praprotnic lahko prištevamo insekticidne proteine. Nekateri bakterijski in glivni insekticidni proteini so se tako že izkazali za učinkovite v obliki transgenih rastlin. V raziskavi smo zato preverjali prisotnost proteinov s porotvorno aktivnostjo pri vrstah praprotnic, ki uspevajo v Sloveniji. V ta namen smo pripravili vodne izvlečke in preverjali njihov vpliv na celični model sesalca (goveji eritrociti) in žuželk (celična linija Sf9), z namenom, da bi ugotovili ali izvlečki izbranih vrst povzročajo lizo teh celic. Nadalje smo želeli preučiti ali se prisotni proteini vežejo na membranske lipidne receptorje. S kombinacijo rezultatov toksičnih testov in lipid-vezavnih študij smo želeli opredeliti, ali analizirane vrste praprotnic vsebujejo porotvorne lipid-vezavne proteine. Na podlagi presejalne analize smo dokazali prisotnost slednjih in ugotovili, da ima 89 % vrst nabranih praprotnic citotoksični učinek na žuželčje celice. Pri tem smo pri osmih vrstah citotoksično aktivnost pripisali delovanju proteinov, kar pomeni, da te vrste potencialno vsebujejo bioinsekticidne proteine in so kot take zanimive za biotehnološko uporabo. Med slednjimi izpostavljamo vrsti Lycopodium annotinum in Equisetum variegatum, katerih izvlečka sta pri tem izkazala največji potencial v okviru litične in citotoksične aktivnosti, kar smo pripisali delovanju membransko-aktivnih proteinov. Z namenom, da določimo aminokislinsko zaporedje lipid-vezavnih proteinov, smo uporabili metodo masne spektrometrije. Slednja metoda nam ni omogočila identifikacije posameznih proteinov. Vzrok za to so najverjetneje skopi podatki anotacije genov genomov praprotnic.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:praprotnice, membransko aktivni proteini, insekticidni proteini, citotoksičnost, masna spektrometrija
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Založnik:[T. Verhnjak]
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-169336 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:582.39:577.352.5(043.2)
COBISS.SI-ID:238659587 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:24.05.2025
Število ogledov:259
Število prenosov:64
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Membrane-active protein in pteridophytes
Izvleček:
Biochemical analyses of ferns have predominantly focused on investigating their secondary metabolites rather than proteins. Of particular interest are insecticidal proteins found in ferns, which hold potential for use as bioinsecticides. In this study, we aimed to identify the presence of pore-forming proteins in fern species growing in Slovenia. To achieve this, we prepared their aqueous extracts and exposed them to mammalian (bovine erythrocytes) and insect (Sf9 cell line) cellular models to assess whether the selected species induce cell lysis. Furthermore, we investigated whether the proteins from ferns bind to the membrane lipids. This would indicate that the lytic activities observed in the aqueous extracts are direct results of the activities of membrane-active proteins. Through screening analysis, we confirmed the presence of cytolytic proteins in ferns and determined that 89 % of the tested species exhibited a lytic effect on insect cells. In eight of these species, lytic activity was specifically attributed to protein activity, suggesting their potential as bioinsecticidal agents with biotechnological relevance. Among them, Lycopodium annotinum and Equisetum variegatum demonstrated the highest potential in terms of lytic and cytotoxic activity, likely due to the presence of membrane-active proteins. To determine the amino acid sequences of these proteins, we employed mass spectrometry. However, the analysis did not yield the expected results, which we attribute to the limited availability of fern genome databases.

Ključne besede:ferns, membrane-active proteins, insecticidal proteins, cytotoxicity, mass spectrometry

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj