Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
Mur ligase F as a new target for the flavonoids quercitrin, myricetin, and (–)-epicatechin
ID
Hrast, Martina
(
Avtor
),
ID
Zdovc, Irena
(
Avtor
),
ID
Kočevar Glavač, Nina
(
Avtor
),
ID
Gobec, Stanislav
(
Avtor
),
ID
Frlan, Rok
(
Avtor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(1,43 MB)
MD5: C2BA58CEC9A0B7986D051BFBE9678CBF
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://link.springer.com/article/10.1007/s10822-023-00535-z
Galerija slik
Izvleček
MurC, D, E, and F are ATP-dependent ligases involved in the stepwise assembly of the tetrapeptide stem of forming peptidoglycan. As highly conserved targets found exclusively in bacterial cells, they are of significant interest for antibacterial drug discovery. In this study, we employed a computer-aided molecular design approach to identify potential inhibitors of MurF. A biochemical inhibition assay was conducted, screening twenty-four flavonoids and related compounds against MurC-F, resulting in the identification of quercitrin, myricetin, and (–)-epicatechin as MurF inhibitors with IC$_{50}$ values of 143 µM, 139 µM, and 92 µM, respectively. Notably, (–)-epicatechin demonstrated mixed type inhibition with ATP and uncompetitive inhibition with D-Ala-D-Ala dipeptide and UM3DAP substrates. Furthermore, in silico analysis using Sitemap and subsequent docking analysis using Glide revealed two plausible binding sites for (–)-epicatechin. The study also investigated the crucial structural features required for activity, with a particular focus on the substitution pattern and hydroxyl group positions, which were found to be important for the activity. The study highlights the significance of computational approaches in targeting essential enzymes involved in bacterial peptidoglycan synthesis.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
MurF
,
quercitrin
,
myricetin
,
(–)-epicatechin
,
antibacterial activity
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
FFA - Fakulteta za farmacijo
VF - Veterinarska fakulteta
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2023
Št. strani:
Str. 721-733
Številčenje:
Vol. 37, iss. 12
PID:
20.500.12556/RUL-152205
UDK:
615.277.3
ISSN pri članku:
0920-654X
DOI:
10.1007/s10822-023-00535-z
COBISS.SI-ID:
167509251
Datum objave v RUL:
10.11.2023
Število ogledov:
657
Število prenosov:
46
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
Journal of computer-aided molecular design
Skrajšan naslov:
J. comput.-aided mol. des.
Založnik:
Springer Nature
ISSN:
0920-654X
COBISS.SI-ID:
2621223
Licence
Licenca:
CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:
To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Sekundarni jezik
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
MurF
,
kvercitrin
,
miricetin
,
(–)-epikatehin
,
antibakterijsko delovanje
,
farmacevtska kemija
,
tarčna zdravila
Projekti
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J1-2484
Naslov:
Razvoj protibakterijskih učinkovin z delovanjem na validirane tarče v biosintezi peptidoglikana
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P1-0208
Naslov:
Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P4-0092
Naslov:
Zdravje živali, okolje in varna hrana
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj