izpis_h1_title_alt

Optimization of cabbage (Brassica oleracea var. capitata L.) protoplast transformation for genome editing using CRISPR/Cas9
ID Stajič, Ester (Avtor), ID Kunej, Urban (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,54 MB)
MD5: 28674B3C2101555CE093788132D17857
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.frontiersin.org/journals/plant-science/articles/10.3389/fpls.2023.1245433/full Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Genome editing techniques, such as Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated systems (CRISPR/Cas9) are undoubtedly becoming an indispensable tool for improving food crops and tackling agricultural challenges. In the present study, key factors affecting transformation efficiency, such as PEG4000 concentration, incubation time, and plasmid amount were evaluated to achieve efficient delivery of CRISPR/Cas9 vector into cabbage protoplasts. Using amplicon sequencing, we confirmed a significant effect of PEG4000 concentration and incubation time on the induced target mutations. By optimizing the transformation protocol, editing efficiency of 26.4% was achieved with 40 µg of plasmid and 15 minutes incubation with 50% PEG4000. While these factors strongly affected the mutation rate, the viability of the transformed protoplasts remained high. Our findings would be useful for successful genome editing in cabbage and other brassicas, as well as in research areas such as gene function analysis and subcellular localization that rely on transient transformation methods in protoplasts.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:CRISPR/Cas9, genome editing, protoplasts, PEG-mediated transformation, Brassica oleracea var. capitata, B. oleracea
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2023
Št. strani:9 str.
Številčenje:Vol. 14, art. 1245433
PID:20.500.12556/RUL-151619 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:575
ISSN pri članku:1664-462X
DOI:10.3389/fpls.2023.1245433 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:168169731 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:12.10.2023
Število ogledov:549
Število prenosov:62
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Frontiers in plant science
Skrajšan naslov:Front. plant sci.
Založnik:Frontiers Media
ISSN:1664-462X
COBISS.SI-ID:3011663 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:zelje, urejanje genoma, genetika, protoplasti, genetske transformacije

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:Z4-3215
Naslov:Optimizacija protokola za CRISPR/Cas9 in tarčno preurejanje nukleotidov pri zelju

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0077
Naslov:Kmetijske rastline - genetika in sodobne tehnologije

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj