izpis_h1_title_alt

Potent DNA gyrase inhibitors bind asymmetrically to their target using symmetrical bifurcated halogen bonds
ID Kolarič, Anja (Avtor), ID Germe, Thomas (Avtor), ID Hrast, Martina (Avtor), ID Stevenson, Clare E. M. (Avtor), ID Lawson, David M. (Avtor), ID Burton, Nicolas P. (Avtor), ID Vörös, Judit (Avtor), ID Maxwell, Anthony (Avtor), ID Minovski, Nikola (Avtor), ID Anderluh, Marko (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,00 MB)
MD5: 00DFF7317DB718CDA1A6E440A9F4B62B
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.nature.com/articles/s41467-020-20405-8 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Novel bacterial type II topoisomerase inhibitors (NBTIs) stabilize single-strand DNA cleavage breaks by DNA gyrase but their exact mechanism of action has remained hypothetical until now. We have designed a small library of NBTIs with an improved DNA gyrase-binding moiety resulting in low nanomolar inhibition and very potent antibacterial activity. They stabilize single-stranded cleavage complexes and, importantly, we have obtained the crystal structure where an NBTI binds gyrase-DNA in a single conformation lacking apparent static disorder. This directly proves the previously postulated NBTI mechanism of action and shows that they stabilize single-strand cleavage through asymmetric intercalation with a shift of the scissile phosphate. This crystal stucture shows that the chlorine forms a halogen bond with the backbone carbonyls of the two symmetry-related Ala68 residues. To the best of our knowledge, such a so-called symmetrical bifurcated halogen bond has not been identified in a biological system until now.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:antibacterials, DNA gyrase inhibitors, drug discovery, Staphylococcus aureus, intercalators, novel bacterial topoisomerase inhibitors, NBTIs, symmetrical bifurcated halogen bonds, crystal structure, novel NBTIs mechanism of action, antimicrobials, DNA-binding proteins, drug development, X-ray crystallography
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FFA - Fakulteta za farmacijo
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2021
Št. strani:13 str.
Številčenje:Vol. 12, art. 150
PID:20.500.12556/RUL-144808 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:577
ISSN pri članku:2041-1723
DOI:10.1038/s41467-020-20405-8 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:46272259 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:14.03.2023
Število ogledov:626
Število prenosov:66
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Nature communications
Skrajšan naslov:Nat. Commun.
Založnik:Nature Publishing Group
ISSN:2041-1723
COBISS.SI-ID:2315876 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biokemija, DNK, Escherichia coli, zaviralci

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0017
Naslov:Modeliranje kemijskih procesov in lastnosti spojin

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0208
Naslov:Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin

Financer:UKRI - UK Research and Innovation
Program financ.:BBSRC, Institute Strategic Programme
Številka projekta:BB/P012523/1

Financer:WT - Wellcome Trust
Program financ.:Investigator Award
Številka projekta:110072/Z/15/Z

Financer:UKRI - UK Research and Innovation
Program financ.:BBSRC
Številka projekta:BB/S507921/1
Naslov:John Innes Centre Flexible Talent Mobility Account

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj