Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
Bacterial DNA recognition by SERS active plasma-coupled nanogold
ID
Shvalya, Vasyl
(
Avtor
),
ID
Skubic, Cene
(
Avtor
),
ID
Nadižar, Nejc
(
Avtor
),
ID
Rozman, Damjana
(
Avtor
),
ID
Cvelbar, Uroš
(
Avtor
), et al.
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(10,82 MB)
MD5: 4DF80D733F2C955522D612510C40840E
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.nanolett.2c02835
Galerija slik
Izvleček
It is shown that surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) can identify bacteria based on their genomic DNA composition, acting as a “sample-distinguishing marker”. Successful spectral differentiation of bacterial species was accomplished with nanogold aggregates synthesized through single-step plasma reduction of the ionic gold-containing vapored precursor. A high enhancement factor (EF = 10$^7$) in truncated coupled plasmonic particulates allowed SERS-probing at nanogram sample quantities. Simulations confirmed the occurrence of the strongest electric field confinement within nanometric gaps between gold dimers/chains from where the molecular fingerprints of bacterial DNA fragments gained photon scattering enhancement. The most prominent Raman modes linked to fundamental base-pair molecular vibrations were deconvoluted and used to proceed with nitrogenous base content estimation. The genomic composition (percentage of guanine-cytosine and adenine-thymine) was successfully validated by third-generation sequencing using nanopore technology, further proving that the SERS technique can be employed to swiftly specify bioentities by the discriminative principal-component statistical approach.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
DNA genomic ration
,
plasma electrochemical reduction
,
coupled plasmonic nanogold
,
DNA Raman fingerprints
,
genetics
,
genomics
,
gold
,
plasma
,
Raman spectroscopy
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
MF - Medicinska fakulteta
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2022
Št. strani:
Str. 9757-9765
Številčenje:
Vol. 22, iss. 23
PID:
20.500.12556/RUL-144312
UDK:
533
ISSN pri članku:
1530-6992
DOI:
10.1021/acs.nanolett.2c02835
COBISS.SI-ID:
127669763
Datum objave v RUL:
14.02.2023
Število ogledov:
692
Število prenosov:
130
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
Nano letters
Skrajšan naslov:
Nano lett.
Založnik:
American Chemical Society
ISSN:
1530-6992
COBISS.SI-ID:
512808217
Licence
Licenca:
CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:
To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Projekti
Financer:
Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:
NATO
Številka projekta:
G5814
Akronim:
NOOSE
Financer:
EC - European Commission
Program financ.:
H2020
Številka projekta:
766894
Naslov:
Plasma Enabled and Graphene Allowed Synthesis of Unique Nanostructures
Akronim:
PEGASUS
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P1-0417
Naslov:
Plazma in kvantne strukture
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J4-1770
Naslov:
Plazemska dekontaminacija mikotoksinov in inaktivacija plesni v živilski industriji
Financer:
Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:
Public Scholarship, Development, Disability, and Maintenance Fund of the Republic of Slovenia, Ad futura
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P1-0390
Naslov:
Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
I0-0022
Naslov:
Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov Univerze v Ljubljani (MRIC UL)
Financer:
Drugi - Drug financer ali več financerjev
Akronim:
ELIXIR-SI RI-SI-2
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J2-4490
Naslov:
Napredna plazmonska vibroskopija na nivoju DNK molekul za nanomedicinske raziskave
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J2-4451
Naslov:
Plazemsko aktivirani nanomehurčki: nov pristop za učinkovito razkuževanje endoskopov
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj