izpis_h1_title_alt

Bacterial DNA recognition by SERS active plasma-coupled nanogold
ID Shvalya, Vasyl (Avtor), ID Skubic, Cene (Avtor), ID Nadižar, Nejc (Avtor), ID Rozman, Damjana (Avtor), ID Cvelbar, Uroš (Avtor), et al.

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (10,82 MB)
MD5: 4DF80D733F2C955522D612510C40840E
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.nanolett.2c02835 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
It is shown that surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) can identify bacteria based on their genomic DNA composition, acting as a “sample-distinguishing marker”. Successful spectral differentiation of bacterial species was accomplished with nanogold aggregates synthesized through single-step plasma reduction of the ionic gold-containing vapored precursor. A high enhancement factor (EF = 10$^7$) in truncated coupled plasmonic particulates allowed SERS-probing at nanogram sample quantities. Simulations confirmed the occurrence of the strongest electric field confinement within nanometric gaps between gold dimers/chains from where the molecular fingerprints of bacterial DNA fragments gained photon scattering enhancement. The most prominent Raman modes linked to fundamental base-pair molecular vibrations were deconvoluted and used to proceed with nitrogenous base content estimation. The genomic composition (percentage of guanine-cytosine and adenine-thymine) was successfully validated by third-generation sequencing using nanopore technology, further proving that the SERS technique can be employed to swiftly specify bioentities by the discriminative principal-component statistical approach.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:DNA genomic ration, plasma electrochemical reduction, coupled plasmonic nanogold, DNA Raman fingerprints, genetics, genomics, gold, plasma, Raman spectroscopy
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2022
Št. strani:Str. 9757-9765
Številčenje:Vol. 22, iss. 23
PID:20.500.12556/RUL-144312 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:533
ISSN pri članku:1530-6992
DOI:10.1021/acs.nanolett.2c02835 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:127669763 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:14.02.2023
Število ogledov:692
Število prenosov:130
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Nano letters
Skrajšan naslov:Nano lett.
Založnik:American Chemical Society
ISSN:1530-6992
COBISS.SI-ID:512808217 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Projekti

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:NATO
Številka projekta:G5814
Akronim:NOOSE

Financer:EC - European Commission
Program financ.:H2020
Številka projekta:766894
Naslov:Plasma Enabled and Graphene Allowed Synthesis of Unique Nanostructures
Akronim:PEGASUS

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0417
Naslov:Plazma in kvantne strukture

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J4-1770
Naslov:Plazemska dekontaminacija mikotoksinov in inaktivacija plesni v živilski industriji

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Public Scholarship, Development, Disability, and Maintenance Fund of the Republic of Slovenia, Ad futura

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0390
Naslov:Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:I0-0022
Naslov:Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov Univerze v Ljubljani (MRIC UL)

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Akronim:ELIXIR-SI RI-SI-2

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J2-4490
Naslov:Napredna plazmonska vibroskopija na nivoju DNK molekul za nanomedicinske raziskave

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J2-4451
Naslov:Plazemsko aktivirani nanomehurčki: nov pristop za učinkovito razkuževanje endoskopov

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj