Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
Covalent inhibitors of bacterial peptidoglycan biosynthesis enzyme MurA with chloroacetamide warhead
ID
Grabrijan, Katarina
(
Avtor
),
ID
Hrast, Martina
(
Avtor
),
ID
Proj, Matic
(
Avtor
),
ID
Dolšak, Ana
(
Avtor
),
ID
Zdovc, Irena
(
Avtor
),
ID
Imre, Tímea
(
Avtor
),
ID
Petri, László
(
Avtor
),
ID
Ábrányi-Balogh, Péter
(
Avtor
),
ID
Keserü M., György
(
Avtor
),
ID
Gobec, Stanislav
(
Avtor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(4,05 MB)
MD5: EF948C680A1D00A7A5A8DE1234711C08
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0223523422006547
Galerija slik
Izvleček
MurA (UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase) catalyzes the first committed step in the cytoplasmic part of peptidoglycan biosynthesis and is a validated target enzyme for antibacterial drug discovery; the inhibitor fosfomycin has been used clinically for decades. Like fosfomycin, most MurA inhibitors are small heterocyclic compounds that inhibit the enzyme by forming a covalent bond with the active site cysteine. The reactive chloroacetamide group was selected from a series of suitable electrophilic thiol-reactive warheads. The predominantly one-step synthesis led to the construction of the final library of 47 fragment-sized chloroacetamide compounds. Several new E. coli MurA inhibitors were identified, with the most potent compound having an IC$_{50}$ value in the low micromolar range. The electrophilic reactivity of all chloroacetamide fragments in our library was evaluated by a high-throughput spectrophotometric assay using the reduced Ellman reagent as a surrogate for the cysteine thiol. LC-MS/MS experiments confirmed the covalent binding of the most potent inhibitor to Cys115 of the digested MurA enzyme. The covalent binding was further investigated by a biochemical time-dependent assay and a dilution assay, which confirmed the irreversible and time-dependent mode of action. The efficacy of chloroacetamide derivatives against MurA does not correlate with their thiol reactivity, making the active fragments valuable starting points for fragment-based development of new antibacterial agents targeting MurA.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
antibacterial agents
,
UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase
,
thiol reactivity
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
FFA - Fakulteta za farmacijo
VF - Veterinarska fakulteta
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2022
Št. strani:
15 str.
Številčenje:
Vol. 243, art. 114752
PID:
20.500.12556/RUL-141439
UDK:
579.8:615.4:54
ISSN pri članku:
0223-5234
DOI:
10.1016/j.ejmech.2022.114752
COBISS.SI-ID:
123442179
Datum objave v RUL:
29.09.2022
Število ogledov:
479
Število prenosov:
148
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
European journal of medicinal chemistry
Skrajšan naslov:
Eur. j. med. chem.
Založnik:
Elsevier
ISSN:
0223-5234
COBISS.SI-ID:
25429760
Licence
Licenca:
CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:
To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Sekundarni jezik
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
antibakterijska sredstva
,
UDP-N-acetilglukozamin enolpiruvil transferaza
,
tiolna reaktivnost
,
bakterije
,
farmacevtska kemija
Projekti
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P1-0208
Naslov:
Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
N1-0169
Naslov:
Kovalentni pristop k boju proti bakterijski rezistenci
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J1-2484
Naslov:
Razvoj protibakterijskih učinkovin z delovanjem na validirane tarče v biosintezi peptidoglikana
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Program financ.:
Young researchers
Financer:
Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:
Hungary, National Research Development and Innovation Office
Številka projekta:
SNN 135335
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj