Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
TBP, PPIA, YWHAZ and EF1A1 are the most stably expressed genes during osteogenic differentiation
ID
Franko, Nina
(
Avtor
),
ID
Vrščaj, Lucija Ana
(
Avtor
),
ID
Zore, Taja
(
Avtor
),
ID
Ostanek, Barbara
(
Avtor
),
ID
Marc, Janja
(
Avtor
),
ID
Lojk, Jasna
(
Avtor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(1,83 MB)
MD5: 85B8AE9B58750B113858C4FA93BAA389
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/8/4257
Galerija slik
Izvleček
RT-qPCR is the gold standard and the most commonly used method for measuring gene expression. Selection of appropriate reference gene(s) for normalization is a crucial part of RT-qPCR experimental design, which allows accurate quantification and reliability of the results. Because there is no universal reference gene and even commonly used housekeeping genes’ expression can vary under certain conditions, careful selection of an appropriate internal control must be performed for each cell type or tissue and experimental design. The aim of this study was to identify the most stable reference genes during osteogenic differentiation of the human osteosarcoma cell lines MG-63, HOS, and SaOS-2 using the geNorm, NormFinder, and BestKeeper statistical algorithms. Our results show that TBP, PPIA, YWHAZ, and EF1A1 are the most stably expressed genes, while ACTB, and 18S rRNA expressions are most variable. These data provide a basis for future RT-qPCR normalizations when studying gene expression during osteogenic differentiation, for example, in studies of osteoporosis and other bone diseases.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
geNorm
,
reference gene
,
NormFinder
,
BestKeeper
,
osteogenic differentiation
,
gene expression
,
osteosarcoma cell line
,
RT-qPCR
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
FFA - Fakulteta za farmacijo
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2022
Št. strani:
17 str.
Številčenje:
Vol. 23, iss. 8, art. 4257
PID:
20.500.12556/RUL-136787
UDK:
575.117:616-006.34
ISSN pri članku:
1422-0067
DOI:
10.3390/ijms23084257
COBISS.SI-ID:
105244163
Datum objave v RUL:
20.05.2022
Število ogledov:
3522
Število prenosov:
83
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
International journal of molecular sciences
Skrajšan naslov:
Int. j. mol. sci.
Založnik:
MDPI
ISSN:
1422-0067
COBISS.SI-ID:
2779162
Licence
Licenca:
CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:
To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Sekundarni jezik
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
referenčni gen
,
osteogena diferenciacija
,
celična linija osteosarkoma
,
gensko izražanje
,
osteosarkom
Projekti
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
P3-0298
Naslov:
Geni, hormonske in osebnostne spremembe pri metabolnih motnjah
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J3-1759
Naslov:
Celostna karakterizacija zadetkov analiz GWAS - pot do novih terapevtskih tarč za anabolno zdravljenje osteoporoze (GWASforAna)
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Program financ.:
Young researchers
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj