izpis_h1_title_alt

Robust saliva-based RNA extraction-free one-step nucleic acid amplification test for mass SARS-CoV-2 monitoring
ID Rajh, Eva (Avtor), ID Šket, Tina (Avtor), ID Praznik, Arne (Avtor), ID Sušjan-Leite, Petra (Avtor), ID Šmid, Alenka (Avtor), ID Urbančič, Dunja (Avtor), ID Mlinarič-Raščan, Irena (Avtor), ID Kogovšek, Polona (Avtor), ID Demšar, Tina (Avtor), ID Milavec, Mojca (Avtor), ID Prosenc Trilar, Katarina (Avtor), ID Jensterle, Žiga (Avtor), ID Zidarn, Mihaela (Avtor), ID Tomič, Viktorija (Avtor), ID Turel, Gabriele (Avtor), ID Lejko-Zupanc, Tatjana (Avtor), ID Jerala, Roman (Avtor), ID Benčina, Mojca (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,20 MB)
MD5: 18B9A7363F04D8631189C6EAF027EE7B
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.mdpi.com/1420-3049/26/21/6617 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Early diagnosis with rapid detection of the virus plays a key role in preventing the spread of infection and in treating patients effectively. In order to address the need for a straightforward detection of SARS-CoV-2 infection and assessment of viral spread, we developed rapid, sensitive, extraction-free one-step reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) tests for detecting SARS-CoV-2 in saliva. We analyzed over 700 matched pairs of saliva and nasopharyngeal swab (NSB) specimens from asymptomatic and symptomatic individuals. Saliva, as either an oral cavity swab or passive drool, was collected in an RNA stabilization buffer. The stabilized saliva specimens were heat-treated and directly analyzed without RNA extraction. The diagnostic sensitivity of saliva-based RT-qPCR was at least 95% in individuals with subclinical infection and outperformed RT-LAMP, which had at least 70% sensitivity when compared to NSBs analyzed with a clinical RT-qPCR test. The diagnostic sensitivity for passive drool saliva was higher than that of oral cavity swab specimens (95% and 87%, respectively). A rapid, sensitive one-step extraction-free RT-qPCR test for detecting SARS-CoV-2 in passive drool saliva is operationally simple and can be easily implemented using existing testing sites, thus allowing high-throughput, rapid, and repeated testing of large populations. Furthermore, saliva testing is adequate to detect individuals in an asymptomatic screening program and can help improve voluntary screening compliance for those individuals averse to various forms of nasal collections.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:oral cavity swab, passive drool, pooling, saliva, COVID-19, SARS-CoV-2, LAMP, RT-qPCR, COVID-19 serological testing, real-time polymerase chain reaction
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FFA - Fakulteta za farmacijo
BF - Biotehniška fakulteta
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2021
Št. strani:19 str.
Številčenje:Vol. 26, iss. 21, art. 6617
PID:20.500.12556/RUL-136425 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:616.9
ISSN pri članku:1420-3049
DOI:10.3390/molecules26216617 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:83744003 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:03.05.2022
Število ogledov:1766
Število prenosov:105
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Molecules
Skrajšan naslov:Molecules
Založnik:MDPI
ISSN:1420-3049
COBISS.SI-ID:18462981 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:01.11.2021

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:bris ustne sluznice, združeni vzorci, SARS-CoV-2, serološko testiranje za COVID-19, verižna reakcija s polimerazo v realnem času, slina, covid-19

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0176
Naslov:Molekularna biotehnologija: od dinamike bioloških sistemov do aplikacij

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0407
Naslov:Okoljska in aplikativna virologija: virusi, prijatelji in sovražniki

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P4-0165
Naslov:Biotehnologija in sistemska biologija rastlin

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0208
Naslov:Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:V4-2038
Naslov:DNK cepiva in peptidnih inhibitorji proti SARS-CoV-2

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:I0-0022
Naslov:Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov Univerze v Ljubljani (MRIC UL)

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Ministry of Education, Science, and Sport (MIZŠ)
Številka projekta:OP20.05187
Akronim:RI-SI-EATRIS

Financer:EC - European Commission
Program financ.:European Regional Development Fund
Akronim:RI-SI-EATRIS

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj