izpis_h1_title_alt

Common transcriptional program of liver fibrosis in mouse genetic models and humans
ID Blagotinšek Cokan, Kaja (Avtor), ID Urlep, Žiga (Avtor), ID Moškon, Miha (Avtor), ID Mraz, Miha (Avtor), ID Kong, Xiang Yi (Avtor), ID Eskild, Winnie (Avtor), ID Rozman, Damjana (Avtor), ID Juvan, Peter (Avtor), ID Režen, Tadeja (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (3,37 MB)
MD5: 6E3BFBE3F2095EEFBA9B2A536C2A4066
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.mdpi.com/1422-0067/22/2/832 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Multifactorial metabolic diseases, such as non-alcoholic fatty liver disease, are a major burden to modern societies, and frequently present with no clearly defined molecular biomarkers. Herein we used system medicine approaches to decipher signatures of liver fibrosis in mouse models with malfunction in genes from unrelated biological pathways: cholesterol synthesis—Cyp51, notch signaling—Rbpj, nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells (NFκB) signaling—Ikbkg, and unknown lysosomal pathway—Glmp. Enrichment analyses of Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), Reactome and TRANScription FACtor (TRANSFAC) databases complemented with genome-scale metabolic modeling revealed fibrotic signatures highly similar to liver pathologies in humans. The diverse genetic models of liver fibrosis exposed a common transcriptional program with activated estrogen receptor alpha (ERα) signaling, and a network of interactions between regulators of lipid metabolism and transcription factors from cancer pathways and the immune system. The novel hallmarks of fibrosis are downregulated lipid pathways, including fatty acid, bile acid, and steroid hormone metabolism. Moreover, distinct metabolic subtypes of liver fibrosis were proposed, supported by unique enrichment of transcription factors based on the type of insult, disease stage, or potentially, also sex. The discovered novel features of multifactorial liver fibrotic pathologies could aid also in improved stratification of other fibrosis related pathologies.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:bile acid, fatty acid, fibrosis, NAFLD, NASH, GEM
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2021
Št. strani:21 str.
Številčenje:Vol. 22, iss. 2, art. 832
PID:20.500.12556/RUL-134935 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:616.3
ISSN pri članku:1422-0067
DOI:10.3390/ijms22020832 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:47324419 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:11.02.2022
Število ogledov:801
Število prenosov:154
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:International journal of molecular sciences
Skrajšan naslov:Int. j. mol. sci.
Založnik:MDPI
ISSN:1422-0067
COBISS.SI-ID:2779162 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.
Začetek licenciranja:15.01.2021

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:žolčna kislina, maščobna kislina, fibroza

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0104
Naslov:Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0390
Naslov:Funkcijska genomika in biotehnologija za zdravje

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P2-0359
Naslov:Vseprisotno računalništvo

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-9176
Naslov:HolesteROR pri presnovnih boleznih jeter

Financer:Drugi - Drug financer ali več financerjev
Program financ.:Norwegian Research Council
Številka projekta:NFR 240844 NCD

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Program financ.:Graduate fellowship

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj