izpis_h1_title_alt

Računske metode za odkrivanje napovednih markerskih genov v analizi preživetja
Kokošar, Jaka (Avtor), Zupan, Blaž (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, Toplak, Marko (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (4,26 MB)
MD5: FCF34F0FC2EF35A47F4EC3729ED6D922

Izvleček
Prepoznavanje bioloških markerjev ni pomembno zgolj iz vidika njihove uporabe pri kliničnem odločanju ampak tudi zato, ker lahko z njimi dobimo nove vpoglede v samo delovanje mehanizma bolezni in o molekularnih procesih, ki jih povzročajo. V delu smo preučili izbrane metode, ki se uporabljajo pri analizi preživetvenih podatkov in prepoznavanju ter vrednotenju markerskih genov preživetja. Na področju analize preživetja smo opazili pomanjkanje enostavnih zbirk orodij z intuitivnim uporabniškim vmesnikom, ki bi z interaktivno analizo preživetvenih podatkov pomagala pri tovrstnih raziskavah. Intuitivna orodja s prilagodljivimi vmesniki in interaktivnimi vizualizacijami lahko bistveno pripomorejo k pospešitvi razvoja in vrednotenja potencialnih markerskih genov. Predlagane pristope smo zato vpeljali v okolje za podatkovno analitiko Orange ter izdelane gradnike preiskusili z uporabo na kliničnih podatkih o genskih izrazih.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:analiza preživetja, markerski geni, izražanje genov, odkrivanje znanj iz podatkov, interaktivna podatkovna analitika
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
Leto izida:2021
COBISS.SI-ID:76890627 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:116
Število prenosov:44
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Computational methods for the discovery of prognostic marker genes in survival analysis
Izvleček:
The identification of biological markers is essential because of their meaningful role in clinical decision-making. With data mining that leads to biomarker discovery, we may also gain novel insights into the disease mechanism and the molecular processes. We observed a lack of intuitive toolkits with exploratory user interfaces to help domain experts in biomarker discovery and analysis of the results. Intuitive tools with customizable user interfaces and interactive visualizations can significantly accelerate the development and evaluation of potential marker genes. The thesis focuses on survival analysis and examines and constructs methods and software implementations in the Orange data mining toolkit to identify potential survival marker genes.

Ključne besede:survival analysis, marker genes, gene expression, data mining, interactive data analysis

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj