izpis_h1_title_alt

Na rekombinaciji temelječa umetna evolucija kvasovke Saccharomyces cerevisiae za acidotoleranco
ID Slokar, Dejan (Avtor), ID Petrovič, Uroš (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,07 MB)
MD5: 48F975A978A330F5BE37A01657D0130A

Izvleček
Rast pri nizkih vrednostih pH je pri kvasovki Saccharomyces cerevisiae v industrijskem okolju dobrodošla lastnost, saj poleg pozitivnega vpliva na mnoge metabolne procese, zmanjšuje tudi možnost bakterijske kontaminacije. Acidotoleranca je poligenska lastnost, nanjo vpliva večje število genov in je zato kompleksna za preučevanje. Z namenom pridobitve na nizke vrednosti pH odpornejši sev smo iterativno križali 6 genetsko različnih sevov kvasovke S. cerevisiae. Po vsakem križanju smo s selekcijo izbrali najodpornejšo segreganto generacije, tako imenovano zmagovalko. To segreganto smo uporabili za naslednje križanje. Zmagovalka zadnje generacije je bila zmožna boljše rasti pri nižjih vrednostih pH kot vsi starševski sevi in vse ostale zmagovalke. Tako smo z iterativnim križanjem in selekcijskim postopkom uspešno izboljšali fenotip acidotolerance. Za genetsko karakterizacijo smo zmagovalko zadnje generacije za potrebe identifikacije lokusov kvantitativne lastnosti (QTL) križali s sevom Y7092 in pripravili veliko število segregant. Segregante so v tem selekcioniranem zbiru rastle v selekciji v nizkih vrednostih pH, v povprečnem zbiru pa brez selekcije. Po sekvenciranju DNA iz obeh zbirov smo z bioinformatsko analizo primerjali frekvence variacij posameznih nukleotidov v povprečnem in selekcioniranem zbiru. Določili smo 45 potencialnih QTL, znotraj njih pa predlagali 91 verjetnih vzročnih genov za acidotoleranco.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Saccharomyces cerevisiae, acidotoleranca, umetna evolucija, poligenske lastnosti, X-QTL, analiza QTL, iterativno križanje, izboljševanje fenotipov kvasovke
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2020
PID:20.500.12556/RUL-122377 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:44400131 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:06.12.2020
Število ogledov:999
Število prenosov:202
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Recombination-based artificial evolution of Saccharomyces cerevisiae for thermotolarance and acidotolerance
Izvleček:
Ability to grow at low pH is a desirable feature for the yeast Saccharomyces cerevisiae in an industrial environment, because low pH, among many positive effects on cell metabolism, diminishes bacterial contamination. Acidotolerance is a polygenic trait, which means that there are multiple genes determining this trait. Therefore, such traits are relatively difficult to study. With the aim to obtain acidotolerant yeast strains we iteratively crossed 6 genetically different yeast strains. After each crossing we applied selection to the segregants and selected the most resistant segregant of the generation, the so-called winner. The winner of a generation was the segregant we used in the next crossing. The winner of the last generation was able to grow at lower pH then all the parental strains and all other generation winners. Thus, we have successfully improved acidotolarence yeast phenotype with iterative crossing and selection. For the identification of quantitative trait loci (QTLs), we crossed the winner of the last generation with the strain Y7092 and prepared an extremely large pool of segregants. The segregants in the extreme pool grew in selective medium with low pH, while the segregants in the average pool grew in a medium without selection. After sequencing of the pools’ DNA, we compared frequencies of single nucleotide variations between the extreme and the average pool using bioinformatics analysis. We predicted 45 potential QTLs and suggested 91 plausible causative genes for acidotolarance.

Ključne besede:Saccharomyces cerevisiae, acidotolerance, artificial evolution, polygenic traits, X-QTL, QTL analysis, iterative crossing, improving yeast phenotype

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj