izpis_h1_title_alt

Strukturne lastnosti z gvanini bogatega zaporedja v inducibilnem promotorju mdm2
Luzar, Petra (Avtor), Plavec, Janez (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,90 MB)
MD5: 22E8FEFE1F35F73A9110EE29DA0E20C6

Izvleček
Večje število gvaninskih ponovitev v promotorju onkogena mdm2, ki je vključen v razvoj tumorskega fenotipa pri liposarkomih, nakazuje, da je možen nastanek različnih štirivijačnih struktur DNA ali G-kvadrupleksov. V okviru diplomskega dela smo določili zmožnost tvorbe štirivijačnih struktur DNA v inducibilnem promotorju mdm2 in določiti pogoje, kjer bo prisotna ena sama struktura, kar bi omogočilo njeno podrobno strukturno karakterizacijo. Poleg celotnega nukleotidnega zaporedja mdm2-15, ki vsebuje pet gvaninskih ponovitev, smo opazovali tudi dve skrajšani zaporedji mdm2-14 in mdm2-24, kjer pri mdm2-14 opazujemo prve štiri gvaninske ponovitve, pri mdm2-25 pa zadnje štiri gvaninske ponovitve. S pomočjo 1D 1H NMR eksperimentov smo določili število G-kvartetov v nastalih G-kvadrupleksih in s CD spektroskopijo opisali topološke značilnosti (prisotnost paralelnih, antiparalelnih in (3+1) zvrsti). Preverili smo, kako prisotnost K+ in Na+ kationov vpliva na nastanek G-kvadrupleksov in ugotovili, da so kalijevi ioni uspešnejši pri stabilizaciji G-kvadrupleksov, ki jih tvorijo z gvanini bogata zaporedja iz onkogena mdm2. Pokazali smo, da je najugodnejši pH za zvijanje oligonukleotidov nevtralen.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:NMR, G-kvadrupleks, CD spektroskopija
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga (mb11)
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:2020
COBISS.SI-ID:31516163 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:269
Število prenosov:128
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Structural properties of guanine rich sequence in inducibile promoter mdm2
Izvleček:
Large number of guanine tracts in oncogene mdm2, which are responsible for development of tumor fenotype in liposarcomas, suggest formation of different G-quadruplexes is possible. The major aim of this diploma thesis was to determine the possibility of a G-quadruplex formation within inducibile promoter mdm2 and to determine the conditions where single structure would be formed. In addition to nucleotide sequence mdm2-15 (contains five guanin repetitions), we also studied two shorter sequences mdm2-14 and mdm2-25, which are shortend for the first guanine repetition from 3'- or 5'-end. With 1D 1H NMR experiments we defined the number of different G-quartets in G-quadruplexes and in combination with CD spectroscopy aimed at description of topological determinants (parallel, antiparallel and (3+1) topology). Two different cations, K+ in Na+, were tested for their ability to stabilize G-quadruplex structures and the former was recognized as more successful at stabilization of G-quadruplexes of mdm2. Among acidic, basic and neutral pH, the latter was found to be most suited for promoting formation of predominant species.

Ključne besede:NMR, G-quadruplex, CD spectroscopy

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj