izpis_h1_title_alt

Osamitev in molekularna karakterizacija bakterije Clostridium difficile iz vzorcev kompostnikov.
Prša, Nuša (Avtor), Starčič Erjavec, Marjanca (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, Janežič, Sandra (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (3,24 MB)
MD5: DC3BF79EC62DB9E64ECC1E51E6D82918

Izvleček
Clostridium difficile (Clostridioides difficile) je po Gramu pozitivna, anaerobna bakterija, ki tvori odporne spore in je ena najpomembnejših človeških in živalskih patogenov. Bakterijo pogosto povezujemo z bolnišničnimi okužbami, v zadnjih letih pa se povečuje število okužb tudi v domačem okolju. Spore bakterije C. difficile najdemo tudi v naravnih okoljih, gospodinjstvih in hrani. Namen magistrskega dela je bil ugotoviti in spremljati pogostnost in raznolikost genotipov bakterije C. difficile v vzorcih komposta. Vzorčili smo dva kompostnika v več časovnih točkah in na 5 različnih vzorčnih mestih ter tako pridobili 45 vzorcev komposta. Pri izolaciji C. difficile iz pridobljenih vzorcev smo uporabili dva pristopa: direktno metodo in metodo s sonikacijo. Za molekularno karakterizacijo izolatov smo uporabili PCR-ribotipizacijo in toksinotipizacijo. Bakterijo C. difficile smo izolirali iz 38 vzorcev komposta (84,4 %). Skupno smo izolirali 906 izolatov, ki smo jih uvrstili v 35 različnih PCR-ribotipov. Toksigenih je bilo 77,1 % PCR-ribotipov, ki so pripadali v toksinotipe 0, 0/v, III, V in VIII. Najpogostejši PCR-ribotipi C. difficile v vzorcih komposta so bili 018, 014/020 in SLO 057. Za osamitev bakterije je smiselno, da se uporabita obe metodi, tako direktna metoda, kot metoda s sonikacijo. Naši rezultati potrjujejo, da je kompost lahko potencialni vir okužbe z bakterijo C. difficile, saj je le-ta v vzorcih komposta prisotna v velikem deležu. Prav tako v kompostu najdemo različne PCR-ribotipe C. difficile, ki se prekrivajo s PCR-ribotipi pri ljudeh, živalih, okolju in živilih v Sloveniji.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Clostridium difficile, biološki odpadki, kompostnik, sonikacija, molekularna karakterizacija, PCR-ribotipizacija, toksinotipizacija
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2020
Založnik:[N. Prša]
UDK:579.67:579.852.13:631.879.4
COBISS.SI-ID:5167224 Povezava se odpre v novem oknu
Število ogledov:564
Število prenosov:239
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Isolation and molecular characterization of Clostridium difficile from compost samples.
Izvleček:
Clostridium difficile (Clostridioides difficile) is a Gram-positive, anaerobic bacterium that forms resistant spores and is one of the most important human and animal pathogens. The bacterium is often associated with hospital infections, but in recent years, the number of infections in the community has increased as well. C. difficile spores are also found in natural habitats, households and in food. The purpose of this master's thesis was to determine and monitor the frequency and diversity of C. difficile genotypes in compost samples. We sampled two composters at different time points and from five different sampling points, to obtain 45 compost samples. We used two approaches, the direct method and the sonication, to isolate C. difficile from the obtained samples. For molecular characterization of isolates, PCR-ribotyping and toxinotyping were used. C. difficile was isolated from 38 compost samples (84.4%). In total, 906 isolates were isolated and then classified into 35 different PCR-ribotypes. 77.1% of PCR-ribotypes were toxigenic and belonging to the toxinotypes 0, 0 / v, III, V, and VIII. The most common C. difficile PCR-ribotypes in compost samples were 018, 014/020, and SLO 057. It makes sense to use both methods, direct method and the sonication, to isolate the bacterium. Our results confirm that compost can be a potential source of infection with C. difficile bacterium, since it is present in high percentages in compost samples. Compost also contains various C. difficile PCR-ribotypes, which overlap with PCR-ribotypes in humans, animals, the environment and foods in Slovenia.

Ključne besede:Clostridium difficile, biological waste, composter, sonication, molecular characterization, PCR-ribotyping, toxinotyping

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj