izpis_h1_title_alt

Razvoj metode za vrednotenje sorodstvene diskriminacije na nivoju celice pri bakteriji Bacillus subtilis
ID Polšak, Alja (Avtor), ID Mandić Mulec, Ines (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Štefanič, Polonca (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,77 MB)
MD5: 1BDB6DB0441CA6D2D569425C50E63E25

Izvleček
V magistrski nalogi smo želeli razviti in optimizirati metodo za vrednotenje sorodstvene diskriminacije pri bakteriji Bacillus subtilis na nivoju celice. Osredotočili smo se na razvoj metode z uporabo agarskih blokcev za opazovanje rasti in interakcij sevov bakterije B. subtilis z različno stopnjo sorodnosti s kombinacijo epi-fluorescentne in presevne mikroskopije. Za razvoj metode smo uporabili več vrst gojišč in njihovih različic. Preverjali smo še druge parametre, ki vplivajo na rast bakterij, kot so temperatura, čas inkubacije, načini nacepljanja blokcev. Ugotovili smo, da antagonizma ne opazimo na nivoju posameznih celic in na nivoju mikrokolonij, ki jih še lahko spremljamo z opazovanjem pod mikroskopom, kljub temu da ti »non-kin« sevi tvorijo razmejitveno linijo med roji na agarskih ploščah. Na osnovi teh ugotovitev smo sklepali, da je morda pojav antagonizma, ki se kaže v lizi celic odvisen od specifičnih pogojev in morda vpliva tudi celične gostota na stiku, čeprav slednjega nismo direktno kvantitativno vrednotili. V našem primeru celična gostota pri opazovanju pod mikroskopom morda ni bila dovoljšnja, saj so ob celice enega in drugega seva bile večinoma v enem sloju. Preverili smo tudi vpliv sorodnosti sevov na podvojevalni čas, kjer smo pričakovali, da bo hitrost rasti kin sevov boljša v primerjavi z rastjo non-kin sevov. Rezultati ne nakazujejo na podaljšanje generacijskega časa ob hkratni nacepitvi dveh non-kin sevov v primerjavi s kin sevoma, smo pa pri non-kin sevih opazili večjo variabilnost posameznega seva v hitrosti zasedanja površine agarja.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Bacillus subtilis, sorodstvena diskriminacija, fluorescentna mikroskopija, agarski blokci
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2019
Založnik:[A. Polšak]
PID:20.500.12556/RUL-113210 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:579.22/.26:579.852.11
COBISS.SI-ID:5135224 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:13.12.2019
Število ogledov:772
Število prenosov:109
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Development of a method for assessing kin discrimination of Bacillus subtilis at the cellular level
Izvleček:
In this master's thesis we aimed to develop and optimise a method that would allow us assessment of kin discrimination for bacterium Bacillus subtilis on the cellular level. We concentrated on developing agar pads method to monitor growth and interactions of B. subtilis cells that are genetically more (»kin«) or less (»non-kin«) related by confocal microscopy. We tested the influence of media composition, temperature, time of incubation, inoculation procedure on colony growth. Results did not confirm antagonism between strain, between individual or at the level of microcolonies that we were able to track over time (up to 9 hours) by confocal microscopy. Still both colonies formed a demarcated line and cells mostly did not mix. In the occasions when cells of PS-196 were trapped within the colony of PS-216 we noticed morphological changes of the trapped cells (SMM+ 0,5 % glc). The tested strains still preserved the ability to form visually dramatic boundary at the meeting point of two swarms on agar plates. It is possible that antagonism previously confirmed on agar plates depends on cell density as in microcolonies cells where still at the single cell layer and thus exposed to different conditions than those in swarms on agar paltes. We also examined the influence of relatedness on doubling time. The doubling times of kin strain pairs were more homogeneous in comparison to non-kin strains; however, this conclusion is preliminary as we would need to test higher number of biological replicates to claim this with confidence.

Ključne besede:Bacillus subtilis, kin discrimination, fluorescent microscopy, agar pads

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj