izpis_h1_title_alt

Vzpostavitev enostavnega sistema za inducibilno izražanje genov v tobaku in krompirju
ID Pogačar, Karmen (Avtor), ID Gruden, Kristina (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Coll Rius, Anna (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (4,04 MB)
MD5: 776961072543AB09EB4481E7EAACD388

Izvleček
Pri genski modifikaciji rastlin se najpogosteje uporablja konstitutivno izražanje genskih konstruktov. Konstitutivno izražanje genskih konstruktov pogosto omejuje rast rastline. Pri uporabi inducibilnega izražanja se lahko izognemo tem omejitvam, saj s pomočjo inducibilnega sredstva sprožimo prepis želenega gena ob točno določenem času. V magistrskem delu smo uporabili glukokortikoidni inducibilni sistem, ki ga inducira deksametazon. Za preverjanje delovanja sistema smo rastline Nicotiana benthamiana transformirali s plazmidom, v katerega smo vstavili gen za rumeni fluorescentni protein (YFP), čigar izražanje je pod vplivom glukokortikoidnega inducibilnega promotorja. S konfokalno mikroskopijo smo v določenih časovnih točkah spremljali fluorescenco YFP v povrhnjici polovice lista in zaznali signal 24 ur po indukciji. Drugo polovico lista smo uporabili za preverjanje izražanja gena YFP z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času (qPCR) in zaznali signal 2 uri po indukciji. Pri kontrolni rastlini signala nismo zaznali. V naslednjem koraku smo se osredotočili na dva obrambna gena krompirja, RbohD in TGA2.1. Iz DNK krompirja sorte Rywal smo pridobili nukleotidno zaporedje dveh različic gena RbohD, in sicer RbohD1 in RbohD2. Nato smo vzpostavljeni inducibilni sistem uporabili pri stabilni transformaciji krompirja sorte NahG-Rywal za izražanje gena TGA2.1. S qPCR smo izbrali dve transgeni liniji, pri katerih je bilo po tretiranju izražanje gena TGA2.1 povečano. Uporabili smo ju za nadaljnje preučevanje funkcije gena TGA2.1 z okuževanjem rastline s krompirjevim virusom Y (PVY) in ugotovili, da povečano izražanje gena TGA2.1 pripomore k obrambi pred virusom.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:biotehnologija, glukokortikoidni inducibilni sistem, TGA2.1, RbohD, deksametazon, krompir, Solanum tuberosum, Nicotiana benthamiana, konfokalna mikroskopija, qPCR, PVY
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Založnik:[K. Pogačar]
Leto izida:2019
PID:20.500.12556/RUL-110589 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:602.6:582.930.11/.3(043.2)
COBISS.SI-ID:9347705 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:18.09.2019
Število ogledov:2000
Število prenosov:274
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Establishing a system for inducible gene expression in tobacco and potato plants
Izvleček:
Overexpression of genes using stable transformation of plants is a widly used and very efficient method for functional studies of genes of interest. The constitutive gene expression can limit plant growth. When using inducible gene expression, these limitations are overcome by using a system that activates expression of a certain gene at specified time. In this master thesis we set up a glucocorticoid receptor-based inducible gene expression system, inducible by dexamethasone. In order to test this inducible system and establish the optimal plant treaments, we transiently transformed Nicotiana benthamiana plants with a plasmid in which we introduced a yellow fluorescent protein (YFP) under the control of glucocorticoid inducible promoter. We used the confocal microscopy to follow the YFP signal at certain time points on one half of the leaf amd got signal 24 h after induction. The other half was used for YFP gene expression analysis with real-time polymerase chain reaction (qPCR), where we got signal 2 h after induction. Contrary to the control plant in which the gene was not expressed. Afterwards we focused on two potato defence genes, RbohD and TGA2.1. From DNA of potato cv. Rywal we determined nucleotide sequence of two different variants of RbohD gene – RbohD1 and RbohD2. We used the glucocorticoid-inducible system for stable transformation of NahG-Rywal potato to study the function of TGA2.1 in potato defence response. By qPCR we selected two transgenic lines in which TGA2.1 gene was overexpressed. For further investigation of gene function in plant defence system we used these two lines to infect the potato plants with the potato virus Y. As the spread of PVY was limited in these lines, we confirmed the positive role of TGA2.1 in plant defence by qPCR.

Ključne besede:biotechnology, glucocorticoid inducible system, TGA2.1, RbohD, dexamethasone, potato, Solanum tuberosum, Nicotiana benthamiana, confocal microscopy, pPCR, PVY

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj