izpis_h1_title_alt

Razvoj metode za časovno spremljanje razvoja biofilmov z mikroskopom
ID Jeršinovič, Nataša (Avtor), ID Mandić Mulec, Ines (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Dogša, Iztok (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (29,29 MB)
MD5: 5FF976656A82234D6B944F5868067EFA

Izvleček
Biofilmi so v matriks ujeti večcelični agregati bakterij, ki se pritrjujejo na biološke in nebiološke površine. Bakterijam omogočajo kolonizacijo različnih niš in preživetje neugodnih pogojev. Razvoj biofilma vključuje prehod planktonske oblike življenja v večcelično skupnost. Časovno spremljanje porazdelitve celic pri modelni bakteriji Bacillus subtilis, ki tvori biofilme (pelikle) na stičišču zrak-tekoče gojišče je slabo preučeno. V okviru naloge smo razvili metodo za časovno in prostorsko spremljanje razvoja peliklov modelne bakterije B. subtilis PS-216 s svetlobnim mikroskopom v tekočem gojišču MSgg. Uporabili smo svetlobno-mikroskopski tehniki DIC in konfokalne mikroskopije. S tremi različicami poskusa smo ponazorili delovanje in uporabnost novo razvite metode. Primerjali smo razvoj pelikla pri divjem tipu B. subtilis PS-216 in mutanti Δeps, ki ne proizvaja zunajceličnega polisaharida Eps. Pelikle smo gojili ob dodatku propidijevega jodida, ki obarva DNA in ne vstopa v žive – fiziološko aktivne celice. Ugotovili smo, da so se bakterijske celice divjega tipa med inkubacijo porazdelile bodisi na površino bodisi na dno petrijevke. Barvanje s propidijevim jodidom je pokazalo, da so celice, ki se porazdelijo na dno v slabšem fiziološkem stanju in kmalu po začetku inkubacije odmrejo. Pri gojenju mutante Δeps smo opazili, da celice na površini gojišča začnejo tvoriti pelikel, a se ta ni zmožen obdržati na površini.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:mikrobne združbe, biofilmi, nastanek biofilmov, Bacillus subtilis, DIC mikroskopija, konfokalna mikroskopija, eps, fluorescentni proteini, porazdelitev celičnih gostot
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga (mb22)
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2018
Založnik:[N. Jeršinovič]
PID:20.500.12556/RUL-101676 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:579.24+579.26:681.723.26/.27
COBISS.SI-ID:4921208 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:24.06.2018
Število ogledov:1128
Število prenosov:290
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:The development of the time-lapse microscopy method for observation of the biofilm formation
Izvleček:
Biofilms are bacterial aggregates, encased in extracellular matrix and attached to biological or abiological surfaces. They represent an important bacterial lifestyle and protect encased bacterial cells. Biofilms represent a survival strategy that helps bacteria survive unfavourable conditions and/or colonize different ecological niches. In B. subtilis early stage of biofilm formation is associated with transformation of planktonic cells, which lose mobility and align into chains. Transformation stages into sesile mode of growth and especially formation of floating biofilms (pellicles) that form at liquid-air interface are poorly understood at the microscopic level. Here we developed a method to temporally monitor cellular distribution during pellicle formation at different depths of microscopic specimen using the model bacterium B. subtilis PS-216. In addition to the wild type strain we also evaluate its mutant Δeps, lacking matrix polysaccharide Eps. Results show that B. subtilis pellicle formation is a very dynamic process and that biofilm form either on the surface of the growth medium or at the bottom of the petri dish. Propidium iodide staining has further shown that cells at the bottom have impaired membranes and lysed relatively soon after the onset of incubation. A very different scenario was observed for the Δeps mutant that transiently formed but did not retain the pellicle at the surface of the growth medium.

Ključne besede:microbial aggregation, biofilms, biofilm formation, Bacillus subtilis, DIC microscopy, CLSM microscopy, eps, fluorescent proteins, cell density distribution

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj