Numbers

Bibliography of the person, including all types of documents, not only theses.

PhD theses (8)

1. Andrej Perdih: Dinamični model encima MurD iz E. coli in in silico načrtovanje novih inhibitorjev
2. Eva Prašnikar: Računsko in eksperimentalno preučevanje modulacije senescentnih celic
3. Eva Shannon Schiffrer: Sinteza in biokemijsko vrednotenje nepeptidnih reverzibilnih in ireverzibilnih zaviralcev imunoproteasoma
4. Kaja Bergant Loboda: Načrtovanje in optimizacija katalitičnih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze ▫$II\alpha$▫ kot potencialnih protirakavih učinkovin
5. Anja Kolarič: Uporaba kemoinformatičnih in strukturno podprtih in silico metod za načrtovanje zaviralcev bakterijske DNA giraze ter modulatorjev kemokinskih receptorjev CXCR3 in CXCR4
6. Rok Martinčič: Napovedovanje antioksidativne aktivnosti in transmembranskega transporta derivatov pulvinske kisline in kumarina
7. Barbara Pogorelčnik: Strukturno podprto načrtovanje novih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze II[alfa]
8. Barbara Herlah: Dinamični model DNA topoizomeraze tipa II ter in silico načrtovanje novih katalitičnih zaviralcev kot potencialnih kemoterapevtikov

MSc theses (12)

1. Matej Janežič: In silico načrtovanje in ovrednotenje 1H-indazolnih zaviralcev človeške topoizomeraze [alfa]
2. Gašper Grošelj: Strukturno podprto načrtovanje in sinteza 4,6-substituiranih 1,3,5-triazin-2(1H)-onov kot katalitičnih zaviralcev človeške DNA-topoizomeraze IIα
3. Sara Bavcon: Sinteza derivatov 3,5-disubstituiranega 1,2,4-oksadiazola kot potencialnih zaviralcev človeškega DNA topoizomereze II[alfa]
4. Melita Velikanje: Sinteza disubstituiranih 1,2,4-oksadiazolnih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα
5. Anja Pavlovič: Sinteza in vrednotenje novih derivatov 4,6-substituiranih-1,3,5-triazin-2(1H)-onov kot katalitičnih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα
6. Maruša Klemenčič: Sinteza in vrednotenje 4,6-substituiranih-1,3,5-triazin-2(1H)-onov kot katalitičnih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze II[alfa]
7. Santina Jazbinšek: Optimizacija derivatov 3,5-disubstituiranega 1,2,4-oksadiazola kot zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα
8. Mojca Klemenčič: Sinteza novih 3,5-disubstituiranih 1,2,4-oksadiazolov kot zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα
9. Aljoša Korošec: Optimizacija in vrednotenje 4,6-substituiranih-1,3,5-triazin-2(1H)-onov kot katalitičnih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα
10. Maša Ocepek: Sinteza substituiranih 1H-indazolov in 1H-indolov kot potencialnih zaviralcev človeške DNA-topoizomeraze IIα
11. Gašper Tomšič: Eksperimentalno in računsko ovrednotenje vpliva povezovalnih heteroatomov v 4,6-substituiranih 1,3,5-triazin-2(1H)-onih na zaviranje človeške DNA topoizomeraze IIα
12. Sara Vojska: Vpliv povečane fleksibilnosti disubstituiranih 1,2,4-oksadiazolov na zaviranje človeške DNA topoizomeraze IIα

BSc theses (1)

1. Uršula Grabnar: Ocena endokrinega delovanja barvil dovoljenih za uporabo v kozmetičnih izdelkih z in silico metodo

Other documents (13)

1. Barbara Herlah, Tjaša Goričan, Nika Strašek Benedik, Simona Golič Grdadolnik, Izidor Sosič, Andrej Perdih: Simulation- and AI-directed optimization of 4,6-substituted 1,3,5-triazin-2(1H)-ones as inhibitors of human DNA topoisomerase IIα
2. Maša Kenda, Jan Vegelj, Barbara Herlah, Andrej Perdih, Přemysl Mladěnka, Marija Sollner Dolenc: Evaluation of firefly and Renilla luciferase inhibition in reporter-gene assays
3. Mitja Ogrizek, Matej Janežič, Katja Valjavec, Andrej Perdih: Catalytic mechanism of ATP hydrolysis in the ATPase domain of human DNA topoisomerase IIα
4. Alja Prah, Tanja Gavranić, Andrej Perdih, Marija Sollner Dolenc, Janez Mavri: Computational insights into β-carboline inhibition of monoamine oxidase A
5. Martin Ljubič, Eva Prašnikar, Andrej Perdih, Jure Borišek: All-atom simulations reveal the intricacies of signal transduction upon binding of the HLA-E ligand to the transmembrane inhibitory CD94/NKG2A receptor
6. Eva Prašnikar, Martin Ljubič, Andrej Perdih, Jure Borišek: Machine learning heralding a new development phase in molecular dynamics simulations
7. Barbara Herlah, Matic Pavlin, Andrej Perdih: Molecular choreography
8. Matic Pavlin, Barbara Herlah, Katja Valjavec, Andrej Perdih: Unveiling the interdomain dynamics of type II DNA topoisomerase through all-atom simulations
9. Martin Ljubič, Andrej Perdih, Jure Borišek: All-atom simulations reveal the effect of membrane composition on the signaling of the NKG2A/CD94/HLA-E immune receptor complex
10. Barbara Herlah, Matej Janežič, Iza Ogris, Simona Golič Grdadolnik, Katja Kološa, Sonja Žabkar, Bojana Žegura, Andrej Perdih: Nature-inspired substituted 3-(imidazol-2-yl) morpholines targeting human topoisomerase IIα
11. Martin Ljubič, Marija Sollner Dolenc, Jure Borišek, Andrej Perdih: Water-based pharmacophore modeling in kinase inhibitor design
12. Anže Meden, Neža Žnidaršič, Damijan Knez, Yuanyuan Wang, Ziwei Xu, Huajing Yang, Weiting Zhang, Anja Pišlar, Andrej Perdih, Simona Kranjc Brezar, Neža Grgurevič, Stane Pajk, Haopeng Sun, Stanislav Gobec: Pleiotropic prodrugs for both symptomatic and disease-modifying treatment of Alzheimer’s disease
13. Kristina Stevanović, Barbara Herlah, Matic Pavlin, Andrej Perdih: Asymmetric T-segment binding and gate dynamics govern the final stages of the type IIA topoisomerase catalytic cycle