izpis_h1_title_alt

Uporaba mehke logike za modeliranje bioloških sistemov na primeru signalne poti MAPK
Magdevska, Lidija (Avtor), Moškon, Miha (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (4,33 MB)
MD5: 06D92F8926E64A312DC239C6409C2B8A

Izvleček
Signalne poti so ena od osnovnih tem raziskav sistemske biologije, saj le-te regulirajo številne celične procese in so vključene v zunajcelično komunikacijo. Njihova analiza je zahtevna zaradi velikih razlik med časovnimi odzivi različnih proteinov in prepletenosti signalnih poti tako preko skupnih dražljajev kot tudi v primerih, kjer prenos informacij sprožijo različni dražljaji. Pri raziskovanju povezav med gradniki signalnih poti imajo zato pomembno vlogo tudi računski modeli. Na voljo je širok spekter metod za analizo in razumevanje signalnih poti, ki so primerne za različne vrste problemov. Nekatere metode zahtevajo natančno poznavanje biokemijskega ozadja problema, za tako zgrajene modele pa je značilna velika natančnost, medtem ko je lahko pri drugih metodah naše poznavanje opazovanega sistema bolj okrnjeno, a so rezultati (napovedi) modela manj natančni. V zadnjem času stopajo v ospredje metode, ki predstavljajo kompromis med obema ekstremoma. Mednje sodijo tudi metode mehke logike, na katere se osredotočimo v pričujočem delu. Za vsako izmed obstoječih metod opišemo njene prednosti in slabosti ter jo bolj ali manj uspešno apliciramo na signalno pot MAP-kinaze.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:mehka logika, računska biologija, modeliranje in simulacija, signalna omrežja, MAP-kinaza
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga (mb11)
Organizacija:FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
Leto izida:2017
Število ogledov:606
Število prenosov:604
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
 
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Fuzzy modelling of biological systems and its application to the analysis of MAPK signalling pathway
Izvleček:
Signalling pathways are one of the fundamental topics of research in systems biology as they are involved in extracellular communication and regulate various cellular processes. Their analysis is difficult due to two factors: the first presents significant differences in temporal responses of different proteins, and the second presents the fact that they are interleaved through both common stimuli and cases when different stimuli trigger the transmission of the same information. Therefore, computational models play an important role in exploring the connections between different components of the signalling pathways. A wide spectrum of methods with various applications is available for analysing and understanding of signalling pathways. Some methods require a complex understanding of the problem’s biochemical background and result in highly accurate models, while with others, our knowledge may be more limited, which then results in less accurate predictions of the model. Methods that represent a compromise between the two approaches are recently becoming prevalent. These include fuzzy logic methods, on which we focus in this work. For each such method we describe its advantages and disadvantages and then apply it to the MAP kinase signalling pathway.

Ključne besede:fuzzy logic, computational biology, modelling and simulation, signalling networks, MAP kinase

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj