izpis_h1_title_alt

Fifty Aureobasidium pullulans genomes reveal a recombining polyextremotolerant generalist
ID Gostinčar, Cene (Avtor), ID Turk, Martina (Avtor), ID Zajc, Janja (Avtor), ID Gunde-Cimerman, Nina (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,07 MB)
MD5: DB23030AC23B046C372C7AC1F9024E29
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.14693 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
The black yeast Aureobasidium pullulans is a textbook example of a generalistic and ubiquitous fungus thriving in a wide variety of environments. To investigate whether A. pullulans is a true generalist, or alternatively, whether part of its versatility can be attributed to intraspecific specialization masked by cryptic diversification undetectable by traditional phylogenetic analyses, we sequenced and analysed the genomes of 50 strains of A. pullulans from different habitats and geographic locations. No population structure was observed in the sequenced strains. Decay of linkage disequilibrium over shorter physical distances (<100 bp) than in many sexually reproducing fungi indicates a high level of recombination in the species. A homothallic mating locus was found in all of the sequenced genomes. Aureobasidium pullulans appears to have a homogeneous population genetics structure, which is best explained by good dispersal and high levels of recombination. This means that A. pullulans is a true generalist that can inhabit different habitats without substantial specialization to any of these habitats at the genomic level. Furthermore, in the future, the high level of A. pullulans recombination can be exploited for the identification of genomic loci that are involved in the many biotechnologically useful traits of this black yeast.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:black yeast, genome
Vrsta gradiva:Članek v reviji (dk_c)
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2019
Status objave pri reviji:Objavljeno
Verzija članka:Založnikova različica članka
Št. strani:Str. 3638-3652
Številčenje:Vol. 21, iss. 10
UDK:577.21
ISSN pri članku:1462-2912
DOI:10.1111/1462-2920.14693 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:5158991 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:09.09.2019
Število ogledov:657
Število prenosov:200
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Objavi na:AddThis
AddThis uporablja piškotke, za katere potrebujemo vaše privoljenje.
Uredi privoljenje...

Gradivo je del revije

Naslov:Environmental Microbiology
Skrajšan naslov:Environ. microbiol. (Print)
Založnik:Society for Applied Microbiology, Wiley
ISSN:1462-2912
COBISS.SI-ID:626197 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:02.10.2019

Gradivo je financirano iz projekta

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS)
Številka projekta:I0-0021
Naslov:Infrastrukturni center za raziskave molekulskih interakcij, Razvojno raziskovalni center za proučevanje rasti in razvoja kmetijskih rastlin, IC Mycosmo

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS)
Številka projekta:I0-0022
Naslov:Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov Univerze v Ljubljani (MRIC UL)

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS)
Številka projekta:P1-0170
Naslov:Molekulski mehanizmi uravnavanja celičnih procesov v povezavi z nekaterimi boleznimi pri človeku

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS)
Številka projekta:P1-0207
Naslov:Toksini in biomembrane

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS)
Številka projekta:Z7-7436
Naslov:Na stres tolerantne kvasovke iz rodu Aureobasidium: uporaba v biološki kontroli nekaterih rastlinskih bolezni

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj