1. Analysis of the global population structure of Paenibacillus larvae and outbreak investigation of American foulbrood using a stable wgMLST schemeBojan Papić, Margo Diricks, Darja Kušar, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Paenibacillus larvae, American foulbrood, whole-genome sequencing, whole-genome multilocus sequence typing, core-genome multilocus sequence typing, whole-genome single nucleotide polymorphism, genotype, molecular sequence Celotno besedilo (datoteka, 2,30 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
|
3. Molecular profiling and identification of methanogenic archaeal species from rabbit caecumDarja Kušar, Gorazd Avguštin, 2010, izvirni znanstveni članek Ključne besede: mikrobiologija, bakterije, arheje, metanogeneza, kunci, cekum, molekularna genetika, identifikacija Celotno besedilo (povezava drugam) |
4. Novel TaqMan PCR assay for the quantification of Paenibacillus larvae spores in bee-related samplesDarja Kušar, Bojan Papić, Urška Zajc, Irena Zdovc, Majda Golob, Lucija Žvokelj, Tanja Knific, Jana Avberšek, Matjaž Ocepek, Metka Pislak, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: American foulbrood (AFB), Paenibacillus larvae, real-time or quantitative PCR (qPCR), digital PCR (dPCR), plate counting, spore germination rate, honey, hive debris, Polymerase Chain Reaction Celotno besedilo (datoteka, 2,12 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
5. Genomic insights into Salmonella Choleraesuis var. Kunzendorf outbreak reveal possible interspecies transmissionBojan Papić, Darja Kušar, Jasna Mićunović, Špela Vidrih, Mateja Pirš, Matjaž Ocepek, Jana Avberšek, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Salmonella Choleraesuis, whole-genome sequencing, domestic pig, wild boar, outbreak investigation Celotno besedilo (datoteka, 855,26 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
6. Clonal spread of pESI-positive multidrug-resistant ST32 Salmonella enterica serovar Infantis isolates among broilers and humans in SloveniaBojan Papić, Darja Kušar, Jasna Mićunović, Mateja Pirš, Matjaž Ocepek, Jana Avberšek, 2022, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Salmonella Infantis, ST32, pESI, multidrug resistance, broilers, humans Celotno besedilo (datoteka, 1,95 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
7. Genomic insights into the emergence and spread of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in veterinary clinicsBojan Papić, Majda Golob, Irena Zdovc, Darja Kušar, Jana Avberšek, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: antimicrobial susceptibility testing, epidemiology, methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP), small animal clinic, whole-genome sequencing (WGS) Celotno besedilo (datoteka, 2,86 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
8. ERIC and WGS typing of Paenibacillus larvae in SloveniaAlenka Žugelj, Bojan Papić, Irena Zdovc, Urška Zajc, Majda Golob, Jana Avberšek, Darja Kušar, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Paenibacillus larvae, American foulbrood (AFB), ERIC-PCR, whole-genome sequencing (WGS), transmission, outbreak investigation, molecular sequence data, genotype Celotno besedilo (datoteka, 3,50 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
9. Feline otitis externa caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus with mixed hemolytic phenotype and overview of possible genetic backgroundsJana Avberšek, Bojan Papić, Darja Kušar, Vladimira Erjavec, Katja Seme, Majda Golob, Irena Zdovc, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), otitis externa, cat, whole-genome sequencing (WGS), mixed hemolysis, genetics, microbiology Celotno besedilo (datoteka, 260,03 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
10. Staphylococcus pseudintermedius septicemia in puppies after elective cesarean sectionMaja Zakošek, Tanja Švara, Irena Zdovc, Bojan Papić, Jana Avberšek, Darja Kušar, Janko Mrkun, 2019, izvirni znanstveni članek Ključne besede: staphylococcal infections, whole genome sequencing, milk, dogs Celotno besedilo (datoteka, 1,24 MB) |