1. Discovery of immunoproteasome inhibitors using large-scale covalent virtual screeningAndrea Scarpino, Dávid Bajusz, Matic Proj, Martina Gobec, Izidor Sosič, Stanislav Gobec, György G. Ferenczy, György Keserü M., 2019, izvirni znanstveni članek Ključne besede: immunoproteasome, covalent inhibitor, virtual screening, β5i selective inhibitor Celotno besedilo (datoteka, 3,77 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
2. Discovery of novel Hsp90 C-terminal inhibitors using 3D-pharmacophores derived from molecular dynamics simulationsTihomir Tomašič, Martina Durcik, Bradley M. Keegan, Darja Gramec, Živa Zajec, Brian S. J. Blagg, Sharon D. Bryant, 2020, izvirni znanstveni članek Ključne besede: allosteric, cancer, Hsp90, inhibitor, molecular dynamics, pharmacophores, virtual screening Celotno besedilo (datoteka, 7,84 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
3. 3D pharmacophore-based discovery of novel Kv10.1 inhibitors with antiproliferative activityŽan Toplak, Louise Antonia Hendrickx, Špela Gubič, Štefan Možina, Bojana Žegura, Alja Štern, Matjaž Novak, Xiaoyi Shi, Steve Peigneur, Jan Tytgat, Tihomir Tomašič, Luis A. Pardo, Lucija Peterlin-Mašič, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: K$_V$10.1, ion channels, hERG, pharmacophore modelling, virtual screening, antiproliferative activity Celotno besedilo (datoteka, 14,79 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
4. Prioritisation of compounds for 3CL$^{pro}$ inhibitor development on SARS-CoV-2 variantsMarko Jukič, Blaž Škrlj, Gašper Tomšič, Sebastian Pleško, Črtomir Podlipnik, Urban Bren, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: COVID-19, SARS-CoV-2, free-energy calculations, in silico drug design, virtual screening, inhibitors, 3C-like protease, M$^{pro}$, 3CL$^{pro}$, high-throughput, chemical library design, machine learning, compound prioritisation Celotno besedilo (datoteka, 6,56 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
5. Discovery of a new drug-like series of OGT inhibitors by virtual screeningElena Maria Loi, Tihomir Tomašič, Cyril Balsollier, Kevin van Eekelen, Matjaž Weiss, Martina Gobec, Matthew G Alteen, David J. Vocadlo, Roland J. Pieters, Marko Anderluh, 2022, izvirni znanstveni članek Ključne besede: O-GlcNAc transferase, OGT inhibitors, virtual screening, pharmaceutical chemistry Celotno besedilo (datoteka, 10,66 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
6. In silico discovery and optimisation of a novel structural class of Hsp90 C-terminal domain inhibitorsŽiva Zajec, Jaka Dernovšek, Martina Gobec, Tihomir Tomašič, 2022, izvirni znanstveni članek Ključne besede: allosteric, cancer, heat shock, Hsp90, inhibitor, virtual screening Celotno besedilo (datoteka, 7,89 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
7. Novel scaffolds for modulation of NOD2 identified by pharmacophore-based virtual screeningSamo Guzelj, Tihomir Tomašič, Žiga Jakopin, 2022, izvirni znanstveni članek Ključne besede: antagonist, homology modeling, NOD2, Nucleotide-binding oligomerization, pharmacophore modeling, virtual screening Celotno besedilo (datoteka, 24,71 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
8. Strukturno podprto načrtovanje, sinteza in biološko vrednotenje novih zaviralcev O-β-N-acetilglukozaminil transferazeElena Maria Loi, 2023, doktorsko delo/naloga Ključne besede: O-GlcNAcylation, OGT, OGA, OGT inhibitors, posttranslational modifications, computational drug design, virtual screening, ester hydrolysis, metabolic stability. Celotno besedilo (datoteka, 20,68 MB) |
9. Strukturno podprto načrtovanje, sinteza in biološko vrednotenje novih zaviralcev O-β-N-acetilglukozaminil transferazeElena Maria Loi, 2023, doktorska disertacija Ključne besede: O-GlcNAcylation, OGT, OGA, OGT inhibitors, posttranslational, modifications, computational drug design, virtual screening, ester hydrolysis, metabolic stability Celotno besedilo (datoteka, 20,68 MB) |
10. A set of experimentally validated decoys for the human CC chemokine receptor 7 (CCR7) obtained by virtual screeningMatic Proj, Steven De Jonghe, Tom Van Loy, Marko Jukič, Anže Meden, Luka Ciber, Črtomir Podlipnik, Uroš Grošelj, Janez Konc, Dominique Schols, Stanislav Gobec, 2022, izvirni znanstveni članek Ključne besede: virtual screening, decoys, chemical library, computer-aided drug design, CCR7, GPCR Celotno besedilo (datoteka, 2,30 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |