21. Computational framework for high-quality production and large-scale evolutionary analysis of metagenome assembled genomesBoštjan Murovec, Leon Deutsch, Blaž Stres, 2020, kratki znanstveni prispevek Ključne besede: metagenomics, evolutionary analyses, microbial draft genomes, species boundaries, FastANI, genome assembly and binning Celotno besedilo (datoteka, 2,26 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
22. Identification of novel reassortant mammalian orthoreoviruses from bats in SloveniaTina Mikuletič, Danijela Černe, Peter Hostnik, Nataša Toplak, Simon Koren, Urška Kuhar, Urška Jamnikar Ciglenečki, Denis Kutnjak, Andrej Steyer, 2018, izvirni znanstveni članek Ključne besede: bats, genome reassortment, mammalian orthoreovirus, whole genome sequencing Celotno besedilo (datoteka, 933,36 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
23. Coding of glioblastoma progression and therapy resistance through long noncoding RNAsAlja Zottel, Neja Šamec, Alja Videtič Paska, Ivana Jovchevska, 2020, pregledni znanstveni članek Ključne besede: glioblastoma, brain cancer, noncoding genome, biomarker, prognosis Celotno besedilo (datoteka, 1,40 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
24. The integrative knowledge base for miRNA-mRNA expression in colorectal cancerDaša Jevšinek Skok, Nina Hauptman, Emanuela Boštjančič, Nina Zidar, 2019, izvirni znanstveni članek Ključne besede: web aplication, RNA expression, colorectal cancer, gene expression, knowledge base, cancer genome atlas, miRNA, mRNA, gene correlation, target genes Celotno besedilo (datoteka, 1,72 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
25. New insights into the evolutionary and genomic landscape of molluscum contagiosum virus (MCV) based on nine MCV1 and six MCV2 complete genome sequencesTomaž Mark Zorec, Denis Kutnjak, Lea Hošnjak, Blanka Kušar, Katarina Trčko, Boštjan Kocjan, Yu Li, Miljenko Križmarić, Jovan Miljković, Maja Ravnikar, Mario Poljak, 2018, izvirni znanstveni članek Ključne besede: molluscum contagiosum virus, complete genome, recombination, immune evasion, evolution, genetic landscape Celotno besedilo (datoteka, 3,38 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
26. Analysis of the global population structure of Paenibacillus larvae and outbreak investigation of American foulbrood using a stable wgMLST schemeBojan Papić, Margo Diricks, Darja Kušar, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Paenibacillus larvae, American foulbrood, whole-genome sequencing, whole-genome multilocus sequence typing, core-genome multilocus sequence typing, whole-genome single nucleotide polymorphism, genotype, molecular sequence Celotno besedilo (datoteka, 2,30 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
27. Feline otitis externa caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus with mixed hemolytic phenotype and overview of possible genetic backgroundsJana Avberšek, Bojan Papić, Darja Kušar, Vladimira Erjavec, Katja Seme, Majda Golob, Irena Zdovc, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), otitis externa, cat, whole-genome sequencing (WGS), mixed hemolysis, genetics, microbiology Celotno besedilo (datoteka, 260,03 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
28. Identification of a novel papillomavirus type (MfoiPV1) associated with acrochordon in a stone marten (Martes foina)Urška Kuhar, Diana Žele-Vengušt, Urška Jamnikar Ciglenečki, Gorazd Vengušt, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: papillomavirus, Dyonupapillomavirus, stone marten, Martes foina, NGS, MfoiPV1, Papillomaviridae, genome, viral Celotno besedilo (datoteka, 1,20 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |
29. Genomic insights into Salmonella Choleraesuis var. Kunzendorf outbreak reveal possible interspecies transmissionBojan Papić, Darja Kušar, Jasna Mićunović, Špela Vidrih, Mateja Pirš, Matjaž Ocepek, Jana Avberšek, 2021, izvirni znanstveni članek Ključne besede: Salmonella Choleraesuis, whole-genome sequencing, domestic pig, wild boar, outbreak investigation Celotno besedilo (datoteka, 855,26 KB) Gradivo ima več datotek! Več... |
30. HIV-1 unique recombinant forms identified in Slovenia and their characterization by near full-length genome sequencingMaja M. Lunar, Jana Mlakar, Tomaž Mark Zorec, Mario Poljak, 2020, izvirni znanstveni članek Ključne besede: molecular epidemiology, HIV-1, subtype, unique recombinant form, near full-length genome, next-generation sequencing, surveillance Celotno besedilo (datoteka, 2,65 MB) Gradivo ima več datotek! Več... |