izpis_h1_title_alt

Priprava lentivirusnih vektorjev za regulacijo izražanja circRNA v celičnih linijah
ID Matić, Iva (Avtor), ID Režen, Tadeja (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,48 MB)
MD5: 200F897D832B72DF876E0AC43C154B2E

Izvleček
Krožne RNA uravnavajo številne procese v celicah in sodelujejo pri razvoju bolezni. Mnoge imajo spremenjeno izražanje v rakavih celicah in njihovo vlogo v razvoju raka, zlasti hepatocelularnega karcinoma (HCC), preučujemo v celičnih modelih. Namen diplomske naloge je bil priprava lentivirusnih vektorjev za prekomerno in utišano izražanje krožnih RNA. Kot kandidata za kloniranje vektorjev smo izbrali eksosomski krožni RNA hsa_circ_0001861 in hsa_circ_0070039, ki sta v raku jeter znižani. Utišanega izražanja nismo mogli določati, saj smo ugotovili, da se siRNA vežejo tudi na druge tarčne mRNA. Posledično bi bili zaradi prevelike nespecifičnosti utišani tudi drugi geni. Z metodami molekulskega kloniranja kot so PCR pomnoževanje, restrikcija, ligacija in transformacija, nam je uspelo vstaviti željeno zaporedje hsa_circ_0001861 v plazmidni vektor pRRcirc, kar smo tudi dokazali z določanjem nukleotidnega zaporedja z metodo po Sangerju. Ker imajo circRNA zelo kratko zaporedje, ki je specifično le za njih, je njihova detekcija, pomnoževanje in utišanje pogosto omejeno, kar onemogoča raziskave njihove funkcije v celičnih linijah.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:krožne RNA, rak jeter, hsa_circ_0001861, hsa_circ_0070039
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:2022
PID:20.500.12556/RUL-139729 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:126640899 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:06.09.2022
Število ogledov:616
Število prenosov:33
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Preparation of lentiviral vectors for regulation of circRNA expression in cell lines
Izvleček:
Circular RNAs regulate many processes in cells and participate in the development of diseases. Many have altered expression in cancer cells and their role in cancer development, especially hepatocellular carcinoma (HCC), is studied in cell models. The aim of the work was the preparation of lentiviral vectors for the overexpression and silenced expression of circular RNAs. As candidates for vector cloning, we selected exosomal circular RNAs hsa_circ_0001861 and hsa_circ_0070039, which are downregulated in liver cancer. We could not determine silenced expression, as we found that siRNAs also bind to other target mRNAs. As a result, other genes would also be silenced due to excessive non-specificity. Using molecular cloning methods such as PCR amplification, restriction, ligation and transformation, we managed to insert the desired sequence hsa_circ_0001861 into the plasmid vector pRRcirc, which we also proved by determining the nucleotide sequence by Sanger method. Because circRNAs have a very short sequence specific to them, their detection, amplification and silencing are often limited, which makes research of their function in cell lines impossible.

Ključne besede:circular RNA, liver cancer, hsa_circ_0001861, hsa_circ_0070039

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj