Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (2)

1. Katja Gorenc: Opis mobilnih genetskih elementov in odpornosti proti monenzinu pri bakterijah iz rodov Prevotella in Bacteroides
2. Luka Lipoglavšek: Molekularno biološki opis sestave bakterijskega dela mikrobne združbe tal Visoke Himalaje v območju ledenika Kanchenjunga in vpliv dejavnikov okolja na njeno sestavo

Magistrska dela (8)

1. Robert Šket: Molekularno odkrivanje bakterije Fusobacterium nucleatum v biopsijskih vzorcih pacientov s kolorektalnim rakom
2. Mojca Sekirnik: Analiza mikrobiote cvetnega prahu skladiščenega v satnih celicah v panjih kranjske čebele (Apis mellifera carnica Pollman)
3. Urša Košir: Kvantifikacija črevesnih bakterijskih skupin iz biopsijskih vzorcev pacientov s kolorektalnim rakom z verižno reakcijo s polimerazo
4. Daša Medvešček: Vnos terapevtskega plazmida pORF-hIL-12 v izbrane vrste enterobakterij
5. Sanda Kavčič: Molekulska raznolikost izolatov fitoplazme, povzročiteljice počrnelosti lesa
6. Katarina Benulič: Genotipizacija Borrelia burgdorferi sensu lato z uporabo metode tipizacije na osnovi multilokusnih zaporedij
7. Patrik Sevšek: Optimizacija pogojev sestavljanja in razstavljanja virusom podobnih delcev
8. Niko Redenšek: Vpliv taninov in eteričnih olj na in vitro fermentabilnost suhe snovi in metanogenezo pri prežvekovalcih

Diplomska dela (31)

1. Vesna Šentjurc: Vpliv kondenziranih in hidrolizirajočih taninov na metanogeno aktivnost in mikrobno biosintezo v vampu
2. Maša Borštnar Vasle: Primerjalna analiza fekalne mikrobiote črnega močerila (Proteus anguinus parkelj) in mehiškega aksolotla (Ambystoma mexicanum) z molekularno biološkimi metodami
3. Janja Dobravc: Molekularno taksonomska opredelitev novih mikoplazem iz živalskega prebavnega trakta
4. Nejc Stopnišek: Nitrifikacija v kislih šotnih tleh Ljubljanskega barja
5. Simona Gramc: Opis mikrobne združbe iz vsebine prebavnega trakta in iztrebkov močerila (Proteus anguinus) z molekularnimi metodami
6. Mira Polajnar: Symbiotic and phylogenetic characterization of rhizobia that nodulate the novel species of Lupinus (L. mariae-josephi)
7. Tadeja Lukežič: Fenotipska karakterizacija sevov Bacillus subtilis, izoliranih iz talnega mikrookolja
8. Maja Gorišek: Vpliv nonilfenola na strukturo mikrobne združbe v reaktorju s pritrjeno biomaso
9. Jana Pižmoht: Analiza strukture mikrobne združbe sedimentov v priobalnem sladkovodnem izviru Izola 32
10. Maruša Hafner Česen: Živost bakterijske kulture Escherichia coli med proizvodnjo izbranih beljakovin
11. Diana Draksler: Vpliv gojišča na sestavo dolgoverižnih maščobnih kislin in maščobnih aldehidov pri vampnih bakterijah iz vrst Butyrivibrio fibrisolvens in Pseudobutyrivibrio xylanivorans
12. Petra Zeme: Vpliv farmakoloških učinkovin na strukturo nitrifikacijske združbe v aktivnem blatu
13. Barbara Blažič: Razvoj genetskih orodij za pripravo metagenomskih knjižnic industrijsko pomembnih encimov
14. Miha Bordon: Ocena uporabnosti metod za molekularno tipizacijo mikrobnih združb iz prebavnega trakta pitovnih piščancev
15. Martina Modic: Vpliv taninskega pripravka Farmatan na rast in encimske aktivnosti bakterij Butyrivibrio fibrisolvens in Clostridium proteoclasticum
16. Levin Pal: Aktivnost in struktura denitrifikatorjev v tleh Ljubljanskega barja
17. Lara Resman: Vpliv dejavnikov okolja na dinamiko nitrifikatorjev in na emisije toplogrednih plinov v mikrokozmih tal Ljubljanskega barja
18. Tina Zakotnik: Sestava in aktivnost bakterijskih mikrobnih združb v sedimentih Postojnske jame starih do 700.000 let
19. Matej Malneršič: Vpliv cinamaldehida in monenzina na rast izbranih vampnih bakterij
20. Jerica Mraz: Odkrivanje doslej še neopisanih klamidij v živalskih gostiteljih
21. Marko Bajc: Odkrivanje doslej še neopisanih bakterij iz reda Chlamydiales v nevretenčarskih gostiteljih
22. Nina Klemenčič: Fenotipska in genotipska opredelitev bakterijskih izolatov iz morskih in sladkovodnih sedimentov
23. Nika Zajec: Vpliv okoljskih dejavnikov na aktivnost in pestrost mikrobne združbe v barjanskih tleh
24. Leonida Balažic: Kvalitativno in kvantitativno določanje virusa pahljačavosti listov vinske trte (GFLV) z metodo PCR v realnem času
25. Peter Zajc: Vpliv evgenola na nekatere fenotipske značilnosti izbranih bakterijskih sevov iz vampa
26. Ada Varga: Analiza vpliva rastlinskih izvlečkov na izbrane vampne bakterije
27. Barbara Šober: Vpliv nanodelcev TiO2[spodaj] in Al2[spodaj]O3[spodaj] na sestavo membranskih maščobnih kislin in aldehidov pri bakteriji Ruminococcus flavefaciens
28. Igor Horvat: Vpliv dodatka odpadnega pivovarskega kvasa na proizvodnjo bioplina z granuliranim muljem iz UASB bioreaktorja
29. Renata Kocbek: Vpliv ionofornega antibiotika monenzina na nekatere fenotipske značilnosti izbranih bakterijskih sevov iz vampa
30. Jana Mankoč: Vpliv izvlečka cimeta na vampne bakterije goveda
31. Jana Mislej: Vpliv česnovega izvlečka dialil sulfida na rast izbranih bakterijskih sevov iz vampa ter tvorbo kratkoverižnih maščobnih kislin in plinov

Druga dela (10)

1. Tanja Kunej, Simon Horvat, Janez Salobir, Blaž Stres, Špela Mikec, Tomaž Accetto, Gorazd Avguštin, Bojana Bogovič Matijašić, Angela Cividini, Andreja Čanžek Majhenič, Marko Čepon, Leon Deutsch, Ida Djurdjevič, Emil Erjavec, Gregor Gorjanc, Antonija Holcman, Dušanka Jordan, Luka Juvančič, Stane Kavčič, Ajda Kermauner, Marija Klopčič, Tina Kocjančič, Milena Kovač, Aleš Kuhar, Andrej Lavrenčič, Jakob Leskovec, Alenka Levart, Špela Malovrh, Romana Marinšek-Logar, Petra Mohar Lorbeg, Mojca Narat, Tanja Obermajer, Diana Paveljšek, Tatjana Pirman, Klemen Potočnik, Ilona Rac, Vida Rezar, Irena Rogelj, Mojca Simčič, Aleš Snoj, Simona Sušnik Bajec, Tanja Šumrada, Dušan Terčič, Primož Treven, Maša Vodovnik, Manja Zupan Šemrov, Jaka Žgajnar, Silvester Žgur, Peter Dovč: How can we advance integrative biology research in animal science in 21st century?
2. Vesna Jerman, Gorazd Avguštin: Prebavna mikrobiota kot dejavnik pri razvoju debelosti
3. Nika Zajec, Blaž Stres, Gorazd Avguštin: Distinct approaches for the detection and removal of chimeric 16S rRNA sequences can significantly affect the outcome of between-site comparisons
4. Tomaž Accetto, Gorazd Avguštin: Inability of Prevotella bryantii to form a functional Shine-Dalgarno interaction reflects unique evolution of ribosome binding sites in Bacteroidetes
5. Katja Gorenc, Tomaž Accetto, Gorazd Avguštin: Bioinformatic evidence and characterization of novel putative large conjugative transposons residing in genomes of genera Bacteroides and Prevotella
6. Darja Kušar, Gorazd Avguštin: Optimization of the DGGE band identification method
7. Jerneja Ambrožič, Darja Žgur-Bertok, Rok Kostanjšek, Gorazd Avguštin: Isolation and characterization of a novel violacein-like pigment producing psychrotrophic bacterial species Janthinobacterium svalbardensis sp. nov
8. Darja Kušar, Gorazd Avguštin: Molecular profiling and identification of methanogenic archaeal species from rabbit caecum
9. Gregor Gorenc, Tomaž Accetto, Gorazd Avguštin: The search for conjugative transposon in rumen bacterium Prevotella bryantii B[down]14
10. Ana Erman, Marija Ignjatović, Katja Leskovšek, Simona Miceska, Urša Lampreht Tratar, Maša Omerzel, Veronika Kloboves-Prevodnik, Maja Čemažar, Lidija Kandolf Sekulović, Gorazd Avguštin, Janja Ocvirk, Tanja Mesti: The prognostic and predictive value of human gastrointestinal microbiome and exosomal mRNA expression of PD-L1 and IFNγ for immune checkpoint inhibitors response in metastatic melanoma patients