Bibliografija osebe. Seznam zajema vsa gradiva in ne le tista, kje je oseba mentor.

Doktorska dela (1)

1. Miloš Vittori: Zgradba sekrecijskih epitelijev in mineralizacija zunajceličnega matriksa med levitvijo podzemeljskih in površinskih mokric (Crustacea: Isopoda)

Magistrska dela (16)

1. Patricia Vollmeier: Znotrajcelično razmnoževanje bakterije legionele v humanih monocitih
2. Monika Savarin: Optimizacija in validacija metode za barvanje krvnih žil v mišjih tumorskih modelih
3. Mateja Vidic: Vpliv okužbe s HPV na odzivnost celičnih kultur ploščatoceličnega karcinoma ustnega žrela na radioterapijo in kemoterapijo
4. Lado Otrin: Vpliv izbranih magnetnih nanodelcev na morfologijo eritrocitov
5. Tinkara Pirc Marolt: Znotrajcelična okužba z bakterijo Rhabdochlamydia porcellionis v tkivih raka Porcellio scaber
6. Maja Četojevič: Transport membranskih proteinov uroplakinov v rakavih in normalnih urotelijskih celicah
7. Eva Kocjan: Proliferacija limfocitov za diagnostiko kongenitalne toksoplazmoze
8. Vesna Makovšek: Izražanje površinskega antigena CD20 pri bolnikih s folikularnim limfomom
9. Katja Zeme: Optimizacija kliničnega protokola gojenja dendritičnih celic za izdelavo protitumorskih cepiv
10. Eva Blatnik: Učinek ekstrakta ognjiča na kokošje makrofage in vitro
11. Nina Erbida: Populacijska dinamika koščičnega škratca (Coenagrion ornatum) na izbrani lokaciji na Ljubljanskem barju
12. Tadej Fevžer: Proizvodnja dendritičnih celic z visoko sposobnostjo izločanja citokina IL-12p70 v brezserumskih gojiščih
13. Tjaša Fideršek: Vpliv različnih vrst centralnih venskih katetrov na poškodbe krvnih celic
14. Katja Hrovat: Vpliv utišanja helikaze RECQ1 na proliferacijo glioblastomskih celic v cebricah
15. Žan Kuralt: Bioklimatski model potencialne razširjenosti črne vdove (Latrodectus tredecimguttatus)
16. Tjaša Plaper: Stimulacija inflamasoma NAIP/NLRC4 s flagelinom divjega tipa ter flagelinskimi mutantami

Diplomska dela (22)

1. Martina Ploj: Pojavljanje klopov (Acarina: Ixodidae) in njihov razvoj v Prekmurju (Lendavsko Dolinsko)
2. Aleš Špes: Vpliv nanodelcev titanovega dioksida na mitohodrije
3. Tilen Travnik: Enostavna preparativna izolacija intaktnih mitohondrijev kvasovke Saccharomyces cerevisiae
4. Jerica Mraz: Odkrivanje doslej še neopisanih klamidij v živalskih gostiteljih
5. Marko Bajc: Odkrivanje doslej še neopisanih bakterij iz reda Chlamydiales v nevretenčarskih gostiteljih
6. Martina Ploj: Pojavljanje klopov (Acarina: Ixodidae) in njihov razvoj v Prekmurju (Lendavsko Dolinsko)
7. Urška Budja: Primerjava ocen vrstne pestrosti pajkov (Arachnida: Araneae) v treh gozdovih v Sloveniji
8. Matjaž Gregorič: Medvrstne razlike v arhitekturi mrež pajkov iz rodu Zygiella (Araneae: Araneidae): vedenjski pristop k taksonomskim problemom
9. Teodora Majer: Pojavljanje klopov (Acarina: Ixodidae) in njihov razvoj v gnezdih breguljke (Riparia riparia)
10. Katja Kalan: Razširjenost in sezonska aktivnost tigrastega komarja (Aedes albopictus) v priobalnem delu Slovenije
11. Ida Djurdjevič: Spremljanje diferenciacije celic linije Calu-3 z vrstičnim elektronskim mikroskopom
12. Klara Hercog: Poletna zatočišča malega podkovnjaka Rhinolophus hipposideros (Bechstein, 1800) v objektih kulturne dediščine v osrednji Sloveniji
13. Maja Kjuder: Vpliv izgradnje vodnega zbiralnika na območju spodnjega dela doline potoka Drtijščica na favno dnevnih metuljev
14. Lea Likozar: Ekologija porodniške skupine brkatega netopirja v cerkvi sv. Jošt nad Kranjem
15. Alenka Gorjan: Pestrost talnih pajkov v okolici Solkana
16. Urška Pišek: Izvor mikroveziklov pri s heparinom povzročeni trombocitopeniji
17. Erika Rus: Razvoj metode za vrednotenje celic Caco - 2 na modelu črevesnega epitelija z vrstičnim elektronskim mikroskopom
18. Tanja Benko: Vpliv zaraščanja južnega dela Krasa na vrstno pestrost dnevnih metuljev (Lepidoptera: Rhopalocera)
19. Ana Celestina: Vpliv umetne osvetlitve na pojavnost pajkov v urbanem okolju
20. Bia Rakar: Populacijska struktura in varstvo barjanskega okarčka (Coenonympha oedippus) v dolini reke Dragonje
21. Jerca Starc: Spektralne značilnosti in stopnja linearne polarizacije svetlobe, zrcalno odbite z živalskega krzna
22. Nataša Šolar: Primerjava pigmentiranosti jeter hranjenih in nehranjenih osebkov močerila (Proteus anguinus)

Druga dela (35)

1. Rok Kostanjšek, Alenka Gorjan: A contribution to the Slovenian spider fauna - II
2. Mojca Krajnc, Polonca Štefanič, Rok Kostanjšek, Ines Mandić-Mulec, Iztok Dogša, David Stopar: Systems view of Bacillus subtilis pellicle development
3. Rok Kostanjšek, Lejla Pašić, Holger Daims, Boris Sket: Structure and community composition of sprout-like bacterial aggregates in a Dinaric Karst subterranean stream
4. Maša Vodovnik, Rok Kostanjšek, Maša Zorec, Romana Marinšek-Logar: Exposure to Al[sub]2O[sub]3 nanoparticles changes the fatty acid profile of the anaerobe Ruminococcus flavefaciens
5. Urška Budja: Primerjava ocen vrstne pestrosti pajkov (Arachnida: Araneae) v trh gozdovih v Sloveniji
6. Matjaž Gregorič: Medvrstne razlike v arhitekturi mrež pajkov iz rodu Zygiella (Araneae: Araneidae): vedenjski pristop k taksonomskim problemom
7. Rok Kostanjšek, Maša Milatovič, Jasna Štrus: Endogenous origin of endo-ß-1,4-glucanase in common woodlouse Porcellio scaber (Crustacea, Isopoda)
8. Miloš Vittori, Rok Kostanjšek, Nada Žnidaršič, Jasna Štrus: Molting and cuticle deposition in the subterranean trichoniscid Titanethes albus (Crustacea, Isopoda)
9. Miloš Vittori, Rok Kostanjšek, Nada Žnidaršič, Kristina Žagar, Miran Čeh, Jasna Štrus: Calcium bodies of Titanethes albus (Crustacea: Isopoda)
10. Žiga Pandur, Matevž Dular, Rok Kostanjšek, David Stopar: Bacterial cell wall material properties determine E. coli resistance to sonolysis
11. Katja Kalan, Rok Kostanjšek, Enrich Merdić, Tomi Trilar: A survey of Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) distribution in Slovenia in 2007 and 2010
12. Rok Kostanjšek: A contribution to the Slovenian spider fauna
13. Rok Kostanjšek, Ana Celestina: New records on synanthropic spider species (Arachnida: Araneae) in Slovenia
14. Eva Kočar, Tea Lenarčič, Vesna Hodnik, Anastasija Panevska, Yunjie Huang, Gregor Bajc, Rok Kostanjšek, Anjaparavanda P. Naren, Peter Maček, Gregor Anderluh, Kristina Sepčić, Marjetka Podobnik, Matej Butala: Crystal structure of RahU, an aegerolysin protein from the human pathogen Pseudomonas aeruginosa, and its interaction with membrane ceramide phosphorylethanolamine
15. Polonca Štefanič, Katarina Belcijan, Barbara Kraigher, Rok Kostanjšek, Joseph Nesme, Jonas Stenløkke Madsen, Jasna Kovač, Søren Johannes Sørensen, Michiel Vos, Ines Mandić-Mulec: Kin discrimination promotes horizontal gene transfer between unrelated strains in Bacillus subtilis
16. Matej Milijaš Jotić, Anastasija Panevska, Ioan Iacovache, Rok Kostanjšek, Martina Mravinec, Matej Skočaj, Benoît Zuber, Ana Pavšič, Jaka Razinger, Špela Modic, Francesco Trenti, Graziano Guella, Kristina Sepčić: Dissecting out the molecular mechanism of insecticidal activity of ostreolysin A6/pleurotolysin B complexes on western corn rootworm
17. Rok Kostanjšek, Lucija Ramšak: Psilochorus simoni (Berland, 1911) (Araneae, Pholcidae), a new record for Slovenian fauna from Postonjska jama cave
18. Rok Kostanjšek, Jeremy Miller: New records of sheet web spiders from Slovenia (Arachnida: Araneae: Linyphiidae)
19. Rok Kostanjšek: A contribution to the knowledge of the spider fauna of the wider Haloze region (northeast Slovenia)
20. Valentina Turk, Ana Fortič, Maja Kos Kramar, Magda Tušek-Žnidarič, Jasna Štrus, Rok Kostanjšek, Alenka Malej: Observations on the surface structure of Aurelia solida (Scyphozoa) polyps and medusae
21. Jan Otoničar, Maja Hostnik, Maja Grundner, Rok Kostanjšek, Tajda Gredar, Maja Garvas, Zoran Arsov, Zdravko Podlesek, Cene Gostinčar, Jernej Jakše, Steve J. W. Busby, Matej Butala: A method for targeting a specified segment of DNA to a bacterial microorganelle
22. Hans Recknagel, Luka Močivnik, Valerija Zakšek, Yonglun Luo, Rok Kostanjšek, Peter Trontelj: Generation of genome-wide SNP markers from minimally invasive sampling in endangered animals and applications in species ecology and conservation
23. Rok Kostanjšek, Matjaž Kuntner: Araneae Sloveniae
24. Rok Kostanjšek, Žan Kuralt, Nataša Sivec, Manca Velkavrh: Comparison of spider diversity in two temperate forests by a rapid survey and its potential in nature conservation studies
25. Jerneja Ambrožič, Darja Žgur-Bertok, Rok Kostanjšek, Gorazd Avguštin: Isolation and characterization of a novel violacein-like pigment producing psychrotrophic bacterial species Janthinobacterium svalbardensis sp. nov
26. Janez Valant, Damjana Drobne, Kristina Sepčić, Anita Jemec Kokalj, Ksenija Kogej, Rok Kostanjšek: Hazardous potential of manufactured nanoparticles identified by in vivo assay
27. Damjana Drobne, Marziale Milani, Vladka Lešer, Francesco Tatti, Alexis Zrimec, Nada Žnidaršič, Rok Kostanjšek, Jasna Štrus: Imaging of intarcellular spherical lamellar structures and tissue gross morphology by a focused ion beam/scanning electron microscope (FIB/SEM)
28. Miloš Vittori, Nada Žnidaršič, Rok Kostanjšek, Jasna Štrus: Microscopic anatomy of male tegumental glands and associated cuticular structures in Titanethes albus (Crustacea: Isopoda)
29. Teja Lavrin, Tilen Konte, Rok Kostanjšek, Simona Sitar, Kristina Sepčić, Sonja Prpar Mihevc, Ema Žagar, Vera Župunski, Metka Lenassi, Boris Rogelj, Nina Gunde-Cimerman: The neurotropic black yeast Exophiala dermatitidis induces neurocytotoxicity in neuroblastoma cells and progressive cell death
30. Yordanis Pérez-Llano, Eya Caridad Rodríguez-Pupo, Irina S. Druzhinina, Komal Chenthamara, Feng Cai, Nina Gunde-Cimerman, Polona Zalar, Cene Gostinčar, Rok Kostanjšek, Jorge Luis Folch-Mallol, Ramón Alberto Batista-García, María del Rayo Sánchez-Carbente: Stress reshapes the physiological response of halophile fungi to salinity
31. Igor Gruntar, Rok Kostanjšek, Tina Pirš, Bojan Papić: Helicobacter colisuis sp. nov., isolated from caecal contents of domestic pigs (Sus scrofa domesticus)
32. Iztok Dogša, Rok Kostanjšek, David Stopar: eDNA provides a scaffold for autoaggregation of B. subtilis in bacterioplankton suspension
33. Igor Gruntar, Rok Kostanjšek, Tina Pirš, Bojan Papić: Campylobacter magnus sp. nov., isolated from caecal contents of domestic pigs (Sus scrofa domesticus)
34. Arne Bratkič, Anže Jazbec, Nataša Toplak, Simon Koren, Sonja Lojen, Tinkara Tinta, Rok Kostanjšek, Luka Snoj: The colonization of an irradiated environment
35. Anja Pavlin, Anže Lovše, Gregor Bajc, Jan Otoničar, Amela Kujović, Živa Lengar, Ion Gutiérrez-Aguirre, Rok Kostanjšek, Janez Konc, Nadine Fornelos, Matej Butala: A small bacteriophage protein determines the hierarchy over co-residential jumbo phage in Bacillus thuringiensis serovar israelensis