izpis_h1_title_alt

Database independent automated structure elucidation of organic molecules based on IR, $^1$H NMR, $^{13}$C NMR, and MS data
ID Pesek, Matevž (Avtor), ID Juvan, Andraž (Avtor), ID Jakoš, Jure (Avtor), ID Košmrlj, Janez (Avtor), ID Marolt, Matija (Avtor), ID Gazvoda, Martin (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,59 MB)
MD5: 24DDADC078445852E273A5432CD35BDE
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.0c01332 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Herein, we report a computational algorithm that follows a spectroscopist-driven elucidation process of the structure of an organic molecule based on IR, $^1$H and $^{13}$C NMR, and MS tabular data. The algorithm is independent from database searching and is based on a bottom-up approach, building the molecular structure from small structural fragments visible in spectra. It employs an analytical combinatorial approach with a graph search technique to determine the connectivity of structural fragments that is based on the analysis of the NMR spectra, to connect the identified structural fragments into a molecular structure. After the process is completed, the interface lists the compound candidates, which are visualized by the WolframAlpha computational knowledge engine within the interface. The candidates are ranked according to the predefined rules for analyzing the spectral data. The developed elucidator has a user-friendly web interface and is publicly available (http://schmarnica. si).

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:algorithm, organic molecules, infrared spectroscopy, molecular structure, nuclear magnetic resonance spectroscopy, carbon, infrared light
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FRI - Fakulteta za računalništvo in informatiko
FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2021
Št. strani:Str. 756-763
Številčenje:Vol. 61, iss. 2
PID:20.500.12556/RUL-144696 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:547:544.1:004.65
ISSN pri članku:1549-9596
DOI:10.1021/acs.jcim.0c01332 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:49245187 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:08.03.2023
Število ogledov:650
Število prenosov:86
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:Journal of chemical information and modeling
Skrajšan naslov:J. chem. inf. mod.
Založnik:American Chemical Society
ISSN:1549-9596
COBISS.SI-ID:26533125 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:algoritem, organske molekule, infrardeča spektroskopija, molekulska struktura, jedrska magnetna resonanca, NMR

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0230
Naslov:Organska kemija: sinteza, struktura in aplikacija

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-8147
Naslov:Ligandi s tzNHC strukturo v organokovinski kemiji in homogeni katalizi: tvorba vezi C-C in C-N v vodi

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:J1-9166
Naslov:Redefinicija in razširitev uporabe Sonogashirove reakcije pripajanja brez bakra

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:L1-9191
Naslov:Prepovedane droge, alkohol in tobak: epidemiologija na osnovi odpadnih vod, uspešnost čiščenja in ranljivost vodnega sistema

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj