Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
A non-redundant dataset of inter-residue lysine-lysine solvent accessible surface distances in homo-oligomeric protein complexes
ID
Gaber, Aljaž
(
Avtor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(190,98 KB)
MD5: 99283A2E30FF4B33751F5730A438809F
URL - Izvorni URL, za dostop obiščite
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340919311898
Galerija slik
Izvleček
This article contains inter-residue solvent accessible surface distances between lysines in a comprehensive dataset homo-oligomeric protein complex structures, downloaded from 3D Complex database. Solvent Accessible Surface Distances were calculated with Jwalk algorithm. To avoid unnecessary redundancy due to symmetry, we calculated only distances originating from the first subunit of each protein complex. Redundancy was further reduced by including only the shortest of the two possible inter-subunit alternatives in the final non-redundant dataset. For each protein complexes we also calculated weight ob subunits, number of lysines radius of gyration and average distances. This data can be used for structural analyses of homo-oligomeric protein complexes and for further optimization of distance-based restraints, such as those based on data obtained from chemical cross-linking coupled with mass spectrometry.
Jezik:
Angleški jezik
Ključne besede:
chemical cross-linking
,
homo-oligomers
,
solvent accessible surface distances
Vrsta gradiva:
Članek v reviji
Tipologija:
1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:
FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Status publikacije:
Objavljeno
Različica publikacije:
Objavljena publikacija
Leto izida:
2020
Št. strani:
4 str.
Številčenje:
Vol. 28, art. 104834
PID:
20.500.12556/RUL-137730
UDK:
577.112
ISSN pri članku:
2352-3409
DOI:
10.1016/j.dib.2019.104834
COBISS.SI-ID:
1538451907
Datum objave v RUL:
29.06.2022
Število ogledov:
644
Število prenosov:
114
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
Kopiraj citat
Objavi na:
Gradivo je del revije
Naslov:
Data in brief
Založnik:
Elsevier
ISSN:
2352-3409
COBISS.SI-ID:
32117977
Licence
Licenca:
CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:
Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Sekundarni jezik
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
prečno povezovanje
,
homooligomeri
,
topilu dostopne razdalje na površini
Projekti
Financer:
ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:
J1-7119
Naslov:
Biologija EpCAM na strukturnem nivoju kot osnova za učinkovito tumorsko ciljanje
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Nazaj