izpis_h1_title_alt

Evaluation of firefly and Renilla luciferase inhibition in reporter-gene assays : a case of isoflavonoids
ID Kenda, Maša (Avtor), ID Vegelj, Jan (Avtor), ID Herlah, Barbara (Avtor), ID Perdih, Andrej (Avtor), ID Mladěnka, Přemysl (Avtor), ID Sollner Dolenc, Marija (Avtor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (1,98 MB)
MD5: 43760E4B3AB91AE4AF533690EFCB9E4A
URLURL - Izvorni URL, za dostop obiščite https://www.mdpi.com/1422-0067/22/13/6927 Povezava se odpre v novem oknu

Izvleček
Firefly luciferase is susceptible to inhibition and stabilization by compounds under investigation for biological activity and toxicity. This can lead to false-positive results in in vitro cell-based assays. However, firefly luciferase remains one of the most commonly used reporter genes. Here, we evaluated isoflavonoids for inhibition of firefly luciferase. These natural compounds are often studied using luciferase reporter-gene assays. We used a quantitative structure–activity relationship (QSAR) model to compare the results of in silico predictions with a newly developed in vitro assay that enables concomitant detection of inhibition of firefly and Renilla luciferases. The QSAR model predicted a moderate to high likelihood of firefly luciferase inhibition for all of the 11 isoflavonoids investigated, and the in vitro assays confirmed this for seven of them: daidzein, genistein, glycitein, prunetin, biochanin A, calycosin, and formononetin. In contrast, none of the 11 isoflavonoids inhibited Renilla luciferase. Molecular docking calculations indicated that isoflavonoids interact favorably with the D-luciferin binding pocket of firefly luciferase. These data demonstrate the importance of reporter-enzyme inhibition when studying the effects of such compounds and suggest that this in vitro assay can be used to exclude false-positives due to firefly or Renilla luciferase inhibition, and to thus define the most appropriate reporter gene.

Jezik:Angleški jezik
Ključne besede:isoflavonoids, firefly luciferase, Renilla luciferase, inhibition, quantitative structure–activity relationships, molecular docking, reporter-gene assay, OECD test guidelines, alternative methods
Vrsta gradiva:Članek v reviji
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:FFA - Fakulteta za farmacijo
Status publikacije:Objavljeno
Različica publikacije:Objavljena publikacija
Leto izida:2021
Št. strani:14 str.
Številčenje:Vol. 22, iss. 13, art. 6927
PID:20.500.12556/RUL-135754 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:547.972:615.4.:54
ISSN pri članku:1422-0067
DOI:10.3390/ijms22136927 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:72671747 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:30.03.2022
Število ogledov:983
Število prenosov:121
Metapodatki:XML RDF-CHPDL DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Gradivo je del revije

Naslov:International journal of molecular sciences
Skrajšan naslov:Int. j. mol. sci.
Založnik:MDPI
ISSN:1422-0067
COBISS.SI-ID:2779162 Povezava se odpre v novem oknu

Licence

Licenca:CC BY 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.sl
Opis:To je standardna licenca Creative Commons, ki daje uporabnikom največ možnosti za nadaljnjo uporabo dela, pri čemer morajo navesti avtorja.

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:izoflavonoidi, zaviralci, alternativne metode, molekularno mapiranje, farmacevtska kemija, flavonoidi

Projekti

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Program financ.:Young researchers

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0208
Naslov:Farmacevtska kemija: načrtovanje, sinteza in vrednotenje učinkovin

Financer:ARRS - Agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije
Številka projekta:P1-0012
Naslov:Molekulske simulacije, bioinformatika in načrtovanje zdravilnih učinkovin

Financer:EC - European Commission
Program financ.:ERDF
Številka projekta:CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000841
Akronim:EFSA-CDN

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj