Phylogeography of Savi’s pipistrelle based on mitochondrial DNA

Gojznikar, Jan (author), Trontelj, Peter (mentor), Mayer, Frieder (comentor)

Cryptic diversity is a well-known phenomenon in many species of Palaearctic bats that were impacted by Pleistocene glaciations. We employed four mitochondrial markers – ND1, CytB, COI and 16S rRNA – in order to summarise and expand the current knowledge on the phylogeography of one such species, the Savii’s pipistrelle (Hypsugo savii). Using pairwise genetic distances and tree reconstruction methods, we detected five major mitochondrial lineages and two unassigned samples. Three lineages found in the Western Palaearctic (along with outlying samples) correspond to clades detected by other researchers, while the lineages found in Central Asia are harder to link to previous studies and likely represent newly discovered cryptic lineages. Judging from both the phylogeographic pattern and divergence times, it is evident that H. savii was indeed impacted by glaciations of Pleistocene and survived in separate glacial refugia. The taxonomic status of the lineages is, however, still unclear, and requires further research, especially with additional screening and using nuclear DNA markers.

• Language: English
• Keywords: Hypsugo savii, phylogeographic analysis, mitochondrial lineages, cryptic diversity, evolutionary history, Pleistocene glaciations
• Work type: Master's thesis/paper
• Organization: BF - Biotechnical Faculty
• Year: 2021
• PID: 20.500.12556/RUL-129565
• COBISS.SI-ID: 76018947
• Publication date in RUL: 05.09.2021

Secondary language

• Language: Slovenian
• Title: Filogeografija Savijevega netopirja na podlagi mitohondrijske DNA

Abstract

Kriptična diverziteta je dobro poznan fenomen mnogih vrst netopirjev Palearktike, na katere so vplivale pleistocenske poledenitve. Z uporabo štirih mitohondrijskih markerjev – ND1, CytB, COI in 16s rRNK – smo želeli povzeti in nadgraditi vse do sedaj znane ugotovitve o filogeografiji Savijevega netopirja (Hypsugo savii), eni izmed takih vrst. Z metodo analize genetskih razdalj med sekvencami in rekonstrukcijo filogenetskih dreves smo zaznali 5 večjih mitohondrijskih linij in dva nerazvrščena vzorca. Tri linije, najdene v zahodni Palearktiki, skupaj z neuvrščenimi vzorci, ustrezajo kladom, ki so jih razkrile že prejšnje raziskave. Linije zaznane v osrednji Aziji je bilo težje povezati s preteklimi študijami in verjetno predstavljajo novo odkrite kriptične linije. Očitno je, da so na prednike današnje vrste H. savii vplivale pleistocenske poledenitve in da je vrsta preživela v ločenih ledeniških refugijih, sodeč tako po filogeografskem vzorcu kot po ocenjenem času divergence. Taksonomski status linij ostaja nerazrešen in je potreben dodatne revizije, še posebej z dodatnim vzorčenjem in uporabo markerjev jedrne DNA.

• Keywords: Savijev netopir, filogeografska analiza, mitohondrijske linije, kriptična diverziteta, evolucijska zgodovina, Pleistocenske poledenitve