izpis_h1_title_alt

Delecija genske skupine za biosintezo oksitetraciklina v bakteriji Streptomyces rimosus z metodo homologne rekombinacije
ID Rebek, Matej (Avtor), ID Petković, Hrvoje (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,85 MB)
MD5: 4026B5ED509EEA7C0699E2530BDAC688

Izvleček
Bakterija Streptomyces rimosus je ena izmed najbolje preučenih industrijskih streptomicet, ki proizvaja antibiotik oksitetraciklin (OTC). Zaradi visokega donosa OTC je sev S. rimosus atraktiven gostitelj za heterologno produkcijo naravnih učinkovin poliketidnega izvora. Namen te magistrske naloge je bil pridobiti sev S. rimosus z delecijo genske gruče za biosintezo oksitetraciklina. Delecijo smo izvedli z metodo homologne rekombinacije. Konstruirali smo temperaturno občutljiv plazmid, ki vsebuje vse elemente sistema homologne rekombinacije. Uporabili smo homologne sekvence različnih dolžin, ki so nalegale na začetek in konec otc genske gruče. Kolonije z ustrezno delecijo smo iskali z metodo subkultivacij in s precepljanjem kolonij na agarske plošče z in brez dodanega selekcijskega markerja (eritromicin). Pri pridobljenih mutantah, ki niso proizvajale OTC, smo delecijo potrdili na genetski ravni s PCR in s sekvenciranjem ter na metabolni ravni s tankoplastno kromatografijo (TLC) in s tekočinsko kromatografijo (LC).

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:aktinomicete, Streptomyces rimosus, tetraciklini, delecija GBG, homologna rekombinacija
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Kraj izida:Ljubljana
Založnik:[M. Rebek]
Leto izida:2021
PID:20.500.12556/RUL-127209 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:602.3:579.873.7:602.6:579.8:604.4:615.33:606:62(043.2)
COBISS.SI-ID:65331971 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:26.05.2021
Število ogledov:1139
Število prenosov:57
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Deletion of oxytetracycline gene cluster in Streptomyces rimosus with homologous recombination
Izvleček:
Streptomyces rimosus produces antibiotic oxytetracycline (OTC) and is one of the most intensively studied streptomyces species. High yields of oxytetracycline makes S. rimosus an attractive host for potential heterologous production of polyketide based secondary metabolites. The objective of this thesis was to obtain an S. rimosus strain with the deletion of otc gene cluster. The deletion was carried out with the method of homologous recombination. In order to complete deletion, we constructed a temperature sensitive plasmid vector with all the necessary elements to carry out homologous recombination experiment. Homologous sequences of different lengths were designed to anneal on both sides of otc gene cluster. To obtain potential mutants we used a method of subcultivation and patching on agar plates with and without added selection marker (erythromycin). Colonies which did not show any OTC production were tested with polymerase chain reaction (PCR), sequencing, thin layer chromatography (TLC) and high-pressure liquid chromatography (HPLC).

Ključne besede:actinomycetes, Streptomyces rimosus, tetracyclines, gene cluster deletion, homologous recombination

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj