Izražanje izbranih molekul mikro RNA v koži bolnikov z vaskulitisom povzročenim z IgA

Sedej, Ivana (author), Ravnik Glavač, Metka (mentor)

Vaskulitis povzročen z IgA (IgAV) je avtoimunska bolezen, v žilah se odlagajo imunoglobulini IgA. Gre za sistemsko vnetje, ki prizadene male krvne žile v koži, ledvicah in črevesju. Vzrok bolezni še ni odkrit. Nekodirajoče RNA, med katere sodijo mikro RNA (miRNA) so izredno pomemben dejavnik v uravnavanju izražanja genov na post-transkripcijskem nivoju. Spremembe v njihovem izražanju prispevajo k nastanku bolezni. Namen dela je bila analiza izražanja mikro RNA miR-17-5p, miR-21-3p, miR-21-5p in miR-451a v 64 vzorcih kože odraslih bolnikov z IgAV in 19 odraslih zdravih posameznikov. Raven izražanja izbranih miRNA smo merili s kvantitativnim PCR v realnem času in z relativno kvantifikacijo primerjali izmerjene ravni njihovega izražanja v posameznih vzorcih. Z Mann-Whitney U testom smo razlike opredelili kot statistično pomembne in preverili morebitne povezave s kliničnimi znaki in podatki patoloških analiz. Dokazali smo statistično značilno spremenjeno izražanje vseh štirih izbranih mikro RNA v koži bolnikov v primerjavi s kožo zdravih, od katerih je bila miR-21-3p najbolj izrazito prekomerno izražena. Zaradi statistično značilnega različnega izražanja ob primerjavi histopatološke infiltracije z granulociti, sklepamo o povezavi miR-17-5p z zagonom bolezni, na podlagi statistično pomembnih razlik pri bolnikih s klinično opredeljeno nekrozo kože ter gastrointestinalno okvaro, pa sklepamo na povezavo mir-21-3p s hujšo obliko bolezni, ki jo lahko zaznamujeta kroničen potek in izrazitejša prizadetost organov.

• Language: Slovenian
• Keywords: molekularna biologija, mikro RNA, miR-17-5p, miR-21-3p, miR-21-5p, miR-451a, IgAV
• Work type: Master's thesis/paper
• Organization: BF - Biotechnical Faculty
• Year: 2018
• PID: 20.500.12556/RUL-102957
• Publication date in RUL: 12.09.2018

Secondary language

• Language: English
• Title: Differential expression of selected microRNA molecules in affected skin of patients with IgA vasculitis

Abstract

IgA vasculitis (IgAV) is an autoimmune disease, characterized by IgA antibody deposits in vessel walls. It is defined as a systemic inflammation of small vessels found in skin, kidney and gastrointestinal tract . The cause of IgAV is yet to be revealed. Noncoding RNAs, micro RNAs specifically, play a crucial role in post-transcriptional regulation of gene expression. Therefore, a shift in their own expression promotes disease onset. The objective of our study was to analyse differential expression of micro RNAs miR-17-5p, miR-21-3p, miR-21-5p and miR-451a in affected skin of 64 IgAV patients and 19 healthy individuals. Using the quantitative real-time PCR method and relative quantification along with Mann-Whitney U test, we determined statistically significant differential expression of all four micro RNAs, with miR-21-3p being the most prominently up-regulated in IgAV patients. When correlating our figures with IgAV patients clinical data and parameters of pathological analysis, we found statistical significance of miR-17-5p expression in level of granulocyte infiltration and statistical significance of miR-21-3p expression in relation to skin necrosis and gastrointestinal tract involvement. Accordingly, we infer role of miR-17-5p in the earliest stages of IgAV, while miR-21-3p could be associated with chronic condition.

• Keywords: molecular biology, micro RNA, miR-17-5p, miR-21-3p, miR-21-5p, miR-451a, IgAV